Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04894
• Subject: XM_006714531.2
• Aligned Length: 1665
• Identities: 1581
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGAGCGGCCGGCGCCCGGCGAGGTGGTCATGAGCCAAGCCATCCAGCCGGCGCACGCCACTGCGCGCGGCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCGGCCGGCGCCCGGCGAGGTGGTCATGAGCCAAGCCATCCAGCCGGCGCACGCCACTGCGCGCGGCGA  74

Query   75  GCTGAGCGCGGGGCAGCTGCTCAAGTGGATCGACACCACCGCCTGCCTGGCGGCTGAGAAACATGCTGGAGTTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGAGCGCGGGGCAGCTGCTCAAGTGGATCGACACCACCGCCTGCCTGGCGGCTGAGAAACATGCTGGAGTTT  148

Query  149  CCTGCGTTACAGCCTCAGTGGATGACATACAGTTTGAGGAGACAGCTAGAGTTGGACAAGTTATAACCATCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGCGTTACAGCCTCAGTGGATGACATACAGTTTGAGGAGACAGCTAGAGTTGGACAAGTTATAACCATCAAA  222

Query  223  GCAAAAGTTACTAGAGCATTCAGCACAAGCATGGAGATCAGTATCAAGGTCATGGTACAGGATATGCTCACTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAAAAGTTACTAGAGCATTCAGCACAAGCATGGAGATCAGTATCAAGGTCATGGTACAGGATATGCTCACTGG  296

Query  297  CATTGAGAAGCTTGTTAGTGTGGCTTTCTCCACATTTGTAGCCAAACCAGTTGGAAAAGAAAAGATTCATTTAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATTGAGAAGCTTGTTAGTGTGGCTTTCTCCACATTTGTAGCCAAACCAGTTGGAAAAGAAAAGATTCATTTAA  370

Query  371  AACCAGTCACACTTCTAACTGAACAAGATCATGTGGAACATAATCTGGCTGCTGAGAGAAGGAAAGTTCGATTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACCAGTCACACTTCTAACTGAACAAGATCATGTGGAACATAATCTGGCTGCTGAGAGAAGGAAAGTTCGATTA  444

Query  445  CAACATGAAGATACCTTTAACAATTTAATGAAGGAAAGTAGCAAATTTGATGATCTCATTTTTGATGAAGAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAACATGAAGATACCTTTAACAATTTAATGAAGGAAAGTAGCAAATTTGATGATCTCATTTTTGATGAAGAGGA  518

Query  519  AGGAGCGGTTTCCACAAGGGGCACCTCCGTTCAGAGCATTGAACTGGTCCTCCCACCCCATGCAAACCATCACG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGAGCGGTTTCCACAAGGGGCACCTCCGTTCAGAGCATTGAACTGGTCCTCCCACCCCATGCAAACCATCACG  592

Query  593  GAAATACATTTGGTGGCCAGATTATGGCGTGGATGGAGACAGTGGCTACTATTTCTGCAAGCCGCCTGTGTTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAATACATTTGGTGGCCAGATTATGGCGTGGATGGAGACAGTGGCTACTATTTCTGCAAGCCGCCTGTGTTGG  666

Query  667  GCTCATCCCTTTCTGAAGTCCGTAGATATGTTTAAGTTCCGGGGACCATCTACAGTTGGAGATCGTCTTGTCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTCATCCCTTTCTGAAGTCCGTAGATATGTTTAAGTTCCGGGGACCATCTACAGTTGGAGATCGTCTTGTCTT  740

Query  741  CACTGCCATTGTCAACAATACATTTCAGACCTGTGTTGAAGTTGGAGTTCGCGTGGAGGCCTTTGACTGTCAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACTGCCATTGTCAACAATACATTTCAGACCTGTGTTGAAGTTGGAGTTCGCGTGGAGGCCTTTGACTGTCAGG  814

Query  815  AATGGGCCGAGGGCCGAGGGCGTCACATCAACAGTGCTTTTCTCATTTACAATGCTGCTGATGATAAGGAAAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATGGGCCGAGGGCCGAGGGCGTCACATCAACAGTGCTTTTCTCATTTACAATGCTGCTGATGATAAGGAAAAT  888

Query  889  CTCATCACGTTTCCCAGAATCCAACCCATTTCAAAGGATGATTTCAGACGCTATCGGGGAGCTATTGCACGCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCATCACGTTTCCCAGAATCCAACCCATTTCAAAGGATGATTTCAGACGCTATCGGGGAGCTATTGCACGCAA  962

Query  963  GCGAATTCGCCTAGGCAGAAAATATGTTATTTCCCACAAAGAAGAGGTTCCACTTTGCATACACTGGGATATCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGAATTCGCCTAGGCAGAAAATATGTTATTTCCCACAAAGAAGAGGTTCCACTTTGCATACACTGGGATATCA  1036

Query 1037  GCAAGCAGGCATCCCTGAGTGACAGCAATGTGGAGGCCCTCAAAAAACTGGCAGCCAAAAGGGGTTGGGAGGTT  1110
            ||||||                                                                    
Sbjct 1037  GCAAGC--------------------------------------------------------------------  1042

Query 1111  ACCAGCACTGTGGAAAAGATAAAAATATATACTCTGGAAGAGCATGATGTTTTATCTGTTTGGGTTGAAAAGCA  1184
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043  ----------------AGATAAAAATATATACTCTGGAAGAGCATGATGTTTTATCTGTTTGGGTTGAAAAGCA  1100

Query 1185  CGTGGGAAGTCCAGCACATTTGGCTTATCGTCTCTTGTCTGACTTTACAAAGCGACCTTTGTGGGACCCCCATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  CGTGGGAAGTCCAGCACATTTGGCTTATCGTCTCTTGTCTGACTTTACAAAGCGACCTTTGTGGGACCCCCATT  1174

Query 1259  TTGTGTCCTGTGAAGTCATAGACTGGGTGAGTGAAGATGATCAGCTGTATCACATCACCTGTCCTATACTGAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  TTGTGTCCTGTGAAGTCATAGACTGGGTGAGTGAAGATGATCAGCTGTATCACATCACCTGTCCTATACTGAAT  1248

Query 1333  GATGACAAACCCAAAGACTTGGTAGTACTCGTATCACGAAGAAAACCCCTCAAAGATGGTAACACTTACACAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  GATGACAAACCCAAAGACTTGGTAGTACTCGTATCACGAAGAAAACCCCTCAAAGATGGTAACACTTACACAGT  1322

Query 1407  GGCAGTGAAGTCGGTCATTTTGCCATCGGTCCCCCCGTCTCCACAGTACATCAGAAGTGAAATCATATGTGCCG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  GGCAGTGAAGTCGGTCATTTTGCCATCGGTCCCCCCGTCTCCACAGTACATCAGAAGTGAAATCATATGTGCCG  1396

Query 1481  GATTTCTCATCCATGCTATTGACAGCAATTCATGCATCGTATCTTACTTTAACCATATGTCTGCTAGCATCCTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  GATTTCTCATCCATGCTATTGACAGCAATTCATGCATCGTATCTTACTTTAACCATATGTCTGCTAGCATCCTT  1470

Query 1555  CCTTACTTTGCTGGAAATCTTGGTGGCTGGTCAAAATCCATTGAAGAAACAGCAGCCTCTTGTATACAGTTCTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471  CCTTACTTTGCTGGAAATCTTGGTGGCTGGTCAAAATCCATTGAAGAAACAGCAGCCTCTTGTATACAGTTCTT  1544

Query 1629  AGAGAATCCTCCTGATGATGGGTTTGTAAGCACATTT  1665
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  AGAGAATCCTCCTGATGATGGGTTTGTAAGCACATTT  1581