Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05418
• Subject: XM_005273102.3
• Aligned Length: 1860
• Identities: 1643
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGATGAAACAGCTGAGCAGAACAGTTCTTTAGCTGTCGGCCTAAATGACCAACTTCATGACCTCTCAAGGTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCGCTCCCCGGCTGCACGCAGCTCAGCTTCCAACATTCGGGAAAGGCGTGCCCGGATCGCGAGGGGCCGCTGGG  148

Query    1  --------------------ATGCACCGCGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGC--GCGG-CTCGTTCAA---G  48
                                |.|   |||.|.||||.||         .|||||  |||| ||||...||   |
Sbjct  149  ACCGAGTCCCGGACGTCGCGACG---CGCAGGGGGCTGC---------TGCGGCCGGCGGTCTCGGGAAAAGTG  210

Query   49  ATGG--CGGAGCTCGACCA----------GTTGCCTGACGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAA  110
            |.||  ||||| .||.|||          |||.|..||  |..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211  AGGGGACGGAG-GCGCCCAAGCAACGTGGGTTTCGGGA--ACTGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAA  281

Query  111  AGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACAGTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGA  184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  282  AGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACAGTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGA  355

Query  185  ATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCAAAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGG  258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  356  ATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCAAAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGG  429

Query  259  CAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGTTGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTC  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430  CAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGTTGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTC  503

Query  333  AACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTCGATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATA  406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  AACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTCGATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATA  577

Query  407  AATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGATAAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  578  AATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGATAAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTA  651

Query  481  TGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAAGTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCT  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  TGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAAGTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCT  725

Query  555  TATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTGAGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGA  628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  TATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTGAGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGA  799

Query  629  AAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTTTCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTG  702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  AAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTTTCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTG  873

Query  703  CCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACGTGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGA  776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  874  CCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACGTGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGA  947

Query  777  TGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTTTTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTG  850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  948  TGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTTTTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTG  1021

Query  851  ACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATGCCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCT  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022  ACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATGCCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCT  1095

Query  925  CGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCCTCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTT  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096  CGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCCTCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTT  1169

Query  999  ATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCTCTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAAT  1072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170  ATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCTCTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAAT  1243

Query 1073  TTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATGATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATG  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244  TTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATGATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATG  1317

Query 1147  AACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCCCATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAAT  1220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318  AACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCCCATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAAT  1391

Query 1221  TGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACAAAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGC  1294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392  TGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACAAAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGC  1465

Query 1295  TTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCAACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAG  1368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466  TTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCAACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAG  1539

Query 1369  GAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCCCTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTC  1442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540  GAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCCCTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTC  1613

Query 1443  CAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAGCAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAAT  1516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614  CAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAGCAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAAT  1687

Query 1517  CACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATAGACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTA  1590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688  CACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATAGACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTA  1761

Query 1591  GAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCAGATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACAC  1664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762  GAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCAGATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACAC  1835

Query 1665  CAACAGAGAC  1674
            ||||||||||
Sbjct 1836  CAACAGAGAC  1845