Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04852
• Subject: NM_027091.4
• Aligned Length: 978
• Identities: 861
• Gaps: 3

Alignment

Query   1  ATGGCAGCCTTTGCAGTGGAACCTCAGGGGCCCGCGTTAGGATCTGAACCAATGATGCTGGGTTCACCCACATC  74
           ||||||||.|||||.|||||.||.||||.||||.||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct   1  ATGGCAGCGTTTGCGGTGGATCCCCAGGCGCCCACGTTGGGATCTGAACCAATGATGTTGGGTTCACCTACATC  74

Query  75  TCCAAAGCCAGGAGTTAATGCCCAGTTCTTACCTGGATTTTTAATGGGGGATTTGCCAGCTCCGGTGACTCCAC  148
           |||||||.||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||.|
Sbjct  75  TCCAAAGACAGGCGCTAATGCCCAGTTCTTGCCTGGATTTTTAATGGGGGATCTACCAGCTCCAGTGACTCCGC  148

Query 149  AACCTCGATCAATTAGTGGCCCTTCAGTAGGAGTAATGGAAATGAGATCACCTTTACTTGCAGGTGGGTCACCA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 149  AACCTCGATCAATTAGTGGCCCTTCAGTAGGAGTAATGGAAATGAGATCACCTTTACTAGCAGGGGGCTCCCCA  222

Query 223  CCACAACCAGTTGTACCAGCTCATAAAGATAAAAGTGGCGCTCCACCAGTTAGAAGTATATATGATGACATTTC  296
           |||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223  CCACAGCCAGTTGTCCCTGCTCATAAAGATAAGAGTGGAGCTCCACCTGTGAGAAGTATCTATGATGACATTTC  296

Query 297  TAGCCCAGGACTTGGATCAACACCTTTAACTTCAAGAAGACAGCCAAACATTTCAGTAATGCAGAGTCCTCTTG  370
           .||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||.|..|||||||||||||||
Sbjct 297  CAGCCCAGGACTTGGATCAACGCCTTTGACTTCAAGAAGACAGGCAAACATTTCATTGTTGCAGAGTCCTCTTG  370

Query 371  TTGGAGTTACATCTACTCCTGGAACAGGGCAAAGTATGTTTAGTCCAGCAAGTATCGGTCAGCCACGAAAGACG  444
           ||||||.||||   |||||||.|.|.||||||||.||||||||||||||||..||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 371  TTGGAGCTACA---ACTCCTGTACCTGGGCAAAGCATGTTTAGTCCAGCAAACATTGGTCAACCACGAAAGACA  441

Query 445  ACATTATCTCCTGCCCAGTTGGATCCTTTTTATACTCAAGGAGATTCTTTGACTTCAGAAGATCACCTCGATGA  518
           |||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 442  ACACTATCTCCTGCCCAACTGGATCCTTTTTATACTCAAGGAGATTCTCTGACTTCAGAAGATCACCTAGATGA  515

Query 519  CTCTTGGGTGACTGTATTTGGGTTTCCTCAAGCATCTGCTTCCTACATATTACTACAATTTGCACAGTATGGGA  592
           |.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||.||||.||||||||.|||||||
Sbjct 516  CACTTGGGTGACTGTGTTTGGGTTTCCACAGGCATCTGCTTCTTATATATTATTACAGTTTGCACAATATGGGA  589

Query 593  ATATCTTAAAACATGTGATGTCTAATACAGGAAATTGGATGCATATTCGTTATCAATCTAAACTGCAGGCTCGG  666
           ||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.|||
Sbjct 590  ATATCTTAAAGCATGTGATGTCTAACACAGGCAACTGGATGCATATTCGTTACCAATCTAAATTGCAAGCCCGG  663

Query 667  AAAGCCTTAAGCAAAGATGGGAGGATTTTTGGAGAATCCATCATGATTGGTGTAAAACCATGTATTGACAAAAG  740
           |||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||.
Sbjct 664  AAAGCCTTAAGCAAAGACGGGAGAATATTTGGAGAATCCATCATGATTGGTGTCAAGCCATGTATAGATAAAAA  737

Query 741  TGTTATGGAAAGCAGTGACAGATGTGCTTTATCATCTCCATCTTTAGCCTTTACACCACCAATCAAAACTCTAG  814
           |||.|||||||.||||||||||.|.|..||.||||||||||||.|||||||||||.||||.||||..|||.|||
Sbjct 738  TGTCATGGAAAACAGTGACAGAGGAGTCTTGTCATCTCCATCTCTAGCCTTTACAACACCCATCAGGACTTTAG  811

Query 815  GTACACCAACACAACCTGGAAGTACTCCTAGGATTTCTACCATGAGACCTCTTGCTACAGCATACAAAGCCTCT  888
           |.||.||||||||..|.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 812  GCACTCCAACACAGTCCGGAAGCACTCCTAGGGTTTCTACCATGAGGCCTCTTGCCACAGCATACAAGGCCTCC  885

Query 889  ACTAGTGATTATCAGGTTATTTCTGACAGACAAACGCCAAAAAAAGATGAAAGTCTTGTATCCAAAGCAATGGA  962
           ||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|.|||.|||||
Sbjct 886  ACTAGTGACTACCAGGTTATTTCTGACAGACAGACACCAAAGAAGGATGAGAGCCTTGTGTCAAGAGCGATGGA  959

Query 963  GTACATGTTTGGCTGG  978
           |||||||||.||.|||
Sbjct 960  GTACATGTTCGGTTGG  975