Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05051
- Subject:
- XM_005246353.4
- Aligned Length:
- 1530
- Identities:
- 1386
- Gaps:
- 144
Alignment
Query 1 ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAGACAAAAAGACACTGAAGCCCCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAGACAAAAAGACACTGAAGCCCCA 74
Query 75 CCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATCATGGGCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATCATGGGCT 148
Query 149 CCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGACCGCCTGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGACCGCCTGG 222
Query 223 GTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTGGGCCCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCTGTGGGTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTG-------------------------------------- 258
Query 297 CCGCCAGACTGCGATCATTGGAGGGCTCGTCAACTCCCTGGGCTGGGTGTTGAGTGCCTATGCTGCAAACGTGC 370
Sbjct 259 -------------------------------------------------------------------------- 258
Query 371 ATTATCTCTTCATTACTTTTGGAGTCGCAGCTGGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGTGGTCATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 --------------------------------GGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGTGGTCATG 300
Query 445 GTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCGGTACGTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCGGTACGTT 374
Query 519 CCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAAGGTGCCG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 CCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAAGGTGCCG 448
Query 593 TTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTGGTAAAAACCCAAACGACCCAGGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 TTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTGGTAAAAACCCAAACGACCCAGGA 522
Query 667 GAGAAAGATGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGTCAACTGGACAGCAGGGAAGAACAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 GAGAAAGATGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGTCAACTGGACAGCAGGGAAGAACAGA 596
Query 741 AGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCAAGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 AGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCAAGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCG 670
Query 815 GGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCTGGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 GGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCTGGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGC 744
Query 889 TTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACAAATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 TTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACAAATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTT 818
Query 963 CTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCTCCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 CTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCTCCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACT 892
Query 1037 TATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAGTTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 TATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAGTTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTG 966
Query 1111 GGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTGTTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 967 GGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTGTTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAG 1040
Query 1185 TATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCATCTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 TATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCATCTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTG 1114
Query 1259 GTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTGAACACCTGGCCAATGCCTACGGCATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 GTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTGAACACCTGGCCAATGCCTACGGCATC 1188
Query 1333 ATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCAGGGTGGATCTATGACATCACGCAAAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 ATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCAGGGTGGATCTATGACATCACGCAAAA 1262
Query 1407 ATATGATTTTTCCTTCTACATATGTGGTTTGCTTTACATGATAGGAATACTCTTTTTACTTATTCAGCCGTGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 ATATGATTTTTCCTTCTACATATGTGGTTTGCTTTACATGATAGGAATACTCTTTTTACTTATTCAGCCGTGCA 1336
Query 1481 TTCGAATTATAGAACAATCCAGAAGAAAATACATGGATGGTGCACATGTT 1530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TTCGAATTATAGAACAATCCAGAAGAAAATACATGGATGGTGCACATGTT 1386