Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04882
- Subject:
- NM_177304.4
- Aligned Length:
- 1332
- Identities:
- 1120
- Gaps:
- 24
Alignment
Query 1 ATGGCAGTGAAGCTTGGGACCCTCCTGCTGGCCCTTG-----CCCTGGGCCTGGCCCAGCCAGCCTCTGCCCGC 69
|||||||..|||||..|||||.|||||||||.|.||| ..|||||..|| |||.||.|||||||.|
Sbjct 1 ATGGCAGCAAAGCTCTGGACCTTCCTGCTGGGCTTTGGGCTCAGCTGGGTGTG-----GCCGGCTTCTGCCCAC 69
Query 70 CGGAAGCTGCTGGTGTTTCTGCTGGATGGTTTTCGCTCAGACTACATCAGTGATGAGGCGCTGGAGTCATTGCC 143
||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|..||.|||||
Sbjct 70 CGGAAGCTCCTGGTGTTGCTCCTGGATGGTTTTCGCTCAGACTACATCAGTGAGGATGCTCTAGCATCCTTGCC 143
Query 144 TGGTTTCAAAGAGATTGTGAGCAGGGGAGTAAAAGTGGATTACTTGACTCCAGACTTCCCTAGTCTCTCGTATC 217
|||.||||.|||||||||||.|||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 144 TGGCTTCAGAGAGATTGTGAACAGAGGCGTCAAAGTGGATTACTTGACTCCAGACTTTCCCAGCCTCTCCTATC 217
Query 218 CCAATTATTATACCCTAATGACTGGCCGCCATTGTGAAGTCCATCAGATGATCGGGAACTACATGTGGGACCCC 291
|||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 218 CCAATTACTACACCCTCATGACTGGCCGCCACTGTGAGGTCCACCAGATGATCGGCAACTACATGTGGGATCCC 291
Query 292 ACCACCAACAAGTCCTTTGACATTGGCGTCAACAAAGACAGCCTAATGCCTCTCTGGTGGAATGGATCAGAACC 365
|..|||||||||||.||||||||.||.||||||..|||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 292 AGAACCAACAAGTCATTTGACATCGGGGTCAACCGAGACAGCCTGATGCCCCTGTGGTGGAACGGGTCAGAACC 365
Query 366 TCTGTGGGTCACTCTGACCAAGGCCAAAAGGAAGGTCTACATGTACTACTGGCCAGGCTGTGAGGTTGAGATTC 439
.||||||.|||||||||..||.||||..|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 366 GCTGTGGATCACTCTGATGAAAGCCAGGAGGAAAGTCTACATGTATTACTGGCCCGGCTGTGAAGTTGAGATTC 439
Query 440 TGGGTGTCAGACCCACCTACTGCCTAGAATATAAAAATGTCCCAACGGATATCAATTTTGCCAATGCAGTCAGC 513
|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 440 TTGGTGTCAGACCAACTTACTGCCTAGAATATAAAACTGTCCCAACAGATATCAACTTTGCGAATGCAGTTAGC 513
Query 514 GATGCTCTTGACTCCTTCAAGAGTGGCCGGGCCGACCTGGCAGCCATATACCATGAGCGCATTGACGTGGAAGG 587
||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 514 GATGCTCTCGACTCATTAAAGAGTGGCCGAGCGGATCTAGCAGCCATATACCATGAGCGCATCGATGTAGAAGG 587
Query 588 CCACCACTACGGGCCTGCATCTCCGCAGAGGAAAGATGCCCTCAAGGCTGTAGACACTGTCCTGAAGTACATGA 661
.|||||||||||.|||.||||.||.|||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 588 TCACCACTACGGCCCTTCATCACCTCAGAGAAAAGATGCCCTCAGAGCTGTGGACACTGTCCTGAAGTATATGA 661
Query 662 CCAAGTGGATCCAGGAGCGGGGCCTGCAGGACCGCCTGAACGTCATTATTTTCTCGGATCACGGAATGACCGAC 735
.|.|||||||.|||||.||.|||||||||.|...|||.||||||||..|.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 662 TCCAGTGGATTCAGGACCGAGGCCTGCAGCAGGACCTAAACGTCATCCTCTTCTCAGACCATGGGATGACTGAC 735
Query 736 ATTTTCTGGATGGACAAAGTGATTGAGCTGAATAAGTACATCAGCCTGAATGACCTGCAGCAAGTGAAGGACCG 809
||.|||||||||||.||||||||||||||||..||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 736 ATCTTCTGGATGGATAAAGTGATTGAGCTGAGCAACTACATCAGCCTGGACGACCTGCAGCAAGTGAAAGACCG 809
Query 810 CGGGCCTGTTGTGAGCCTTTGGCCGGCCCCTGGGAAACACTCTGAGATATATAACAAACTGAGCACAGTGGAAC 883
.|||||.|||||||||||.|||||.|..|||||.||||||||||||||||||.|||||||..||||||||||||
Sbjct 810 AGGGCCCGTTGTGAGCCTGTGGCCAGTTCCTGGAAAACACTCTGAGATATATCACAAACTCCGCACAGTGGAAC 883
Query 884 ACATGACTGTCTACGAGAAAGAAGCCAT-CCCAAGCAGGTTCTATTACAAGAAAGGAAAGTTTGTCTCTCCTTT 956
|||||||.||.||.|||||||||.|.|| ||||| ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 884 ACATGACCGTGTATGAGAAAGAATCAATACCCAA-CAGGTTCTATTACAAGAAAGGAAAATTTGTCTCTCCTTT 956
Query 957 GACTTTAGTGGCTGATGAAGGCTGGTTCATAACTGAGAATCGAGAGATGCTTCCGTTTTGGATGAACAGCACCG 1030
|||..|.||||||||||||||.|||||||||.|.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 957 GACCCTGGTGGCTGATGAAGGATGGTTCATAGCAGAGAGTCGAGAGATGCTTCCATTTTGGATGAACAGCACGG 1030
Query 1031 GCAGGCGGGAAGGTTGGCAGCGTGGATGGCACGGCTACGACAACGAGCTCATGGACATGCGGGGCATCTTCCTG 1104
|||.|||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1031 GCAAGCGTGAAGGCTGGCAGCGAGGATGGCACGGATATGACAACGAACTCATGGACATGAGAGGCATCTTCCTG 1104
Query 1105 GCCTTCGGACCTGATTTCAAATCCAACTTCAGAGCTGCTCCTATCAGGTCGGTGGACGTCTACAATGTCATGTG 1178
|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||||||
Sbjct 1105 GCCATCGGACCTGATTTCAAGTCCAACTTCAGAGCTGCTCCAATCAGATCCGTGGATGTCTACAACATCATGTG 1178
Query 1179 CAATGTGGTGGGCATCACCCCGCTGCCCAACAACGGATCCTGGTCCAGGGTGATGTGCATGCTGAAGGGCCGCG 1252
|.|.||.|..|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||...
Sbjct 1179 CCACGTCGCAGGCATCACCCCACTGCCCAACAACGGGTCCTGGTCCAGGGTGGTATGCATGCTGAAGGGCCAGA 1252
Query 1253 CCAGCACTGC----CCCGCCTGTCTGGCCCAGCCACTGTGCCCTGGCACTGATTCTTCTCT--TCCTGCTTGCA 1320
|||||.|||| |||.||...||| |.|..||||||.||||...|||||||.|||| |.|| |||.|
Sbjct 1253 CCAGCTCTGCTCCACCCACCCCACTG----AACAGCTGTGCACTGGTCTTGATTCTCCTCTTATACT--TTGTA 1320