Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05391
• Subject: XM_017006202.2
• Aligned Length: 1979
• Identities: 1678
• Gaps: 289

Alignment

Query    1  ATGGAGAGACAGTCAAGGGTTATGTCAGAAAAGGATGAGTATCAGTTTCAACATCAGGGAGCGGTGGAGCTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGACAGTCAAGGGTTATGTCAGAAAAGGATGAGTATCAGTTTCAACATCAGGGAGCGGTGGAGCTGCT  74

Query   75  TGTCTTCAATTTTTTGCTCATCCTTACCATTTTGACAATCTGGTTATTTAAAAATCATCGATTCCGCTTCTTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTCTTCAATTTTTTGCTCATCCTTACCATTTTGACAATCTGGTTATTTAAAAATCATCGATTCCGCTTCTTGC  148

Query  149  ATGAAACTGGAGGAGCAATGGTGTATGGCCTTATAATGGGACTAATTTTACGATATGCTACAGCACCAACTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAACTGGAGGAGCAATGGTGTATGGCCTTATAATGGGACTAATTTTACGATATGCTACAGCACCAACTGAT  222

Query  223  ATTGAAAGTGGAACTGTCTATGACTGTGTAAAACTAACTTTCAGTCCATCAACTCTGCTGGTTAATATCACTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGAAAGTGGAACTGTCTATGACTGTGTAAAACTAACTTTCAGTCCATCAACTCTGCTGGTTAATATCACTGA  296

Query  297  CCAAGTTTATGAATATAAATACAAAAGAGAAATAAGTCAGCACAACATCAATCCTCATCAAGGAAATGCTATAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAAGTTTATGAATATAAATACAAAAGAGAAATAAGTCAGCACAACATCAATCCTCATCAAGGAAATGCTATAC  370

Query  371  TTGAAAAGATGACATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTTCATGCAGGATAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGAAAAGATGACATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTTCATGCAGGATAT  444

Query  445  AGTCTAAAGAAGAGACACTTTTTTCAAAACTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTGCCATCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTCTAAAGAAGAGACACTTTTTTCAAAACTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTGCCATCTC  518

Query  519  CTGCATCGTCATAGGGTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATGATACATGCTGGCCAGCTGAAAAATGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCATCGTCATAGGGTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATGATACATGCTGGCCAGCTGAAAAATGGAG  592

Query  593  ACTTTCATTTCACTGACTGTTTATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGTGACAGTGCTGGCCATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTTCATTTCACTGACTGTTTATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGTGACAGTGCTGGCCATT  666

Query  667  TTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTCTTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTCTTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTGGC  740

Query  741  CATAGTCCTTACATATTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCATTTGATGCCGCAGCATTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATAGTCCTTACATATTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCATTTGATGCCGCAGCATTCT  814

Query  815  TCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTCGCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTCGCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCACA  888

Query  889  GCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAACCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCTTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAACCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCTTG  962

Query  963  GAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCTGCCGGCCTAACAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTCACACAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCTGCCGGCCTAACAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTCACACAAG  1036

Query 1037  CACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAAGAACTAAACAGTTGTTTGAATTTATGAACTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAAGAACTAAACAGTTGTTTGAATTTATGAACTTT  1110

Query 1111  TTGGCGGAGAACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCATATCTTTAATGCTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGGCGGAGAACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCATATCTTTAATGCTCT  1184

Query 1185  TTTTATACTTGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTATACTTGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCTGA  1258

Query 1259  ATCTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGGAGCGATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGGAGCGATC  1332

Query 1333  GCATTTGCCTTAGCTATTCGGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTCCTCGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCATTTGCCTTAGCTATTCGGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTCCTCGT  1406

Query 1407  GTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTTGACTTGGCTTCAGATCAGAGTTGGCGTGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTTGACTTGGCTTCAGATCAGAGTTGGCGTGG  1480

Query 1481  ACCTGGATGAAAATCTGAAGGAGGACCCCTCCTCACAACACCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGACG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACCTGGATGAAAATCTGAAGGAGGACCCCTCCTCACAACACCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGACG  1554

Query 1555  AAAGCAGAGAGTGCTCGGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTATC---TGA-AACCAATTTTAA  1624
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||       |||
Sbjct 1555  AAAGCAGAGAGTGCTCGGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTATCCTTTGATAA-------TAA  1621

Query 1625  C--CCACTCTGGTCCTCCGCTG----------ACTAC------------AACATTACCTGAATGGTGTGGTCCG  1674
            |  .|.|.|.|.||||  ||||          |.|||            |.|||    ||||  |||||..|  
Sbjct 1622  CGATCTCACAGATCCT--GCTGCAGGCAGAGAATTACTTTAAGCTCTTAATCAT----TGAA--GTGTGCAC--  1685

Query 1675  ATTTCCAGGCTGCTTACCAGTCCTCAAGCCTATGGGGAACAGCTAAAAGA----------------GGATGATG  1732
               ||    ||||       ||.||||        |.|||| |.||||||                |||| || 
Sbjct 1686  ---TC----CTGC-------TCTTCAA--------GAAACA-CCAAAAGAACTCCTAACAGCAGTTGGAT-AT-  1734

Query 1733  TGGAATGCATTGTAAACCAGGATGAACTAGCCATAAATTACCAGGAGCAAGCCTCCTCACCCTGCAGTCCTCCT  1806
                                                                                      
Sbjct 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734

Query 1807  GCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCAGACGCCAGGCAAGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGG  1880
                                                                                      
Sbjct 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734

Query 1881  CCTGGGAGGCTATGAACTCAAGCTTGAGCAAACTTTGGGTCAATCCCAGTTGAAT  1935
                                                                   
Sbjct 1735  -------------------------------------------------------  1734