Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05234
• Subject: XM_006510393.2
• Aligned Length: 1326
• Identities: 1131
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------ATGGATCAACCTAGTGGAAG  20
                                                                  |||||.||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCTTCAGAAGTAAACGCGTCTAGCCCTGCTCTGAACTTTTCAGAAAAGAAGATGGACCAGCCTAGTGGGAG  74

Query   21  AAGTTTCATGCAAGTATTATGTGAAAAATATAGTCCTGAAAATTTTCCTTATCGCCGTGGCCCGGGGATGGGAG  94
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||
Sbjct   75  AAGTTTCATGCAAGTATTGTGTGAAAAATACAGTCCTGAAAACTTCCCTTACCGCCGTGGCCCTGGGGTGGGAG  148

Query   95  TCCATGTCCCAGCCACACCTCAGGGCTCTCCTATGAAAGATCGCCTCAACCTCCCAAGTGTACTAGTGTTGAAC  168
            ||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct  149  TCCATGTCCCAGCCACTCCCCAGGGCTCGCCTATGAAAGATCGCCTCAACCTCCCGAGCGTGCTCGTGTTGAAC  222

Query  169  AGCTGTGGAATAACCTGTGCAGGAGATGAAAAAGAAATTGCTGCTTTCTGCGCTCATGTGTCGGAACTAGATCT  242
            |||||.||.||.|||||.||.||||||||||.||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  223  AGCTGCGGCATTACCTGCGCGGGAGATGAAAGAGAAATCGCAGCCTTCTGTGCTCACGTGTCAGAACTCGATCT  296

Query  243  TTCTGACAACAAACTCGAAGACTGGCATGAGGTCAGTAAAATTGTGTCAAATGTTCCTCAGTTGGAGTTTCTAA  316
            ||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  297  TTCTGACAACAAGCTCCAAGACTGGCATGAGGTCAGTAAGATTGTGTCAAATGTTCCTCAGCTGGAGTTTCTAA  370

Query  317  ACCTGAGTTCCAACCCTCTGAATTTGTCGGTTTTAGAAAGAACATGTGCTGGGTCCTTCTCTGGGGTTCGCAAA  390
            |||||||||||||.|||||||.|.||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTGAGTTCCAATCCTCTGAGTCTGTCAGTTCTAGAAAGAACATGTGCTGGGTCCTTCTCTGGGGTTCGCAAA  444

Query  391  CTTGTCCTCAACAACAGCAAAGCTTCTTGGGAGACGGTCCACATGATACTACAGGAGTTACCAGATTTGGAGGA  464
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||..|||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  CTTGTCCTCAACAACAGCAAAGCATCATGGGAAACAGTGCACACCATACTGCAGGAGTTGCCAGAGTTGGAGGA  518

Query  465  GCTCTTCCTGTGCCTTAATGACTATGAAACAGTGTCTTGTCCTTCTATTTGCTGTCATTCTCTTAAGCTACTAC  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  519  GCTCTTCCTGTGCCTTAATGACTATGAAACAGTGTCTTGTCCTTCTGTCTGCTGTCATTCCCTCAAGCTCCTAC  592

Query  539  ATATAACAGACAATAACCTCCAAGACTGGACTGAAATACGAAAGTTAGGAGTTATGTTTCCTTCACTGGATACC  612
            |.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATCACAGACAACAACCTCCAAGACTGGACTGAAATCCGAAAGCTGGGTGTAATGTTTCCTTCACTGGATACC  666

Query  613  CTCGTCCTGGCCAACAATCATTTGAATGCTATTGAGGAGCCTGATGATTCATTGGCCAGGTTGTTTCCTAATCT  686
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||.|||.||..||||.||||||||.||||||||
Sbjct  667  CTGGTCCTGGCCAACAATCACTTGAATGCAATCGAGGAGCCTGCTGACTCCCTGGCTAGGTTGTTCCCTAATCT  740

Query  687  TCGATCCATCAGCCTCCACAAGTCAGGTTTGCAGTCCTGGGAAGACATTGATAAACTAAATTCATTTCCCAAAC  760
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  741  GCGGTCCATCAGCCTCCACAAGTCAGGTTTGCAGTCCTGGGAAGACATTGACAAACTAAATTCATTCCCCAAGC  814

Query  761  TGGAAGAAGTGAGATTGTTAGGAATTCCTCTTCTGCAGCCATATACCACCGAGGAGCGAAGGAAATTGGTAATA  834
            |.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||..|.
Sbjct  815  TTGAAGAAGTGAGATTGCTAGGAATTCCTCTTCTACAGCCGTATACCACCGAGGAACGCAGGAAATTGGTGGTG  888

Query  835  GCCAGATTGCCATCAGTTTCCAAACTTAATGGCAGCGTTGTTACTGATGGTGAACGAGAAGATTCTGAGAGATT  908
            |||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct  889  GCCAGATTGCCCTCCGTTTCCAAACTCAATGGCAGTGTTGTGACGGATGGTGAGCGAGAGGATTCCGAGAGGTT  962

Query  909  TTTTATTCGTTACTATGTGGATGTTCCACAGGAAGAAGTGCCATTCAGGTATCATGAACTGATCACTAAATATG  982
            |||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||
Sbjct  963  TTTCATCCGGTACTACGTGGATGTTCCTCAGGAGGAAGTGCCATTCAGGTATCATGAGCTCATTACAAAATATG  1036

Query  983  GGAAGTTGGAGCCTTTGGCAGAAGTGGACCTAAGACCCCAGAGCAGTGCAAAAGTAGAAGTCCACTTTAACGAT  1056
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 1037  GGAAATTGGAGCCTTTGGCAGAAGTGGACCTAAGACCCCAGAGCAGTGCGAAAGTAGAAGTTCACTTCAATGAC  1110

Query 1057  CAGGTGGAAGAAATGAGCATTCGTCTGGACCAAACAGTGGCAGAACTAAAGAAACAGTTAAAAACTCTAGTACA  1130
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||.||||.||.||.||.||
Sbjct 1111  CAAGTGGAGGAAATGAGCATCCGCCTGGACCAGACAGTAGCCGAACTGAAGAAACAGCTAAAGACCCTGGTGCA  1184

Query 1131  ATTACCCACAAGCAACATGCTTCTCTACTATTTTGACCATGAAGCACCCTTTGGCCCAGAGGAAATGAAGTACA  1204
            .||.|||||.||||.|||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185  GTTGCCCACCAGCAGCATGCTTCTCTACTACTTTGACCACGAGGCCCCGTTTGGCCCAGAGGAGATGAAGTACA  1258

Query 1205  GCTCTCGGGCATTGCATTCCTTTGGCATTAGGGATGGAGATAAAATTTACGTGGAATCCAAAACAAAA  1272
            ||||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  GCTCCCGGGCACTGCACTCCTTTGGCATTAGGGATGGAGATAAAATTTTTGTGGAATCAAAAACAAAA  1326