Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04869
- Subject:
- XM_017005695.2
- Aligned Length:
- 1698
- Identities:
- 1170
- Gaps:
- 474
Alignment
Query 1 ATGAAGAAGATGAGCAACATTTATGAGTCCGCTGCCAACACACTGGGAATCTTTAACAGCCCCTGCCTGACCAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGTTGAGCTGCGTGTGGCGTGCAAAGGCATTTCTGACAGAGATGCCCTTTCCAAACCAGACCCCTGTGTCATCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCAAGATGCAGTCTCATGGGCAGTGGTTTGAGGTTGACAGGACTGAGGTGATTCGCACCTGCATAAACCCAGTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TACTCAAAACTGTTTACTGTGGACTTTTACTTTGAGGAGGTGCAGCGCCTGCGGTTTGAAGTCCATGACATCAG 296
.|||||| |.||.|| |||
Sbjct 1 ---------------------------------------ATGCAGC-----------GGAGACC-------CAG 17
Query 297 CAGCAACCACAATGGGCTGAAGGAGGCCGACTTCCTTGGTGGCATGGAGTGCACACTTGGCCAGATTGTTTCCC 370
|||.| .||||.|||| |.||| |||| .||||.| |
Sbjct 18 -----ACCGC---CGGCTAAAGG----------------------GCAGT----ACTT--TCAGAAT------C 49
Query 371 AGAGAAAGCTGTCCAAA-TCCT-TGCTGAAGCATGGGAACACAGCAGGGAAATCTTCCATCACGGTGATTGCTG 442
|..||.|||.| |||| |||| || ||.||| ||..|||| |||||.|
Sbjct 50 ACGGACAGCGG--CAAACTCCTGTG--GAGGCA---------------GATCTCTT---------TGATTTC-- 93
Query 443 AAGAATTAT----CTGGCAATGACGACTATGTTGAGCTTGCATTCAATGCACGGAAATTG--GATGACAAGGAT 510
|.||| ||.||| .||||.|....||||| ||.|| || ||.|||||..||
Sbjct 94 ----AGTATGGGCCTTGCA------GCTATCTCCCTCTTGC---CACTG---------TGCAGAGGACAACCAT 145
Query 511 TTCTTCAGTAAATCTGACCCATTTCTGGAAATTTTTCGTATGAATGATG--ATGCA---ACTCAGCAGCTGGTG 579
| |.||||| |.||| ||..|.|.||.|.| |||.| |||
Sbjct 146 T-----------TTTGACC---TGCTG--------TCCCAGGGATAAGGGTATGGACATACT------------ 185
Query 580 CACCGAACTGAGG-----TTGTGATGAATAACTTAAGCCCAGCCT--------GGA-AATCATTCAAAGTATCT 639
||||| ||.|..||..||.|.|.||||..|.|| ||| || ||||.||
Sbjct 186 --------TGAGGAACCATTATTCTGCCTACCATCAGCCGTGTCTTCACTGAAGGACAA------AAAGCAT-- 243
Query 640 GTAAATTCTCTATGCAGCGGAGACCCAGACCGCCGGCTAAAGTGCATAGTATGGGACTGGGACTCCAATGGCAA 713
||.|||||||.| .|| |.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 -----TTATCTATGCTG----AAC---------------ATGTGCATAGTATGGGACTGGGACTCCAATGGCAA 293
Query 714 GCATGACTTCATTGGAGAATTCACCTCGACATTCAAGGAGATGAGAGGAGCAATGGAAGGGAAACAGGTGCAGT 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 GCATGACTTCATTGGAGAATTCACCTCGACATTCAAGGAGATGAGAGGAGCAATGGAAGGGAAACAGGTGCAGT 367
Query 788 GGGAGTGCATCAATCCCAAGTACAAAGCCAAGAAGAAGAATTACAAGAACTCAGGCACTGTGATTCTGAATCTG 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 GGGAGTGCATCAATCCCAAGTACAAAGCCAAGAAGAAGAATTACAAGAACTCAGGCACTGTGATTCTGAATCTG 441
Query 862 TGCAAGATTCACAAGATGCATTCTTTCTTGGACTACATCATGGGTGGCTGCCAAATCCAGTTTACAGTAGCTAT 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 TGCAAGATTCACAAGATGCATTCTTTCTTGGACTACATCATGGGTGGCTGCCAAATCCAGTTTACAGTAGCTAT 515
Query 936 AGATTTCACTGCCTCAAACGGGGACCCCAGGAACAGCTGTTCCTTGCACTACATCCACCCTTACCAACCCAATG 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 AGATTTCACTGCCTCAAACGGGGACCCCAGGAACAGCTGTTCCTTGCACTACATCCACCCTTACCAACCCAATG 589
Query 1010 AGTATCTGAAAGCTTTGGTAGCTGTGGGGGAGATTTGCCAAGACTATGACAGTGACAAAATGTTCCCTGCCTTT 1083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 AGTATCTGAAAGCTTTGGTAGCTGTGGGGGAGATTTGCCAAGACTATGACAGTGACAAAATGTTCCCTGCCTTT 663
Query 1084 GGGTTTGGCGCCAGGATACCTCCAGAGTACACGGTCTCTCATGACTTTGCAATCAACTTTAATGAAGACAACCC 1157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GGGTTTGGCGCCAGGATACCTCCAGAGTACACGGTCTCTCATGACTTTGCAATCAACTTTAATGAAGACAACCC 737
Query 1158 AGAATGTGCAGGAATTCAAGGAGTTGTGGAAGCCTATCAGAGCTGTCTTCCTAAGCTCCAACTCTACGGTCCCA 1231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 AGAATGTGCAGGAATTCAAGGAGTTGTGGAAGCCTATCAGAGCTGTCTTCCTAAGCTCCAACTCTACGGTCCCA 811
Query 1232 CCAACATTGCCCCCATCATCCAGAAGGTTGCCAAGTCAGCGTCAGAGGAAACTAACACCAAGGAGGCATCGCAA 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 CCAACATTGCCCCCATCATCCAGAAGGTTGCCAAGTCAGCGTCAGAGGAAACTAACACCAAGGAGGCATCGCAA 885
Query 1306 TACTTCATCCTGCTGATCCTGACAGATGGTGTTATCACAGACATGGCCGACACCCGGGAGGCCATTGTCCATGC 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 TACTTCATCCTGCTGATCCTGACAGATGGTGTTATCACAGACATGGCCGACACCCGGGAGGCCATTGTCCATGC 959
Query 1380 CTCCCACCTCCCCATGTCAGTCATCATCGTGGGAGTAGGGAACGCTGACTTCAGTGACATGCAGATGCTGGACG 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CTCCCACCTCCCCATGTCAGTCATCATCGTGGGAGTAGGGAACGCTGACTTCAGTGACATGCAGATGCTGGACG 1033
Query 1454 GTGATGATGGGATTCTGAGGTCACCCAAGGGAGAGCCTGTTCTTCGAGACATCGTCCAGTTCGTGCCCTTCAGG 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 GTGATGATGGGATTCTGAGGTCACCCAAGGGAGAGCCTGTTCTTCGAGACATCGTCCAGTTCGTGCCCTTCAGG 1107
Query 1528 AACTTCAAACACGCATCTCCAGCTGCCCTGGCAAAGAGCGTGCTGGCTGAAGTCCCAAACCAAGTTGTGGACTA 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 AACTTCAAACACGCATCTCCAGCTGCCCTGGCAAAGAGCGTGCTGGCTGAAGTCCCAAACCAAGTTGTGGACTA 1181
Query 1602 TTACAATGGCAAAGGAATTAAACCAAAATGTTCATCAGAAATGTATGAATCTTCCAGAACACTAGCACCA 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 TTACAATGGCAAAGGAATTAAACCAAAATGTTCATCAGAAATGTATGAATCTTCCAGAACACTAGCACCA 1251
