Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05391
- Subject:
- XM_011512703.3
- Aligned Length:
- 1935
- Identities:
- 1286
- Gaps:
- 648
Alignment
Query 1 ATGGAGAGACAGTCAAGGGTTATGTCAGAAAAGGATGAGTATCAGTTTCAACATCAGGGAGCGGTGGAGCTGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGTCTTCAATTTTTTGCTCATCCTTACCATTTTGACAATCTGGTTATTTAAAAATCATCGATTCCGCTTCTTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGAAACTGGAGGAGCAATGGTGTATGGCCTTATAATGGGACTAATTTTACGATATGCTACAGCACCAACTGAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATTGAAAGTGGAACTGTCTATGACTGTGTAAAACTAACTTTCAGTCCATCAACTCTGCTGGTTAATATCACTGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCAAGTTTATGAATATAAATACAAAAGAGAAATAAGTCAGCACAACATCAATCCTCATCAAGGAAATGCTATAC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TTGAAAAGATGACATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTTCATGCAGGATAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AGTCTAAAGAAGAGACACTTTTTTCAAAACTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTGCCATCTC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CTGCATCGTCATAGGGTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATGATACATGCTGGCCAGCTGAAAAATGGAG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 ACTTTCATTTCACTGACTGTTTATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGTGACAGTGCTGGCCATT 666
.|||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------ATGACAGTGCTGGCCATT 18
Query 667 TTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTCTTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19 TTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTCTTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTGGC 92
Query 741 CATAGTCCTTACATATTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCATTTGATGCCGCAGCATTCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 93 CATAGTCCTTACATATTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCATTTGATGCCGCAGCATTCT 166
Query 815 TCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTCGCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 167 TCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTCGCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCACA 240
Query 889 GCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAACCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCTTG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAACCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCTTG 314
Query 963 GAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCTGCCGGCCTAACAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTCACACAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 GAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCTGCCGGCCTAACAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTCACACAAG 388
Query 1037 CACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAAGAACTAAACAGTTGTTTGAATTTATGAACTTT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389 CACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAAGAACTAAACAGTTGTTTGAATTTATGAACTTT 462
Query 1111 TTGGCGGAGAACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCATATCTTTAATGCTCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 463 TTGGCGGAGAACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCATATCTTTAATGCTCT 536
Query 1185 TTTTATACTTGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 TTTTATACTTGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCTGA 610
Query 1259 ATCTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGGAGCGATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 ATCTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGGAGCGATC 684
Query 1333 GCATTTGCCTTAGCTATTCGGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTCCTCGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 685 GCATTTGCCTTAGCTATTCGGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTCCTCGT 758
Query 1407 GTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTTGACTTGGCTTCAGATCAGAGTTGGCGTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 759 GTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTTGACTTGGCTTCAGATCAGAGTTGGCGTGG 832
Query 1481 ACCTGGATGAAAATCTGAAGGAGGACCCCTCCTCACAACACCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGACG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 ACCTGGATGAAAATCTGAAGGAGGACCCCTCCTCACAACACCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGACG 906
Query 1555 AAAGCAGAGAGTGCTCGGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTATCTGAAACCAATTTTAACCCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 AAAGCAGAGAGTGCTCGGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTATCTGAAACCAATTTTAACCCA 980
Query 1629 CTCTGGTCCTCCGCTGACTACAACATTACCTGAATGGTGTGGTCCGATTTCCAGGCTGCTTACCAGTCCTCAAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 981 CTCTGGTCCTCCGCTGACTACAACATTACCTGAATGGTGTGGTCCGATTTCCAGGCTGCTTACCAGTCCTCAAG 1054
Query 1703 CCTATGGGGAACAGCTAAAAGAGGATGATGTGGAATGCATTGTAAACCAGGATGAACTAGCCATAAATTACCAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055 CCTATGGGGAACAGCTAAAAGAGGATGATGTGGAATGCATTGTAAACCAGGATGAACTAGCCATAAATTACCAG 1128
Query 1777 GAGCAAGCCTCCTCACCCTGCAGTCCTCCTGCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCAGACGCCAGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 GAGCAAGCCTCCTCACCCTGCAGTCCTCCTGCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCAGACGCCAGG 1202
Query 1851 CAAGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGGCCTGGGAGGCTATGAACTCAAGCTTGAGCAAACTTTGGGTCAAT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 CAAGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGGCCTGGGAGGCTATGAACTCAAGCTTGAGCAAACTTTGGGTCAAT 1276
Query 1925 CCCAGTTGAAT 1935
|||||||||||
Sbjct 1277 CCCAGTTGAAT 1287
