Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05263
• Subject: NM_001143942.2
• Aligned Length: 709
• Identities: 564
• Gaps: 137

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGCACACGACCCAGAAGGACACGACGTACACCAAGATCTTCGTCGGGGGGCTGCCCTACCACACCACCGACGC  74

Query   1  ----------ATGTA--TGTATGTCT--------------------GTGTGT----------------------  20
                     |.|||  |..|.||||                    ||| ||                      
Sbjct  75  CAGCCTGCGCAAGTACTTCGAGGTCTTCGGCGAGATCGAGGAGGCGGTG-GTCATCACCGACCGGCAGACGGGC  147

Query  21  --GT-CTGTTGCTAAG-----GTCACCATGGCTGACCGGGCTGCTGCCGAAAGGGCCTGCAAGGATCCCAATCC  86
             || |.|..||||.|     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148  AAGTCCCGGGGCTATGGATTTGTCACCATGGCTGACCGGGCTGCTGCCGAAAGGGCCTGCAAGGATCCCAATCC  221

Query  87  CATCATTGATGGCAGAAAGGCCAACGTGAACCTGGCATACTTAGGAGCAAAACCAAGGATCATGCAACCAGGTT  160
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222  CATCATTGATGGCAGAAAGGCCAACGTGAACCTGGCATACTTAGGAGCAAAACCAAGGATCATGCAACCAGGTT  295

Query 161  TTGCCTTTGGTGTTCAACAACTTCATCCAGCCCTTATACAAAGACCTTTCGGGATACCTGCCCACTATGTCTAT  234
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296  TTGCCTTTGGTGTTCAACAACTTCATCCAGCCCTTATACAAAGACCTTTCGGGATACCTGCCCACTATGTCTAT  369

Query 235  CCGCAGGCTTTTGTGCAGCCGGGAGTGGTCATTCCACACGTCCAGCCGACAGCAGCTGCCGCCTCCACCACCCC  308
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370  CCGCAGGCTTTTGTGCAGCCGGGAGTGGTCATTCCACACGTCCAGCCGACAGCAGCTGCCGCCTCCACCACCCC  443

Query 309  TTACATTGATTACACTGGAGCTGCATACGCACAATACTCAGCAGCTGCTGCTGCTGCCGCCGCCGCTGCTGCCT  382
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444  TTACATTGATTACACTGGAGCTGCATACGCACAATACTCAGCAGCTGCTGCTGCTGCCGCCGCCGCTGCTGCCT  517

Query 383  ATGACCAGTACCCCTATGCAGCCTCTCCAGCTGCTGCAGGATATGTTACTGCTGGGGGCTATGGCTACGCAGTC  456
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518  ATGACCAGTACCCCTATGCAGCCTCTCCAGCTGCTGCAGGATATGTTACTGCTGGGGGCTATGGCTACGCAGTC  591

Query 457  CAGCAGCCAATCACCGCAGCGGCACCTGGGACAGCTGCCGCCGCCGCTGCAGCAGCTGCTGCCGCTGCAGCATT  530
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  CAGCAGCCAATCACCGCAGCGGCACCTGGGACAGCTGCCGCCGCCGCTGCAGCAGCTGCTGCCGCTGCAGCATT  665

Query 531  TGGCCAGTACCAGCCTCAGCAGCTGCAGACAGACCGAATGCAA  573
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666  TGGCCAGTACCAGCCTCAGCAGCTGCAGACAGACCGAATGCAA  708