Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05039
- Subject:
- XM_011529927.2
- Aligned Length:
- 1821
- Identities:
- 1758
- Gaps:
- 63
Alignment
Query 1 ATGGCGTTCAGGAGACAAGTGAAAAACTTTGTGAAAAATTACTCAGATGCTGAAATAAAAGTCAGGGAAGCAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTTCAGGAGACAAGTGAAAAACTTTGTGAAAAATTACTCAGATGCTGAAATAAAAGTCAGGGAAGCAAC 74
Query 75 TTCTAACGACCCTTGGGGTCCCTCTAGTTCTCTGATGTTAGATATCAGTGACTTGACTTTCAACACAATTTCTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCTAACGACCCTTGGGGTCCCTCTAGTTCTCTGATGTTAGATATCAGTGACTTGACTTTCAACACAATTTCTC 148
Query 149 TCTCAGAGATTATGAATATGCTGTGGCACAGACTCAATGACCATGGGAAGAACTGGCGCCACGTGTATAAATCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTCAGAGATTATGAATATGCTGTGGCACAGACTCAATGACCATGGGAAGAACTGGCGCCACGTGTATAAATCC 222
Query 223 CTTACCCTAATGGATTATCTCATCAAGAATGGATCAAAGAAAGTTATTCAGCATTGCAGAGAGGGGTTCTGTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTACCCTAATGGATTATCTCATCAAGAATGGATCAAAGAAAGTTATTCAGCATTGCAGAGAGGGGTTCTGTAA 296
Query 297 CCTTCAAACACTAAAAGATTTTCAGCACATAGATGAAGCTGGAAAAGACCAAGGTTATTATATCCGGGAAAAAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTTCAAACACTAAAAGATTTTCAGCACATAGATGAAGCTGGAAAAGACCAAGGTTATTATATCCGGGAAAAAT 370
Query 371 CTAAGCAAGTCATCACATTGCTGATGGATGAACCATTGCTGTGTAAAGAGAGGGAAGTGGCATGTCGGACTAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTAAGCAAGTCATCACATTGCTGATGGATGAACCATTGCTGTGTAAAGAGAGGGAAGTGGCATGTCGGACTAGA 444
Query 445 CAGCGTACCTCCCACTCTATATTGTTTTCTAAAAGACAACTTGGTTCAAGTAACTCACTGACAGCGTGCACTTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGCGTACCTCCCACTCTATATTGTTTTCTAAAAGACAACTTGGTTCAAGTAACTCACTGACAGCGTGCACTTC 518
Query 519 TGCCCCCACACCGGATATTTCTGCTTCAGAGAAGAAGTATAAGCTTCCTAAGTTTGGAAGGTTACATAATAAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCCCCCACACCGGATATTTCTGCTTCAGAGAAGAAGTATAAGCTTCCTAAGTTTGGAAGGTTACATAATAAAA 592
Query 593 GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC 666
Query 667 CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC 740
Query 741 AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT 814
Query 815 GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG 888
Query 889 GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC 962
Query 963 AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG 1036
Query 1037 ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA 1110
Query 1111 TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA 1184
Query 1185 GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGGGTTTCAACTGCTTCTGAGGGAGCATCTTCCTTTTCTCCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGG---------------------------------------- 1218
Query 1259 TATCCATGTCATCTCCTGATTTAGCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219 -----------------------GCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT 1269
Query 1333 TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA 1343
Query 1407 TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC 1417
Query 1481 TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1418 TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC 1491
Query 1555 CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA 1565
Query 1629 AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566 AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA 1639
Query 1703 CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640 CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG 1713
Query 1777 TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC 1821
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1714 TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC 1758