Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05051
- Subject:
- XM_011510752.2
- Aligned Length:
- 1547
- Identities:
- 1416
- Gaps:
- 121
Alignment
Query 1 ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAGACAAAAAGACACTGAAGCCCCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAGACAAAAAGACACTGAAGCCCCA 74
Query 75 CCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATCATGGGCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATCATGGGCT 148
Query 149 CCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGACCGCCTGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGACCGCCTGG 222
Query 223 GTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTGGGCCCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCTGTGGGTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTGGGCCCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCTGTGGGTG 296
Query 297 CCGCCAGACTGCGATCATTGGAGGGCTCGTCAACTCCCTGGGCTGGGTGTTGAGTGCCTATGCTGCAAACGTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGCCAGACTGCGATCATTGGAGGGCTCGTCAACTCCCTGGGCTGGGTGTTGAGTGCCTATGCTGCAAACGTGC 370
Query 371 ATTATCTCTTCATTACTTTTGGAGTCGCAGCTGGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGTGGTCATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTATCTCTTCATTACTTTTGGAGTCGCAGCTGGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGTGGTCATG 444
Query 445 GTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCGGTACGTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCGGTACGTT 518
Query 519 CCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAAGGTGCCG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAAGGTGCCG 592
Query 593 TTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTGGTAAAAACCCAAACGACCCAGGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTGGTAAAAACCCAAACGACCCAGGA 666
Query 667 GAGAAAGATGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGTCAACTGGACAGCAGGGAAGAACAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGAAAGATGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGTCAACTGGACAGCAGGGAAGAACAGA 740
Query 741 AGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCAAGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCAAGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCG 814
Query 815 GGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCTGGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCTGGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGC 888
Query 889 TTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACAAATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACAAATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTT 962
Query 963 CTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCTCCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCTCCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACT 1036
Query 1037 TATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAGTTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAGTTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTG 1110
Query 1111 GGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTGTTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTGTTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAG 1184
Query 1185 TATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCATCTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCATCTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTG 1258
Query 1259 GTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTGAACACCTGGCCAATGCCTACGGCATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTGAACACCTGGCCAATGCCTACGGCATC 1332
Query 1333 ATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCAGG---------GTGGAT--CTATGAC 1395
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ...||| |.||||.
Sbjct 1333 ATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCAGGCCAAGAAGCCAAGATTGCAATGAG 1406
Query 1396 AT-CACGCAAAAATATGATTTTTCC-TTCTACATATGTG----GTTTGCTTTACATGATAGGAATACTCTTTTT 1463
|| ||.||.| || || |||||| ||..||| || ||.
Sbjct 1407 ATGCAAGCCA-------------CCGTT-----TATGTGCACTGTGGGCT---CA-GAG--------------- 1443
Query 1464 ACTTATTCAGCCGTGCATTCGAATTATAGAACAATCCAGAAGAAAATACATGGATGGTGCACATGTT 1530
Sbjct 1444 ------------------------------------------------------------------- 1443