Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05391
• Subject: NM_173653.4
• Aligned Length: 1935
• Identities: 1935
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGAGACAGTCAAGGGTTATGTCAGAAAAGGATGAGTATCAGTTTCAACATCAGGGAGCGGTGGAGCTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGACAGTCAAGGGTTATGTCAGAAAAGGATGAGTATCAGTTTCAACATCAGGGAGCGGTGGAGCTGCT  74

Query   75  TGTCTTCAATTTTTTGCTCATCCTTACCATTTTGACAATCTGGTTATTTAAAAATCATCGATTCCGCTTCTTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTCTTCAATTTTTTGCTCATCCTTACCATTTTGACAATCTGGTTATTTAAAAATCATCGATTCCGCTTCTTGC  148

Query  149  ATGAAACTGGAGGAGCAATGGTGTATGGCCTTATAATGGGACTAATTTTACGATATGCTACAGCACCAACTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAACTGGAGGAGCAATGGTGTATGGCCTTATAATGGGACTAATTTTACGATATGCTACAGCACCAACTGAT  222

Query  223  ATTGAAAGTGGAACTGTCTATGACTGTGTAAAACTAACTTTCAGTCCATCAACTCTGCTGGTTAATATCACTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGAAAGTGGAACTGTCTATGACTGTGTAAAACTAACTTTCAGTCCATCAACTCTGCTGGTTAATATCACTGA  296

Query  297  CCAAGTTTATGAATATAAATACAAAAGAGAAATAAGTCAGCACAACATCAATCCTCATCAAGGAAATGCTATAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAAGTTTATGAATATAAATACAAAAGAGAAATAAGTCAGCACAACATCAATCCTCATCAAGGAAATGCTATAC  370

Query  371  TTGAAAAGATGACATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTTCATGCAGGATAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGAAAAGATGACATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTTCATGCAGGATAT  444

Query  445  AGTCTAAAGAAGAGACACTTTTTTCAAAACTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTGCCATCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTCTAAAGAAGAGACACTTTTTTCAAAACTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTGCCATCTC  518

Query  519  CTGCATCGTCATAGGGTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATGATACATGCTGGCCAGCTGAAAAATGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCATCGTCATAGGGTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATGATACATGCTGGCCAGCTGAAAAATGGAG  592

Query  593  ACTTTCATTTCACTGACTGTTTATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGTGACAGTGCTGGCCATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTTCATTTCACTGACTGTTTATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGTGACAGTGCTGGCCATT  666

Query  667  TTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTCTTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTCTTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTGGC  740

Query  741  CATAGTCCTTACATATTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCATTTGATGCCGCAGCATTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATAGTCCTTACATATTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCATTTGATGCCGCAGCATTCT  814

Query  815  TCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTCGCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTCGCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCACA  888

Query  889  GCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAACCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCTTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAACCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCTTG  962

Query  963  GAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCTGCCGGCCTAACAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTCACACAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCTGCCGGCCTAACAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTCACACAAG  1036

Query 1037  CACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAAGAACTAAACAGTTGTTTGAATTTATGAACTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAAGAACTAAACAGTTGTTTGAATTTATGAACTTT  1110

Query 1111  TTGGCGGAGAACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCATATCTTTAATGCTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGGCGGAGAACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCATATCTTTAATGCTCT  1184

Query 1185  TTTTATACTTGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTATACTTGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCTGA  1258

Query 1259  ATCTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGGAGCGATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGGAGCGATC  1332

Query 1333  GCATTTGCCTTAGCTATTCGGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTCCTCGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCATTTGCCTTAGCTATTCGGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTCCTCGT  1406

Query 1407  GTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTTGACTTGGCTTCAGATCAGAGTTGGCGTGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTTGACTTGGCTTCAGATCAGAGTTGGCGTGG  1480

Query 1481  ACCTGGATGAAAATCTGAAGGAGGACCCCTCCTCACAACACCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGACG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACCTGGATGAAAATCTGAAGGAGGACCCCTCCTCACAACACCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGACG  1554

Query 1555  AAAGCAGAGAGTGCTCGGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTATCTGAAACCAATTTTAACCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAAGCAGAGAGTGCTCGGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTATCTGAAACCAATTTTAACCCA  1628

Query 1629  CTCTGGTCCTCCGCTGACTACAACATTACCTGAATGGTGTGGTCCGATTTCCAGGCTGCTTACCAGTCCTCAAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTCTGGTCCTCCGCTGACTACAACATTACCTGAATGGTGTGGTCCGATTTCCAGGCTGCTTACCAGTCCTCAAG  1702

Query 1703  CCTATGGGGAACAGCTAAAAGAGGATGATGTGGAATGCATTGTAAACCAGGATGAACTAGCCATAAATTACCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTATGGGGAACAGCTAAAAGAGGATGATGTGGAATGCATTGTAAACCAGGATGAACTAGCCATAAATTACCAG  1776

Query 1777  GAGCAAGCCTCCTCACCCTGCAGTCCTCCTGCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCAGACGCCAGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGCAAGCCTCCTCACCCTGCAGTCCTCCTGCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCAGACGCCAGG  1850

Query 1851  CAAGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGGCCTGGGAGGCTATGAACTCAAGCTTGAGCAAACTTTGGGTCAAT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAAGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGGCCTGGGAGGCTATGAACTCAAGCTTGAGCAAACTTTGGGTCAAT  1924

Query 1925  CCCAGTTGAAT  1935
            |||||||||||
Sbjct 1925  CCCAGTTGAAT  1935