Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05309
- Subject:
- NM_147061.1
- Aligned Length:
- 972
- Identities:
- 819
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGAGTCACACCAATGTTACCATCTTCCATCCTGCAGTTTTTGTCCTTCCTGGCATCCCTGGGTTGGAGGCTTA 74
||||.|||.|.|||..|.|||..|.||||.||||||.|||||||.||...||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATTCATAGCAACATCACCCCCATCCACCCTGCATTTTTTGTGCTAGTTGGCATCCCTGGGTTGGAGGCTTA 74
Query 75 TCACATTTGGCTGTCAATACCTCTTTGCCTCATTTACATCACTGCAGTCCTGGGAAACAGCATCCTGATAGTGG 148
|||.|..|||.||||.|||||.||.||||||||.||..|||||||||||||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct 75 TCATACCTGGTTGTCTATACCCCTGTGCCTCATGTATGTCACTGCAGTCCTTGGAAACAGCATCCTGATAATGG 148
Query 149 TTATTGTCATGGAACGTAACCTTCATGTGCCCATGTATTTCTTCCTCTCAATGCTGGCCGTCATGGACATCCTG 222
|.||..|||..|||||.||||||||||..|||||||||||.||||||||.|||.|||||.|||.|||||||.|.
Sbjct 149 TGATCATCACAGAACGGAACCTTCATGAACCCATGTATTTTTTCCTCTCCATGTTGGCCATCACGGACATCTTA 222
Query 223 CTGTCTACCACCACTGTGCCCAAGGCCCTAGCCATCTTTTGGCTTCAAGCACATAACATTGCTTTTGATGCCTG 296
|||||.|||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 CTGTCCACCACAACTGTGCCCAAGGCCCTCACCATCTTTTGGCTCCATGCCCACAACATTGCCTTTGATGCCTG 296
Query 297 TGTCACCCAAGGCTTCTTTGTCCATATGATGTTTGTGGGGGAGTCAGCTATCCTGTTAGCCATGGCCTTTGATC 370
|||||||||||.||||||||||||.|..|||||.|||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 TGTCACCCAAGTCTTCTTTGTCCACACAATGTTCGTGGGGGAGTCGGCCATCTTGTTAGCCATGGCCTTTGACC 370
Query 371 GCTTTGTGGCCATTTGTGCCCCACTGAGATATACAACAGTGCTAACATGGCCTGTTGTGGGGAGGATTGCTCTG 444
|||||.|.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|....||.||||||||||||||.
Sbjct 371 GCTTTATAGCCATCTGTGCCCCACTGAGATATGCAACAGTGCTAACATGGTCCACAGTTGGGAGGATTGCTCTA 444
Query 445 GCC---GTCATCACCCGAAGCTTCTGCATCATCTTCCCAGTCATATTCTTGCTGAAGCGGCTGCCCTTCTGCCT 515
||| ||||||| |||||.||||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 445 GCCATTGTCATCA---GAAGCATCTGTATTATCTTTCCTGTGATTTTCTTGCTGAAGCGGCTGCCGTTCTGCCG 515
Query 516 AACCAACATTGTTCCTCACTCCTACTGTGAGCATATTGGAGTGGCTCGTTTAGCCTGTGCTGACATCACTGTTA 589
|||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 516 AACCAACATCGTCCCCCATTCCTACTGTGAGCACATTGGGGTGGCCCGCTTAGCTTGTGCAGATATAACTGTTA 589
Query 590 ACATTTGGTATGGCTTCTCAGTGCCCATTGTCATGGTCATCTTGGATGTTATCCTCATCGCTGTGTCTTACTCA 663
||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 590 ACATCTGGTACGGCTTCTCCGTGCCCATCGTCATGGTCATTGTGGATGTGATTCTCATTGCTGTGTCGTACTCG 663
Query 664 CTGATCCTCCGAGCAGTGTTTCGTTTGCCCTCCCAGGATGCTCGGCACAAGGCCCTCAGCACTTGTGGCTCCCA 737
||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 664 CTCATTCTCCGAGCAGTGTTTCGCTTGCCCTCCCAGGATGCTCGGCACAAAGCTCTCAGCACCTGTGGCTCGCA 737
Query 738 CCTCTGTGTCATCCTTATGTTTTATGTTCCATCCTTCTTTACCTTATTGACCCATCATTTTGGGCGTAATATTC 811
|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||..||||||.|.||.||||
Sbjct 738 CCTCTGTGTCATCCTCATGTTTTACGTTCCATCCTTCTTTACTTTACTGACCCATCGCTTTGGGAGAAACATTC 811
Query 812 CTCAACATGTCCATATCTTGCTGGCCAATCTTTATGTGGCAGTGCCACCAATGCTGAACCCCATTGTCTATGGT 885
|.|.|||.||.||||||.|||||||||||||||||||||..||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 812 CCCGACACGTGCATATCCTGCTGGCCAATCTTTATGTGGTGGTACCACCAATGCTGAACCCCATTGTCTACGGA 885
Query 886 GTGAAGACTAAGCAGATACGTGAGGGTGTAGCCCACCGGTTCTTTGACATCAAGACTTGGTGCTGTACCTCCCC 959
|||||||||||.|||||.||.||||||||.|.||||.|||||||.||||||||||||..|||.|||.|.||.||
Sbjct 886 GTGAAGACTAAACAGATCCGGGAGGGTGTGGTCCACTGGTTCTTGGACATCAAGACTCTGTGTTGTTCTTCACC 959
Query 960 TCTGGGCTCA 969
|.||||.
Sbjct 960 TTTGGGA--- 966