Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05019
• Subject: NM_178640.2
• Aligned Length: 1516
• Identities: 1306
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGG---CTGCGGCTGCG  71
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||   ||..||||.||
Sbjct    1  ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCTTGCGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCACCTCTGGCTCCG  74

Query   72  CTCCCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTGCAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTA  145
            .|||||||||..|.||..|..|.|||||.||.||.|.||||||||.|..||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct   75  TTCCCCGCCGGACCCCCACAACACCGGGCCCAGCGCGGCAGATCAATCAGCCTTATTTCCTCACTGGAAATTTA  148

Query  146  CTCACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTTGTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACC  219
            ..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|.||||
Sbjct  149  GCCACTATGATGTGGTAGTTGGTGTGTTATCAGCTCGAAATAACCACGAACTTCGAAATGTGATAAGGAACACC  222

Query  220  TGGATG-AGACATTTGCTACAGCATCCCACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATG  292
            |||.|| ||| |||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct  223  TGGCTGAAGA-ATTTGCTGCATCATCCTACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCCCGTG  295

Query  293  GCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAAGATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTG  366
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||...|||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  296  GCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAGGATCCTTACTCCTGCCGACTGCTCAACATCACCAATCCAGTTTTG  369

Query  367  AATCAGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTCC-GAAGA---CACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCA  436
            |||||.||||||||.||.||||| ||.||| |||||   |.|.|||||..|.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  370  AATCAAGAAATTGAGGCATTCAG-CTTTCCTGAAGATGCCTCCTCATCTAGACTCTCTGAAGACCGAGTTGTCA  442

Query  437  GCGTGAGTTTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGT  510
            |||||||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct  443  GCGTGAGCTTCAGAGTTCTCTACCCAATCGTGATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAGTGATGTTGGT  516

Query  511  TTCCAGAGGAACATCACTGTCAAACTTTATCAGGCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCC  584
            ||.||.|||||||||||.|||||..|.||||||.||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct  517  TTTCAAAGGAACATCACAGTCAAGTTGTATCAGACAGAGCAGGAGGAGGCCCTTTTCATCGCCCGATTCAGTCC  590

Query  585  TCCAAGCTGTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTGGTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTG  658
            ||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  TCCAAGTTGTGGCGTACAAGTGAACAAGCTCTGGTATAAGCCCGTGGAACAGTTCATCTTACCAGAGAGCTTTG  664

Query  659  AAGGTACAATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCCACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAAT  732
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||.|||||||||||||
Sbjct  665  AAGGTACAATCGTGTGGGAAAGCCAAGATCTCCATGGCCTCGTGTCCAGAAACCTGCACAGAGTGACAGTGAAT  738

Query  733  GATGGAGGGGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCTGGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGA  806
            |||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||.||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  739  GATGGAGGGGGTGTTCTCAGAGTCCTTGCAGCTGGGGAAGGGGCACTGCCTCATGAATTCATGGAAGGTGTGGA  812

Query  807  GGGAGTTGCAGGTGGTTTTATATATACTATTCAGGAAGGTGATGCTCTCTTACACAA-CCTTCATTCTCGCCCT  879
            |||||||||.|||||.|||||.||.|||.||||||||||||||||.||.||| |.|| ||||.|||||||.||.
Sbjct  813  GGGAGTTGCGGGTGGCTTTATCTACACTGTTCAGGAAGGTGATGCACTATTA-AGAAGCCTTTATTCTCGGCCC  885

Query  880  CAAAGACTTATTGATCATATA-AGGAATCTCCATGAGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATG  952
            ||.||||||...|||||.||| ||| ||||.||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||..||.|||
Sbjct  886  CAGAGACTTGCAGATCACATACAGG-ATCTGCAGGTGGAAGATGCCTTACTGCAGGAGGAAAGCAGTGTCCATG  958

Query  953  ATGATATTGTTTTTGTGGATGTTGTCGACACTTATCGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGG  1026
            |.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  959  ACGACATTGTCTTCGTGGATGTTGTGGATACTTACCGGAATGTTCCTGCAAAATTACTGAACTTCTATAGATGG  1032

Query 1027  ACTGTGGAAACAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAAGACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATT  1100
            |||||||||.|.||.||||||.|||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|.||||||||.||
Sbjct 1033  ACTGTGGAATCCACCAGCTTCGATTTGCTGCTCAAGACAGATGACGACTGTTATATAGACTTAGAAGCTGTGTT  1106

Query 1101  TAATAGGATTGTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTG  1174
            ||||||.||||..||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|
Sbjct 1107  TAATAGAATTGCTCAGAAGAATCTAGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGGTTGAATTGGGCAGTGG  1180

Query 1175  ACCGAACCGGAAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCGAGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATAT  1248
            ||.||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1181  ACAGAACCGGAAAATGGCAGGAGCTGGAATACCCGAGCCCGGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGGTAT  1254

Query 1249  GTGATCTCCAAGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAGCAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGT  1322
            ||||||||||||||.|||||..|.|||||||||.|||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  GTGATCTCCAAGGATATCGTTGACTGGCTGGCAGGCAACTCCAGAAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGT  1328

Query 1323  AAGCATGGGCATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTAAAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCT  1396
            .|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1329  CAGCATGGGCATTTGGATGGCAGCCATAGGACCTAAAAGACACCAGGACAGCCTGTGGCTGTGTGAGAAAACCT  1402

Query 1397  GTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCTCCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGG  1470
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||....||.||||...||||.|||.||||||||||.|.|
Sbjct 1403  GTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTACTCACCAGAAGAGCTGAGCAAACTCTGGGAACTGAAGGAGCTG  1476

Query 1471  TGCGGTGATCCTTGTCGATGTCAAGCAAGA------  1500
            ||.||.||||||||||..|||.||||||.|      
Sbjct 1477  TGTGGGGATCCTTGTCAGTGTGAAGCAAAAGTACGA  1512