Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05039
• Subject: XM_006724151.2
• Aligned Length: 1821
• Identities: 1480
• Gaps: 339

Alignment

Query    1  ATGGCGTTCAGGAGACAAGTGAAAAACTTTGTGAAAAATTACTCAGATGCTGAAATAAAAGTCAGGGAAGCAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTCTAACGACCCTTGGGGTCCCTCTAGTTCTCTGATGTTAGATATCAGTGACTTGACTTTCAACACAATTTCTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTCAGAGATTATGAATATGCTGTGGCACAGACTCAATGACCATGGGAAGAACTGGCGCCACGTGTATAAATCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTTACCCTAATGGATTATCTCATCAAGAATGGATCAAAGAAAGTTATTCAGCATTGCAGAGAGGGGTTCTGTAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCTTCAAACACTAAAAGATTTTCAGCACATAGATGAAGCTGGAAAAGACCAAGGTTATTATATCCGGGAAAAAT  370
                                            |||    ||||       |..|||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------ATG----TGGA-------ACTGTTATTATATCCGGGAAAAAT  31

Query  371  CTAAGCAAGTCATCACATTGCTGATGGATGAACCATTGCTGTGTAAAGAGAGGGAAGTGGCATGTCGGACTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  CTAAGCAAGTCATCACATTGCTGATGGATGAACCATTGCTGTGTAAAGAGAGGGAAGTGGCATGTCGGACTAGA  105

Query  445  CAGCGTACCTCCCACTCTATATTGTTTTCTAAAAGACAACTTGGTTCAAGTAACTCACTGACAGCGTGCACTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  106  CAGCGTACCTCCCACTCTATATTGTTTTCTAAAAGACAACTTGGTTCAAGTAACTCACTGACAGCGTGCACTTC  179

Query  519  TGCCCCCACACCGGATATTTCTGCTTCAGAGAAGAAGTATAAGCTTCCTAAGTTTGGAAGGTTACATAATAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  TGCCCCCACACCGGATATTTCTGCTTCAGAGAAGAAGTATAAGCTTCCTAAGTTTGGAAGGTTACATAATAAAA  253

Query  593  GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254  GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC  327

Query  667  CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  328  CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC  401

Query  741  AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  402  AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT  475

Query  815  GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  476  GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG  549

Query  889  GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC  623

Query  963  AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG  697

Query 1037  ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698  ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA  771

Query 1111  TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  772  TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA  845

Query 1185  GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGGGTTTCAACTGCTTCTGAGGGAGCATCTTCCTTTTCTCCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGGGTTTCAACTGCTTCTGAGGGAGCATCTTCCTTTTCTCCTT  919

Query 1259  TATCCATGTCATCTCCTGATTTAGCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920  TATCCATGTCATCTCCTGATTTAGCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT  993

Query 1333  TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA  1067

Query 1407  TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068  TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC  1141

Query 1481  TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142  TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC  1215

Query 1555  CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216  CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA  1289

Query 1629  AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290  AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA  1363

Query 1703  CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364  CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG  1437

Query 1777  TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC  1821
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438  TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC  1482