Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04834
• Subject: XM_017000316.1
• Aligned Length: 1011
• Identities: 914
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGAGACTATGCGAGCGCAGCGGCTGCAGCCTGGTGTGGGCACCAGCGGGAGGGGCACTCTCCGAGCGCTGCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGACTATGCGAGCGCAGCGGCTGCAGCCTGGTGTGGGCACCAGCGGGAGGGGCACTCTCCGAGCGCTGCG  74

Query   75  GCCCGGAGTGACTGGGGCCGCGGCTGCCACCGCCACACCCCCTGCGGGCCCCCCGCCTGCCCCGCCGCCTCCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCGGAGTGACTGGGGCCGCGGCCGCCACCGCCACACCCCCTGCGGGCCCCCCGCCTGCCCCGCCGCCTCCCG  148

Query  149  CACCGCCCCCGCCGCCGCTGCTCCTGTCTGGGGCCCCAGGACTACCCCTGCCCCCCGGCGCCGCCGGCAGCCCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACCGCCCCCGCCGCCGCTGCTCCTGTCTGGGGCCCCAGGACTACCCCTGCCCCCCGGCGCCGCCGGCAGCCCG  222

Query  223  GCAGTGCTGCGAGAGGCCGTGGAGGCCGTGGTGAGGAGCTTCGCCAAGCACACGCAGGGCTATGGCCGAGTGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGTGCTGCGAGAGGCCGTGGAGGCCGTGGTGAGGAGCTTCGCCAAGCACACGCAGGGCTATGGCCGAGTGAA  296

Query  297  TGTGGTGGAGGCACTTCAGGAATTCTGGCAGATGAAGCAGTCCCGTGGTGCTGACTTAAAGAATGGGGCTCTAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGGTGGAGGCACTTCAGGAATTCTGGCAGATGAAGCAGTCCCGTGGTGCTGACTTAAAGAATGGGGCTCTAG  370

Query  371  TGGTTTATGAGATGGTTCCCTCCAACAGCCCTCCTTATGTCTGCTATGTCACCCTGCCTGGGGGAAGCTGCTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGTTTATGAGATGGTTCCCTCCAACAGCCCTCCTTATGTCTGCTATGTCACCCTGCCTGGGGGAAGCTGCTTT  444

Query  445  GGGAGTTTCCAGTTTTGCCCCACAAAAGCTGAGGCCCGGAGGAGTGCTGCAAAGATTGCGCTAATGAATTCTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGAGTTTCCAGTTTTGCCCCACAAAAGCTGAGGCCCGGAGGAGTGCTGCAAAGATTGCGCTAATGAATTCTGT  518

Query  519  GTTTAATGAACATCCTTCCCGAAGAATCACTGATGAGTTCATCGAGAAGAGTGTCTCTGAGGCCCTGGCATCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTTAATGAACATCCTTCCCGAAGAATCACTGATGAGTTCATCGAGAAGAGTGTCTCTGAGGCCCTGGCATCTT  592

Query  593  TTAATGGCAACAGGGAGGAAGCTGACAACCCAAATACAGGGATTGGTGCCTTCCGATTCATGCTGGAATCCAAC  666
            |||||                                                                     
Sbjct  593  TTAAT---------------------------------------------------------------------  597

Query  667  AAGGGCAAATCAATGTTGGAGTTCCAGGAGCTAATGACAGTTTTTCAACTGCTACACTGGAATGGCAGCCTTAA  740
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  ---------------------------GAGCTAATGACAGTTTTTCAACTGCTACACTGGAATGGCAGCCTTAA  644

Query  741  GGCCATGAGGGAACGACAATGCTCTCGGCAGGAGGTGTTGGCTCATTATTCGCACCGGGCCCTGGATGATGATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  GGCCATGAGGGAACGACAATGCTCTCGGCAGGAGGTGTTGGCTCATTATTCGCACCGGGCCCTGGATGATGATA  718

Query  815  TTCGCCACCAAATGGCCTTGGACTGGGTGAGCCGGGAGCAGAGTGTGCCGGGGGCACTGTCTAGAGAGCTGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  TTCGCCACCAAATGGCCTTGGACTGGGTGAGCCGGGAGCAGAGTGTGCCGGGGGCACTGTCTAGAGAGCTGGCC  792

Query  889  TCTACTGAGCGGGAGCTGGATGAAGCCCGACTGGCAGGCAAGGAGCTGCGCTTCCACAAGGAGAAGAAAGATAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  TCTACTGAGCGGGAGCTGGATGAAGCCCGACTGGCAGGCAAGGAGCTGCGCTTCCACAAGGAGAAGAAAGATAT  866

Query  963  TCTTGTGCTGGCTGCTGGGCAGTTGGGCAATATGCATTCTTCCAACTGC  1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  TCTTGTGCTGGCTGCTGGGCAGTTGGGCAATATGCATTCTTCCAACTGC  915