Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05391
• Subject: NM_177909.5
• Aligned Length: 1944
• Identities: 1677
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGAGAGACAG--TCAAGGGTTATGTCAGAAAAGGATGAGTATCAGTTTCAACATCAGGGAGCGGTGGAGCTG  72
            ||||...|.|||  ||  ||.|||.|||||..||||||||..||||.||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct    1  ATGGCTGGGCAGCTTC--GGTTTACGTCAGGGAAGGATGAAGATCATTTTCAACACCAGGGAGCAGTGGAGCTA  72

Query   73  CTTGTCTTCAATTTTTTGCTCATCCTTACCATTTTGACAATCTGGTTATTTAAAAATCATCGATTCCGCTTCTT  146
            ||.|..||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct   73  CTCGCGTTTAATTTTTTGCTCATCCTTACCATTTTAACAATCTGGTTATTTAAAAATCACCGATTCCGCTTCTT  146

Query  147  GCATGAAACTGGAGGAGCAATGGTGTATGGCCTTATAATGGGACTAATTTTACGATATGCTACAGCACCAACTG  220
            ||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  147  GCATGAGACTGGAGGGGCGATGGTGTATGGCCTCATAATGGGACTAATTTTGCGATATGCCACAGCGCCGACTG  220

Query  221  ATATTGAAAGTGGAACTGTCTATGACTGTGTAAAACTAACT-----TTCAGTCCATCAACTCTGCTGGTTAATA  289
            |||||||.||||||||||||||..||||||     ..||||     |||||.|||||||||||.||.||.||.|
Sbjct  221  ATATTGATAGTGGAACTGTCTACAACTGTG-----GGAACTTGTTCTTCAGCCCATCAACTCTACTAGTCAACA  289

Query  290  TCACTGACCAAGTTTATGAATATAAATACAAAAGAGAAATAAGTCAGCACAACATCAATCCTCATCAAGGAAAT  363
            ||||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.||.|..||||||||.||||..||.||.|||||.||.
Sbjct  290  TCACCGACCAAGTTTATGAGTATAAGTACCAGAGAGAGATCAACCAGCACAATATCAGCCCCCACCAAGGCAAC  363

Query  364  GCTATACTTGAAAAGATGACATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTTCATGC  437
            ||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  364  GCCATACTGGAGAAGATGACGTTTGACCCAGAAATCTTCTTCAACGTTTTGCTGCCTCCCATCATATTTCATGC  437

Query  438  AGGATATAGTCTAAAGAAGAGACACTTTTTTCAAAACTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTG  511
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  438  AGGATACAGTCTGAAGAAGAGACACTTTTTTCAAAACTTGGGATCCATTTTAACATATGCCTTCTTGGGAACAG  511

Query  512  CCATCTCCTGCATCGTCATAGGGTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATGATACATGCTGGCCAGCTGAAA  585
            ||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.
Sbjct  512  CCATCTCCTGTGTGGTCATAGGGTTAATTATGTACGGCTTTGTGAAAGCCATGGTGCATGCTGGCCAGCTGAAG  585

Query  586  AATGGAGACTTTCATTTCACTGACTGTTTATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGTGACAGTGCT  659
            |..||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  AGCGGAGACTTCCACTTCACTGACTGTTTATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGTGACAGTGCT  659

Query  660  GGCCATTTTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTCTTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATG  733
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct  660  GGCCATTTTCCATGAACTCCACGTGGACCCAGACCTGTACACACTGCTGTTTGGAGAGAGTGTACTGAATGATG  733

Query  734  CAGTGGCCATAGTCCTTACATATTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCATTTGATGCCGCA  807
            |.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||..|.|||
Sbjct  734  CGGTGGCCATAGTCCTCACATACTCTATATCCATCTATAGTCCCAAGGAGAATCCCAACGCGTTTGACACGGCA  807

Query  808  GCATTCTTCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTCGCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCAT  881
            ||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..|
Sbjct  808  GCGTTCTTCCAATCCGTGGGCAATTTCCTAGGGATCTTTGCCGGCTCCTTTGCAATGGGCTCCGCATATGCAGT  881

Query  882  CATCACAGCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAACCGGCCTGTTTTTCCTGC  955
            ..|.||.||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct  882  TGTTACCGCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTCCGTGAGTTCCCGATGCTGGAGACAGGCCTGTTTTTCCTCC  955

Query  956  TTTCTTGGAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCTGCCGGCCTAACAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTC  1029
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  TTTCTTGGAGTGCCTTCCTGTCTGCAGAGGCCGCCGGCTTAACAGGCATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTC  1029

Query 1030  ACACAAGCACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAAGAACTAAACAGTTGTTTGAATTTAT  1103
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.||.||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1030  ACACAGGCACATTACACCTACAACAATCTGTCATCGGATTCCAAACTGAGGACCAAACAGCTGTTTGAATTTAT  1103

Query 1104  GAACTTTTTGGCGGAGAACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCATATCTTTA  1177
            ||||||..||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 1104  GAACTTCCTGGCTGAAAACGTCATCTTCTGCTACATGGGCCTGGCTCTGTTCACCTTCCAGAATCACATTTTCA  1177

Query 1178  ATGCTCTTTTTATACTTGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTC  1251
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1178  ATGCTCTTTTTATACTCGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATTTACCCCCTCTCCTTC  1251

Query 1252  CTCCTGAATCTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGG  1325
            |||||||||||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  CTCCTGAATCTGGGCAGAAAGCAGAAGATTCCCTGGAACTTCCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGG  1325

Query 1326  AGCGATCGCATTTGCCTTAGCTATTCGGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGC  1399
            .||.||.||.||.|||.|.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1326  TGCCATTGCCTTCGCCCTGGCCATCCGCAACACGGAATCTCAGCCCAAACAGATGATGTTCACCACCACACTGC  1399

Query 1400  TCCTCGTGTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTTGACTTGGCTTCAGATCAGAGTT  1473
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1400  TCCTTGTGTTCTTCACTGTCTGGGTGTTTGGAGGAGGAACGACCCCCATGCTGACGTGGCTTCAGATCAGAGTT  1473

Query 1474  GGCGTGGACCTGGATGAAAATCTGAAGGAGGACCCCTCCTCACAACACCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAA  1547
            ||.||||||||||||||||.|||||||||.||.||||||||   |||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1474  GGTGTGGACCTGGATGAAAGTCTGAAGGAAGAGCCCTCCTC---ACAGCAGGAAGCAAATAAGTTGGACAAAAA  1544

Query 1548  CATGACGAAAGCAGAGAGTGCTCGGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTATCTGAAACCAATTT  1621
            |||||||||..||||||||||.|.|||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||||||||.||..
Sbjct 1545  CATGACGAAGACAGAGAGTGCACAGCTCTTCAGAATGTGGTATGGATTTGACCACAAATACCTGAAACCCATCC  1618

Query 1622  TAACCCACTCTGGTCCTCCGCTGACTACAACATTACCTGAATGGTGTGGTCCGATTTCCAGGCTGCTTACCAGT  1695
            ||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.|..||||||||.||..|.|||||||||||.||||||
Sbjct 1619  TAACACACTCAGGCCCTCCACTGACCACCACCTTGCCAGCGTGGTGTGGCCCAGTCTCCAGGCTGCTCACCAGT  1692

Query 1696  CCTCAAGCCTATGGGGAACAGCTAAAAGAGGATGATGTGGAATGCATTGTAAACCAGGATGAACTAGCCATAAA  1769
            ||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1693  CCGCAGGCCTATGGGGAACAACTGAAAGAGGATGACGTGGAATGTATCGTCAACCAAGATGAACTGGCCATGAA  1766

Query 1770  TTACCAGGAGCA-AGCCTCCTCACCCTGCAGT-CCTCCTGCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCA  1841
            |||||||||||| |||| |.||||||.||||| ||.||..||| |||||.||||||||||||..|||||..|||
Sbjct 1767  TTACCAGGAGCAGAGCC-CTTCACCCAGCAGTCCCACCACCAA-GCTAGCTCTGGACCAGAAGTCTTCAGGCCA  1838

Query 1842  GACGCCAGGCAAGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGGCCTGGGAGGCTATGAACTCAAGCTTGAGCAAACTT  1915
            |||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||.
Sbjct 1839  GACTCCAGGCAAGGAGAATATCTACGAGGGAGATCTCGGCCTGGGAGGCTATGATCTCAAACTGGAGCAGACTC  1912

Query 1916  TGGGTCAATCCCAGTTGAAT  1935
            .|||||||.|||||.||.|.
Sbjct 1913  GGGGTCAACCCCAGATGGAC  1932