Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04914
• Subject: XM_017319801.1
• Aligned Length: 879
• Identities: 774
• Gaps: 6

Alignment

Query   1  ATGACTGGCAAAACACAGACCAGCAACGTCACCAATAAGAATGACCCCAAGTCCATCAACTCCCGTGTTTTCAT  74
           |||||.|||||||||||.||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct   1  ATGACGGGCAAAACACAAACAAGCAACATTACCAATAAGAATGACCCCAAGTCCATCAACTCCAGGGTTTTCAT  74

Query  75  CGGCAATCTAAATACGGCAATTGTCAAGAAAGTTGACATTGAAGCCATTTTTTCAAAGTATGGAAAAATAGTTG  148
           |||||||.|.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  75  CGGCAATTTGAATACAGCCATCGTCAAAAAGGTCGACATTGAAGCTATTTTTTCAAAGTATGGAAAAATCGTTG  148

Query 149  GATGTTCCGTTCACAAAGGTTATGCATTTGTACAGTACATGAGTGAGCGACATGCAAGAGCTGCAGTGGCTGGA  222
           |.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149  GCTGCTCTGTTCACAAAGGGTATGCTTTCGTTCAGTACATGAGTGAGCGTCATGCAAGAGCCGCAGTGGCTGGA  222

Query 223  GAAAATGCCAGAGTCATCGCCGGCCAACCACTTGATATCAACATGGCAGGAGAGCCCAAACCATACAGACCAAA  296
           |||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 223  GAAAACGCCAGGGTCATCGCAGGCCAGCCTCTTGATATCAACATGGCAGGGGAACCCAAACCCTACAGACCAAA  296

Query 297  ACCTGGAAACAAGAGGCCCCTTTCTGCACTTTACAGACTTGAATCAAAGGAACCTTTCCTGTCTGTTGGCGGTT  370
           .|||||||..|||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 297  GCCTGGAAGTAAGAGACCCCTGTCAGCCCTGTACAGGCTTGAATCAAAGGAGCCATTCCTGTCTGTTGGTGGTT  370

Query 371  ATGTCTTTGACTATGATTACTACAGAGATGATTTCTACAATCGGTTATTTGATTACCACGGGCGTGTGCCTCCA  444
           |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 371  ACGTATTTGACTACGATTACTACAGAGATGATTTCTACAATCGGCTGTTTGATTACCATGGCCGTGTACCTCCG  444

Query 445  CCTCCCCGTGCAGTAATTCCGCTGAAGCGTCCCAGAGTGGCAGTCACAACGACTCGCAGGGGGAAAGGAGTCTT  518
           |||||.||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 445  CCTCCTCGAGCTGTCATCCCACTCAAACGTCCCAGAGTGGCTGTCACCACCACACGCAGGGGCAAAGGCGTCTT  518

Query 519  TTCCATGAAAGGTGGATCGAGATCTACTGCCAGTGGG------TCAACAGGTTCTAAATTGAAATCAGATGAGT  586
           ||||||||||||.|||||.||||||||||...|||||      |||.||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 519  TTCCATGAAAGGGGGATCCAGATCTACTGTTGGTGGGTCATCTTCATCAGGCTCTAAGTTGAAATCAGATGAGT  592

Query 587  TACAGACCATCAAGAAAGAATTAACCCAGATCAAAACTAAAATTGACTCCTTGCTAGGGCGCCTGGAGAAGATT  660
           |||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593  TACAGACAATCAAGAAAGAATTAACTCAGATCAAAACCAAAATTGACTCCTTGCTGGGGCGCCTGGAGAAGATT  666

Query 661  GAGAAACAGCAGAAGGCGGAGGCAGAAGCTCAGAAGAAGCAATTGGAAGAGAGTCTAGTGCTGATCCAAGAGGA  734
           |||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||||||||||||.||
Sbjct 667  GAGAAGCAGCAAAAGGCAGAAGCAGAAGCTCAGAAGAAGCAATTGGAGGAGAGTATAGAGCTGATCCAAGACGA  740

Query 735  ATGTGTGTCAGAGATTGCAGATCACTCTACAGAGGAGCCTGCTGAAGGAGGGCCAGATGCCGATGGAGAAGAGA  808
           ||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||.|||||
Sbjct 741  ATGTGTGTCAGAGAATGCAGACCACTCCACAGAGGAGCCTGCTGAAGGAGGGCAAGAAGCTGATGGAGGAGAGA  814

Query 809  TGACAGATGGGATAGAGGAGGACTTCGATGAAGATGGGGGTCATGAGCTGTTTCTACAGATAAAG  873
           ||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815  TGACTGATGGGGTAGAGGAGGACTTCGATGAAGATGGGGGTCACGAGCTGTTTCTACAGATAAAG  879