Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05418
• Subject: NM_001366241.1
• Aligned Length: 1674
• Identities: 1470
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGCACCGCGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGCGCGGCTCGTTCAAGATGGCGGAGCTCGACCAGTTGCCTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAAAGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGAATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCA  222
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------ATGCCTTTCAGAAATTCA  18

Query  223  AAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGGCAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   19  AAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGGCAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGT  92

Query  297  TGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTCAACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   93  TGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTCAACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTC  166

Query  371  GATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATAAATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  167  GATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATAAATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGAT  240

Query  445  AAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTATGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  AAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTATGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA  314

Query  519  GTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCTTATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  315  GTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCTTATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG  388

Query  593  AGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGAAAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  389  AGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGAAAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT  462

Query  667  TCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTGCCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  463  TCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTGCCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACG  536

Query  741  TGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGATGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  537  TGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGATGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTT  610

Query  815  TTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTGACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  611  TTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTGACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATG  684

Query  889  CCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  685  CCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCC  758

Query  963  TCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTTATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  759  TCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTTATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCT  832

Query 1037  CTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAATTTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  833  CTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAATTTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATG  906

Query 1111  ATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATGAACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  907  ATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATGAACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCC  980

Query 1185  CATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAATTGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  981  CATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAATTGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACA  1054

Query 1259  AAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGCTTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055  AAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGCTTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCA  1128

Query 1333  ACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAGGAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129  ACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAGGAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCC  1202

Query 1407  CTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTCCAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203  CTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTCCAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAG  1276

Query 1481  CAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277  CAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATA  1350

Query 1555  GACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTAGAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351  GACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTAGAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCA  1424

Query 1629  GATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACACCAACAGAGAC  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1425  GATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACACCAACAGAGAC  1470