Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05039
• Subject: XM_006724150.3
• Aligned Length: 1821
• Identities: 1662
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGGCGTTCAGGAGACAAGTGAAAAACTTTGTGAAAAATTACTCAGATGCTGAAATAAAAGTCAGGGAAGCAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTCTAACGACCCTTGGGGTCCCTCTAGTTCTCTGATGTTAGATATCAGTGACTTGACTTTCAACACAATTTCTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTCAGAGATTATGAATATGCTGTGGCACAGACTCAATGACCATGGGAAGAACTGGCGCCACGTGTATAAATCC  222
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------ATGAATATGCTGTGGCACAGACTCAATGACCATGGGAAGAACTGGCGCCACGTGTATAAATCC  63

Query  223  CTTACCCTAATGGATTATCTCATCAAGAATGGATCAAAGAAAGTTATTCAGCATTGCAGAGAGGGGTTCTGTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   64  CTTACCCTAATGGATTATCTCATCAAGAATGGATCAAAGAAAGTTATTCAGCATTGCAGAGAGGGGTTCTGTAA  137

Query  297  CCTTCAAACACTAAAAGATTTTCAGCACATAGATGAAGCTGGAAAAGACCAAGGTTATTATATCCGGGAAAAAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  CCTTCAAACACTAAAAGATTTTCAGCACATAGATGAAGCTGGAAAAGACCAAGGTTATTATATCCGGGAAAAAT  211

Query  371  CTAAGCAAGTCATCACATTGCTGATGGATGAACCATTGCTGTGTAAAGAGAGGGAAGTGGCATGTCGGACTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  CTAAGCAAGTCATCACATTGCTGATGGATGAACCATTGCTGTGTAAAGAGAGGGAAGTGGCATGTCGGACTAGA  285

Query  445  CAGCGTACCTCCCACTCTATATTGTTTTCTAAAAGACAACTTGGTTCAAGTAACTCACTGACAGCGTGCACTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  CAGCGTACCTCCCACTCTATATTGTTTTCTAAAAGACAACTTGGTTCAAGTAACTCACTGACAGCGTGCACTTC  359

Query  519  TGCCCCCACACCGGATATTTCTGCTTCAGAGAAGAAGTATAAGCTTCCTAAGTTTGGAAGGTTACATAATAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  TGCCCCCACACCGGATATTTCTGCTTCAGAGAAGAAGTATAAGCTTCCTAAGTTTGGAAGGTTACATAATAAAA  433

Query  593  GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC  507

Query  667  CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC  581

Query  741  AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT  655

Query  815  GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG  729

Query  889  GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC  803

Query  963  AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG  877

Query 1037  ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878  ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA  951

Query 1111  TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  952  TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA  1025

Query 1185  GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGGGTTTCAACTGCTTCTGAGGGAGCATCTTCCTTTTCTCCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGGGTTTCAACTGCTTCTGAGGGAGCATCTTCCTTTTCTCCTT  1099

Query 1259  TATCCATGTCATCTCCTGATTTAGCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  TATCCATGTCATCTCCTGATTTAGCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT  1173

Query 1333  TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA  1247

Query 1407  TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC  1321

Query 1481  TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC  1395

Query 1555  CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA  1469

Query 1629  AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA  1543

Query 1703  CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG  1617

Query 1777  TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC  1821
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618  TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC  1662