Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04882
- Subject:
- XM_006509444.3
- Aligned Length:
- 1334
- Identities:
- 965
- Gaps:
- 208
Alignment
Query 1 ATGGCAGTGAAGCTTGGGACCCTCCTGCTGGCCCTTGCCCTGGGCCTGGCCCAGCCAGCCTCTGCCCGCCGGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCTGCTGGTGTTTCTGCTGGATGGTTTTCGCTCAGA-----CTACATCAGTGATGAGGCGCTGGAGTCATTGCC 143
|||| ||| |||.|.||.| |..|||
Sbjct 1 --------------------ATGG---------AGAGTCCTCTAAACCACT--TCCGGC--------------- 28
Query 144 TGGTTTCAAAGAG-ATTGTGAGCAGGG-GAGTAAAAGTGGATTACTTGACTCCAGACTTCCCTAGTCTCTCGTA 215
||.|| | ||||| | .|||.| ||.||| ||||.|
Sbjct 29 --------AACAGCA-------CAGGGCG-----CAGTCG---------CTACAG-----------CTCTGG-- 60
Query 216 TCCCAATTATTATACCCTAATGACTGGCCGCCATTGTGAAGTCCATCAGATGATCGGGAACTACATGTGGGACC 289
||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 61 -------------------------GGCCGCCACTGTGAGGTCCACCAGATGATCGGCAACTACATGTGGGATC 109
Query 290 CCACCACCAACAAGTCCTTTGACATTGGCGTCAACAAAGACAGCCTAATGCCTCTCTGGTGGAATGGATCAGAA 363
|||..|||||||||||.||||||||.||.||||||..|||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||
Sbjct 110 CCAGAACCAACAAGTCATTTGACATCGGGGTCAACCGAGACAGCCTGATGCCCCTGTGGTGGAACGGGTCAGAA 183
Query 364 CCTCTGTGGGTCACTCTGACCAAGGCCAAAAGGAAGGTCTACATGTACTACTGGCCAGGCTGTGAGGTTGAGAT 437
||.||||||.|||||||||..||.||||..|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 184 CCGCTGTGGATCACTCTGATGAAAGCCAGGAGGAAAGTCTACATGTATTACTGGCCCGGCTGTGAAGTTGAGAT 257
Query 438 TCTGGGTGTCAGACCCACCTACTGCCTAGAATATAAAAATGTCCCAACGGATATCAATTTTGCCAATGCAGTCA 511
|||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 258 TCTTGGTGTCAGACCAACTTACTGCCTAGAATATAAAACTGTCCCAACAGATATCAACTTTGCGAATGCAGTTA 331
Query 512 GCGATGCTCTTGACTCCTTCAAGAGTGGCCGGGCCGACCTGGCAGCCATATACCATGAGCGCATTGACGTGGAA 585
||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 332 GCGATGCTCTCGACTCATTAAAGAGTGGCCGAGCGGATCTAGCAGCCATATACCATGAGCGCATCGATGTAGAA 405
Query 586 GGCCACCACTACGGGCCTGCATCTCCGCAGAGGAAAGATGCCCTCAAGGCTGTAGACACTGTCCTGAAGTACAT 659
||.|||||||||||.|||.||||.||.|||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 406 GGTCACCACTACGGCCCTTCATCACCTCAGAGAAAAGATGCCCTCAGAGCTGTGGACACTGTCCTGAAGTATAT 479
Query 660 GACCAAGTGGATCCAGGAGCGGGGCCTGCAGGACCGCCTGAACGTCATTATTTTCTCGGATCACGGAATGACCG 733
||.|.|||||||.|||||.||.|||||||||.|...|||.||||||||..|.|||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 480 GATCCAGTGGATTCAGGACCGAGGCCTGCAGCAGGACCTAAACGTCATCCTCTTCTCAGACCATGGGATGACTG 553
Query 734 ACATTTTCTGGATGGACAAAGTGATTGAGCTGAATAAGTACATCAGCCTGAATGACCTGCAGCAAGTGAAGGAC 807
||||.|||||||||||.||||||||||||||||..||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 554 ACATCTTCTGGATGGATAAAGTGATTGAGCTGAGCAACTACATCAGCCTGGACGACCTGCAGCAAGTGAAAGAC 627
Query 808 CGCGGGCCTGTTGTGAGCCTTTGGCCGGCCCCTGGGAAACACTCTGAGATATATAACAAACTGAGCACAGTGGA 881
||.|||||.|||||||||||.|||||.|..|||||.||||||||||||||||||.|||||||..||||||||||
Sbjct 628 CGAGGGCCCGTTGTGAGCCTGTGGCCAGTTCCTGGAAAACACTCTGAGATATATCACAAACTCCGCACAGTGGA 701
Query 882 ACACATGACTGTCTACGAGAAAGAAGCCAT-CCCAAGCAGGTTCTATTACAAGAAAGGAAAGTTTGTCTCTCCT 954
|||||||||.||.||.|||||||||.|.|| ||||| ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 702 ACACATGACCGTGTATGAGAAAGAATCAATACCCAA-CAGGTTCTATTACAAGAAAGGAAAATTTGTCTCTCCT 774
Query 955 TTGACTTTAGTGGCTGATGAAGGCTGGTTCATAACTGAGAATCGAGAGATGCTTCCGTTTTGGATGAACAGCAC 1028
|||||..|.||||||||||||||.|||||||||.|.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 775 TTGACCCTGGTGGCTGATGAAGGATGGTTCATAGCAGAGAGTCGAGAGATGCTTCCATTTTGGATGAACAGCAC 848
Query 1029 CGGCAGGCGGGAAGGTTGGCAGCGTGGATGGCACGGCTACGACAACGAGCTCATGGACATGCGGGGCATCTTCC 1102
.||||.|||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct 849 GGGCAAGCGTGAAGGCTGGCAGCGAGGATGGCACGGATATGACAACGAACTCATGGACATGAGAGGCATCTTCC 922
Query 1103 TGGCCTTCGGACCTGATTTCAAATCCAACTTCAGAGCTGCTCCTATCAGGTCGGTGGACGTCTACAATGTCATG 1176
|||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||||
Sbjct 923 TGGCCATCGGACCTGATTTCAAGTCCAACTTCAGAGCTGCTCCAATCAGATCCGTGGATGTCTACAACATCATG 996
Query 1177 TGCAATGTGGTGGGCATCACCCCGCTGCCCAACAACGGATCCTGGTCCAGGGTGATGTGCATGCTGAAGGGCCG 1250
|||.|.||.|..|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.
Sbjct 997 TGCCACGTCGCAGGCATCACCCCACTGCCCAACAACGGGTCCTGGTCCAGGGTGGTATGCATGCTGAAGGGCCA 1070
Query 1251 CGCCAGCACTGC----CCCGCCTGTCTGGCCCAGCCACTGTGCCCTGGCACTGATTCTTCTCT--TCCTGCTTG 1318
..|||||.|||| |||.||...||| |.|..||||||.||||...|||||||.|||| |.|| |||
Sbjct 1071 GACCAGCTCTGCTCCACCCACCCCACTG----AACAGCTGTGCACTGGTCTTGATTCTCCTCTTATACT--TTG 1138
Query 1319 CA 1320
.|
Sbjct 1139 TA 1140