Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_04967
Subject:
NM_173589.4
Aligned Length:
1791
Identities:
1791
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGTCCCGGAGGAGAGGAGGGTAGGTTTGTCTTCTGATGAGACATCATCTGATTCCCTTAAGTCTTGGCACTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCCCGGAGGAGAGGAGGGTAGGTTTGTCTTCTGATGAGACATCATCTGATTCCCTTAAGTCTTGGCACTC  74

Query   75  CATATGTGTCTTGGACAGCAAAGAACAGCCCTTGGCCTGCCAGCAGAAACAGAGGCAGTTCGTGAAGCCAGTGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATATGTGTCTTGGACAGCAAAGAACAGCCCTTGGCCTGCCAGCAGAAACAGAGGCAGTTCGTGAAGCCAGTGA  148

Query  149  CTGAGTCAGAGCAGCCCACAGTGCTGGAACTCCTGCTAGCTGAGCTCCGAACTCTGTTCTCAGCTGTGTTGCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGAGTCAGAGCAGCCCACAGTGCTGGAACTCCTGCTAGCTGAGCTCCGAACTCTGTTCTCAGCTGTGTTGCAG  222

Query  223  GACAGTAGCCCTGCAGCTTGGCGCTATCTTCATGCAGTACTGGGTCTACTGCCTCCATATCGTGAGTTGCTAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGTAGCCCTGCAGCTTGGCGCTATCTTCATGCAGTACTGGGTCTACTGCCTCCATATCGTGAGTTGCTAGT  296

Query  297  TGGCCACCTTGATTTGCTGCCCTTCCTGGAGCAGCTGTACTGCTGGGCACCCTGGGTCCAAACCCACCTCCATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCCACCTTGATTTGCTGCCCTTCCTGGAGCAGCTGTACTGCTGGGCACCCTGGGTCCAAACCCACCTCCATC  370

Query  371  TGGACCTGCTAGGTGCCATTGTCCAGGCCTTTCCTCCAGACAGCTCTTTGTTAGACAGTGCTTCCCATGCTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGACCTGCTAGGTGCCATTGTCCAGGCCTTTCCTCCAGACAGCTCTTTGTTAGACAGTGCTTCCCATGCTGAC  444

Query  445  TGCTGTCCCCAGAAGCGGAGGCTCCATCACAGGCCCCCATGCCCAGCTTGCCCTTTTGTGCAGGCCCAGTGGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCTGTCCCCAGAAGCGGAGGCTCCATCACAGGCCCCCATGCCCAGCTTGCCCTTTTGTGCAGGCCCAGTGGAG  518

Query  519  CAGGCAGCAAGTAAAGGAGGAGCTGGCCACCTGGCTGCGACCATTGACACTGCCTGAGCTACAGCGCTGCCTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGGCAGCAAGTAAAGGAGGAGCTGGCCACCTGGCTGCGACCATTGACACTGCCTGAGCTACAGCGCTGCCTGG  592

Query  593  GCATTGTTGGTGCTCAGGTGGCCCTAGAAGAGGCTGTGTGGCTGGATGGACTTAGTCTCCTTCCCTTGGCACTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCATTGTTGGTGCTCAGGTGGCCCTAGAAGAGGCTGTGTGGCTGGATGGACTTAGTCTCCTTCCCTTGGCACTG  666

Query  667  GCAGCGGACATCCCTGTACGGTATGAAAGCAGTGACACTGACAATGCAGAGGTGGAGCCTGTTGGAAGAAAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAGCGGACATCCCTGTACGGTATGAAAGCAGTGACACTGACAATGCAGAGGTGGAGCCTGTTGGAAGAAAAGA  740

Query  741  GACCAGGTCTCAGCTTGACTATGAAGTTCCCAGGGAAAAGGCCTTCCAAAAGAGCAGCACCGGCTTTTCACCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACCAGGTCTCAGCTTGACTATGAAGTTCCCAGGGAAAAGGCCTTCCAAAAGAGCAGCACCGGCTTTTCACCTG  814

Query  815  AGACTTCCTTCCTGGATAGCCAGGTGATGACTGCTCTGAAGATGGAGAGATACCTGAAGAAGATCCACTTCCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGACTTCCTTCCTGGATAGCCAGGTGATGACTGCTCTGAAGATGGAGAGATACCTGAAGAAGATCCACTTCCTC  888

Query  889  TATCTCAATGTGGCTCCCAGCCGGTACTTTAGGCCTTACAGCCTGATGGTGGTGCCACCCGACAAGGTGAATCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATCTCAATGTGGCTCCCAGCCGGTACTTTAGGCCTTACAGCCTGATGGTGGTGCCACCCGACAAGGTGAATCC  962

Query  963  CGAGCACTACATCTTCTCTCCCTTTGGGATCTTGCATGTACATCCTGTGGAAGGTAGCGAGACGATGACACTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGAGCACTACATCTTCTCTCCCTTTGGGATCTTGCATGTACATCCTGTGGAAGGTAGCGAGACGATGACACTGG  1036

Query 1037  GTACCTGGCACCATCACTGTGTTCTCTGGCAGCAGCTCCAGTTCATTCCATTCTTTAAGTATTGCCTCTTACGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTACCTGGCACCATCACTGTGTTCTCTGGCAGCAGCTCCAGTTCATTCCATTCTTTAAGTATTGCCTCTTACGC  1110

Query 1111  AAGTCCTTTACCTGTTGGAAGAAGAATGTGAGATTACAGGGGCTGCATCGACTCCAGAAATTCCTAGAGAATCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGTCCTTTACCTGTTGGAAGAAGAATGTGAGATTACAGGGGCTGCATCGACTCCAGAAATTCCTAGAGAATCA  1184

Query 1185  TCTGCTCTTGGCTGTGCCCCACTTTGGAGCTGGGCTACTCCATATTAGCAGGCTTCTGCAGGAGCTACACTCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTGCTCTTGGCTGTGCCCCACTTTGGAGCTGGGCTACTCCATATTAGCAGGCTTCTGCAGGAGCTACACTCTG  1258

Query 1259  TGTCCTGGCTACCCCAGGAACTGGATCGGTGCTATGAGCTGCTGGACCTGCAGACGGCTCTAGCCGAGGAGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTCCTGGCTACCCCAGGAACTGGATCGGTGCTATGAGCTGCTGGACCTGCAGACGGCTCTAGCCGAGGAGAAG  1332

Query 1333  CATAAGGCTCTACGGCTGCTCCATCGTTGCCTAAACCTCTGCACATCCATTCTTCGACTGGTTCACGAGGACAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATAAGGCTCTACGGCTGCTCCATCGTTGCCTAAACCTCTGCACATCCATTCTTCGACTGGTTCACGAGGACAC  1406

Query 1407  ATACCACATGCAACAGTGCCTACAGGAGCGAGTACAAAACTGTGACAGGATCAGGACAGGCCAAGGCTCCATAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATACCACATGCAACAGTGCCTACAGGAGCGAGTACAAAACTGTGACAGGATCAGGACAGGCCAAGGCTCCATAT  1480

Query 1481  ACCTTCAGAGGGTACAGCACAAGCAACTGGAGCAGAAGCTGAAGCAAGCAGAGGCCTGGTGGCTGCAGCTGGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACCTTCAGAGGGTACAGCACAAGCAACTGGAGCAGAAGCTGAAGCAAGCAGAGGCCTGGTGGCTGCAGCTGGGA  1554

Query 1555  AAGTTTGCCCGCCTGGTTGACTACATGATTTGTCAGAGCCTCATTTCTGTCTTGGAAGAGCAGATAACCTCTTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGTTTGCCCGCCTGGTTGACTACATGATTTGTCAGAGCCTCATTTCTGTCTTGGAAGAGCAGATAACCTCTTT  1628

Query 1629  TGTGGCCAACATCCTTCAAGCCCCAAGGCAGAAACCCTTTCTCTCATCACAGCTGGTCTTTGATGATCATGGTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTGGCCAACATCCTTCAAGCCCCAAGGCAGAAACCCTTTCTCTCATCACAGCTGGTCTTTGATGATCATGGTC  1702

Query 1703  AACTGTCTCATGTGCCCTGTGTTGAAAATATGATCCAGACTCTAACTGGAGGCCTACAGTCTGTCAAGACCTCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AACTGTCTCATGTGCCCTGTGTTGAAAATATGATCCAGACTCTAACTGGAGGCCTACAGTCTGTCAAGACCTCT  1776

Query 1777  GCCTTGCAGGTATTC  1791
            |||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCTTGCAGGTATTC  1791