Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04966
• Subject: XM_005273783.3
• Aligned Length: 1143
• Identities: 937
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGGCCCTAAAGGCCGAGGGCGCCGCACTCGACTGCTTCGAGGTGACGCTGAAATGCGAGGAAGGGGAGGACGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCTAAAGGCCGAGGGCGCCGCACTCGACTGCTTCGAGGTGACGCTGAAATGCGAGGAAGGGGAGGACGA  74

Query   75  GGAGGAGGCCATGGTGGTGGCCGTAATTCCGCGGCCCGAGCCGATGCTCAGAGTGACCCAACAGGAGAAGACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGAGGCCATGGTGGTGGCCGTAATTCCGCGGCCCGAGCCGATGCTCAGAGTGACCCAACAGGAGAAGACCC  148

Query  149  CACCGCCTAGACCCAGCCCGCTAGAGGCAGGCAGTGATGGCTGTGAGGAGCCGAAGCAGCAGGTGTCTTGGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACCGCCTAGACCCAGCCCGCTAGAGGCAGGCAGTGATGGCTGTGAGGAGCCGAAGCAGCAGGTGTCTTGGGAG  222

Query  223  CAGGAGTTCCTGGTGGGCAGCAGCCCAGGAGGCAGCGGGCGGGCACTGTGCATGGTGTGTGGCGCTGAGATCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGTTCCTGGTGGGCAGCAGCCCAGGAGGCAGCGGGCGGGCACTGTGCATGGTGTGTGGCGCTGAGATCCG  296

Query  297  GGCACCCTCGGCCGACACAGCTCGCTCGCACATCTTGGAGCAGCACCCTCACACCTTGGACCTGAGCCCTTCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCACCCTCGGCCGACACAGCTCGCTCGCACATCTTGGAGCAGCACCCTCACACCTTGGACCTGAGCCCTTCTG  370

Query  371  AGAAGAGCAATATCCTGGAGGCCTGGAGTGAAGGGGTGGCCCTCTTGCAAGACGTGAGAGCTGAGCAGCCGTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGAGCAATATCCTGGAGGCCTGGAGTGAAGGGGTGGCCCTCTTGCAAGACGTGAGAGCTGAGCAGCCGTCC  444

Query  445  CCACCCAACTCAGACTCGGGCCAGGATGCCCACCCAGACCCAGACGCCAACCCAGACGCTGCCAGAATGCCAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACCCAACTCAGACTCGGGCCAGGATGCCCACCCAGACCCAGACGCCAACCCAGACGCTGCCAGAATGCCAGC  518

Query  519  CGAAATCGTCGTTCTCCTTGACTCTGAGGATAACCCATCCCTCCCTAAAAGGAGCAGGCCCAGGGGACTCCGCC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAAATCGTCGTTCTCCTTGACTCTGAGGATAACCCATCCCTCCCTAAAAGGAGCCGGCCCAGGGGACTCCGCC  592

Query  593  CCCTCGAGCTTCCTGCTGTCCCTGCCACAGAGCCAGGAAATAAGAAGCCCCGTGGTCAGAGATGGAAGGAACCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTCGAGCTTCCTGCTGTCCCTGCCACAGAGCCAGGAAATAAGAAGCCCCGTGGTCAGAGATGGAAGGAACCC  666

Query  667  CCAGGGGAAGAGCCAGTCAGAAAGAAAAGAGGCAGACCTATGACCAAAAACCTGGACCCTGACCCAGAGCCCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGGGGAAGAGCCAGTCAGAAAGAAAAGAGGCAGACCTATGACCAAAAACCTGGACCCTGACCCAGAGCCCCC  740

Query  741  ATCGCCAGACTCGCCCACGGAGACTTTCGCAGCACCAGCCGAGGTCCGACACTTCACTGACGGCAGCTTCCCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCGCCAGACTCGCCCACGGAGACTTTCGCAGCACCAGCCGAGGTCCGACACTTCACTGACGGCAGCTTCCCCG  814

Query  815  CCGGCTTCGTCTTGCAGCTCTTCTCCCACACCCAGCTCAGGGGCCCAGACAGCAAGGACTCACCCAAAGACAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGGCTTCGTCTTGCAGCTCTTCTCCCACACCCAGCTCAGGGGCCCAGACAGCAAGGACTCACCCAAAGACAGG  888

Query  889  GAAGTGGCAGAAGGAGGCCTTCCCCGGGCGGAGAGCCCCTCTCCAGCTCCCCCTCCGGGGCTCCGCGGGACACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|..||                    
Sbjct  889  GAAGTGGCAGAAGGAGGCCTTCCCCGGGCGGAGAGCCCCTCTCCAGTTTCAGCT--------------------  942

Query  963  GGATCTCCAGGTTATCCGCGTGCGGATGGAGGAGCCCCCAGCGGTCAGCCTCCTGCAAGACTGGTCCAGGCACC  1036
                                                                                      
Sbjct  943  --------------------------------------------------------------------------  942

Query 1037  CCCAGGGCACCAAGCGTGTGGGAGCAGGTGACACCTCAGACTGGCCCACAGTTCTGTCAGAATCCAGCACCACT  1110
                                                                                      
Sbjct  943  --------------------------------------------------------------------------  942

Query 1111  GTGGCAGGGAAGCCGGAAAAAGGGAATGGAGTG  1143
                                             
Sbjct  943  ---------------------------------  942