Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05051
- Subject:
- XM_006496551.3
- Aligned Length:
- 1556
- Identities:
- 1275
- Gaps:
- 46
Alignment
Query 1 ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAG-------ACAAAAAGACACTGA 67
||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||||| .|.||.|||| |.||.|||||.||||
Sbjct 1 ATGTATACGAGTCATGAAGATATCGGGTATGACCTTGAAGA-CGACCGAAAGGCTAAGAATAAGAAGACGCTGA 73
Query 68 AGCCCCACCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATC 141
|||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 74 AGCCCCACCCAGATATCGATGGCGGGTGGGCCTGGATGATGGTCCTCTCGTCCTTCTTTGTTCACATCCTCATC 147
Query 142 ATGGGCTCCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGAC 215
||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 148 ATGGGCTCACAGATGGCCCTAGGAGTCCTCAACGTGGAGTGGCTTGAAGAGTTTCACCAGAGCCGCGGCCTGAC 221
Query 216 CGCCTGGGTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTGGGCCCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCT 289
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 CGCCTGGGTCAGCTCCCTGAGCATGGGCATCACCTTGATCGTGGGACCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCT 295
Query 290 GTGGGTGCCGCCAGACTGCGATCATTGGAGGGCTCGTCAACTCCCTGGGCTGGGTGTTGAGTGCCTATGCTGCA 363
|.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 296 GCGGGTGCCGCCAGACAGCAATCATTGGAGGCCTGGTGAACTCCCTCGGCTGGGTGTTGAGCGCCTATGCAGCC 369
Query 364 AACGTGCATTATCTCTTCATTACTTTTGGAGTCGCAGCTGGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGT 437
||.|||||.|.||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 370 AATGTGCAGTCTCTCTTTATTACCTTTGGAGTGGCAGCAGGCCTTGGCAGTGGGATGGCTTACCTACCTGCAGT 443
Query 438 GGTCATGGTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCG 511
||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 444 GGTCATGGTGGGAAGGTACTTTCAGAAGAGACGAGCCCTGGCCCAGGGCCTCAGTACCACGGGGACAGGATTTG 517
Query 512 GTACGTTCCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAA 585
|.||||||||.|||||.|||.|||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||.||||||
Sbjct 518 GGACGTTCCTGATGACCGTGTTGCTGAAATACCTGTGCGCAGAATATGGCTGGCGGAATGCTATGTTCATCCAA 591
Query 586 GGTGCCGTTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTG----GTAAAAACCCAA 655
|||||..|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.| ||.|.| ||
Sbjct 592 GGTGCTCTGTCCCTGAACCTGTGTGTCTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCCGAGAAGTTAGA----AA 661
Query 656 ACGACCCAGGAGAGAAAGA----TGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGT--------CA 717
||..|||||.||.|.|||| ||||| .||.|||||..|||||||.||||||||.|||| |.
Sbjct 662 ACTGCCCAGAAGCGGAAGAGCCGTGTGC----TCTCCCAGCTTACTCCACTGAATCTGTTAAGTCTGGAGGACC 731
Query 718 ACTGGACAGCAGG---GAAGAACAGAAGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCA 788
||||| |||.| |||||||||.|.|||| |||.||||||.|||||||...|.||.|||||.||
Sbjct 732 ACTGG---GCATGGCTGAAGAACAGGACAGAA--------GGCCCGGGAATGAGGAGATGGTGTGTGACCTTCA 794
Query 789 AGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCGGGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCT 862
|.|.||||||||.|..|.|||..||...|..||||||||..||||||||.|||||.||||||||||.||.|||.
Sbjct 795 AACACAGGAGTGTCAAGGTCAAACCCATCCGAGGAAGAATGTGTGTGCCTTCCGGGTTCTGAAGACAGTGAGCC 868
Query 863 GGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGCTTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACA 936
.||||||..||..||||.|||.||||||...|||||||.|.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.
Sbjct 869 AGCTCACTGTGCAAGTCCGGAGGGGCTTTAGGGACTGGCACTCAGGCTATTTTGGGACGGCTTCACTCTTCACC 942
Query 937 AATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTTCTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCT 1010
||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 943 AACCGCATGTTTGTAGCCTTTATTTTCTGGGCTCTGTTCGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCTTTCATCCACCT 1016
Query 1011 CCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACTTATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAG 1084
.||.||||||||||.||||||||||||.||.||||||||.|||...|||||||||||.||.||||||||||||.
Sbjct 1017 GCCCGAAATCGTCAGTTTGTATAACTTGTCAGAGCAAAATGACACATTCCCTCTGACCTCGATTATAGCAATAC 1090
Query 1085 TTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTGGGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTG 1158
||||||||||.||.||.||||||.||||.|.|.|.||||||.|.||.||.||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1091 TTCACATCTTCGGGAAGGTGATCTTGGGGGCCGTGGCCGACCTCCCCTGTATCAGCGTCTGGAATGTCTTCCTC 1164
Query 1159 TTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAGTATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCAT 1232
.|.||.|||||||||||.||||||||.||.||..|||||||..||||||||||.|||||..|.|||||.|||||
Sbjct 1165 ATCGCTAACTTCACCCTCGTCCTCAGCATCTTCCTTCTGCCTCTGATGCACACCTACGCGAGTCTGGCTGTCAT 1238
Query 1233 CTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTGGTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTG 1306
.|||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||.|||||||||.||
Sbjct 1239 TTGTGCCCTAATTGGGTTTTCTAGCGGGTATTTCTCCCTCATGCCTGTGGTGACAGAGGACCTGGTTGGCACTG 1312
Query 1307 AACACCTGGCCAATGCCTACGGCATCATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCA 1380
|.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 1313 AGCACTTGGCCAATGCCTACGGCATCATCATCTGCGCCAATGGCATCTCAGCCTTACTAGGACCACCATTCGCA 1386
Query 1381 GGGTGGATCTATGACATCACGCAAAAATATGATTTTTCCTTCTACATATGTGGTTTGCTTTACATGATAGGAAT 1454
||.|||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct 1387 GGATGGATCTTTGACATCACCCAAAAATATGACTTTTCCTTTTATATATGTGGTTTGCTTTACATGGTAGGGAT 1460
Query 1455 ACTCTTTTTACTTATTCAGCCGTGCATTCGAATTATAGAACAATCCAGAAGAAAATACATGGATGGTGCACATG 1528
|||||||||.||.|||||.|||||.||||..||.|||||.|||||||||||.||.|.|||.||.||||||||||
Sbjct 1461 ACTCTTTTTGCTCATTCAACCGTGTATTCAGATGATAGATCAATCCAGAAGGAAGTGCATAGAGGGTGCACATG 1534
Query 1529 TT 1530
||
Sbjct 1535 TT 1536