Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05418
- Subject:
- XM_006496987.1
- Aligned Length:
- 1674
- Identities:
- 1316
- Gaps:
- 204
Alignment
Query 1 ATGCACCGCGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGCGCGGCTCGTTCAAGATGGCGGAGCTCGACCAGTTGCCTGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAAAGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGAATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCA 222
||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------ATGCCTTTCAGAAATTCA 18
Query 223 AAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGGCAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGT 296
|||.||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct 19 AAAAGAAGTCGACTCTTTTCTGATGAAGATGACAGACAAATAAATACAAAGTCACCTAAAAGAAACCAGAGAGT 92
Query 297 TGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTCAACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTC 370
.||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 93 GGCAATGATCCCACAGAAATTTACAGCAACGATGTCAACACCAGATAAGAAAGCATCACAGAAGATTGGTTTTC 166
Query 371 GATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATAAATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGAT 444
|||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 167 GATTACGGAACCTACTCAAGCTTCCCAAAGCACATAAGTGGTGCATATATGAGTGGTTCTACTCAAACATAGAC 240
Query 445 AAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTATGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA 518
||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAGCCACTTTTTGAAGGAGATAATGACTTTTGTGTATGCCTAAAGGAATCCTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA 314
Query 519 GTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCTTATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG 592
.||||||||||||||||||||||||||..||.|.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 ATTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATCAGGAGACTGATGGGAAAACCTCGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG 388
Query 593 AGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGAAAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT 666
||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389 AGGAAGAGAGATCAGCCTTAAAACAGAAGCGGCAGAAAATCAGGCTGTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT 462
Query 667 TCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTGCCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACG 740
|||||.||||||||||||||.||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 463 TCACAGTTCAAAGATCTCCCCGATGAAATCCCTCTACCCCTGGTTATTGGAACCAAAGTTACAGCGCGGTTACG 536
Query 741 TGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGATGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTT 814
|||..||||.|||||..||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 537 TGGCATTCACGATGGCCTGTTTACTGGTCAGATAGATGCAGTGGACACTCTTAATGCTACTTACAGAGTAACTT 610
Query 815 TTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTGACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATG 888
|.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 611 TCGATAGGACAGGCCTTGGGACTCACACCATTCCTGACTATGAAGTTCTTAGTAATGAGCCTCATGAGACAATG 684
Query 889 CCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCC 962
|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 685 CCAATCTCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGGTTTTTTATGACCCCCCCACGGTTACATTATACCCC 758
Query 963 TCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTTATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCT 1036
||||||||||||||||||||.||||...|||||||||.|.||.|||||.||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 759 TCCTCTCCAGTCACCAATTACAGATGGCGATCCTTTACTGGGGCAGTCACCTTGGAGAAGTAAAGTTTCTGGCT 832
Query 1037 CTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAATTTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATG 1110
|||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|..||||||||||||||||||
Sbjct 833 CTGACACGGAGACGTTAGGAGGCTTTCCAGTGGAATTCCTTATCCAGGTGACTAAGTTATCAAAAATTCTCATG 906
Query 1111 ATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATGAACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCC 1184
||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||
Sbjct 907 ATTAAAAAAGAGCATATAAAGAAATTAAGGGAGATGAACACAGAAGCAGAAAAGCTGAAATCCTATTCCATGCC 980
Query 1185 CATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAATTGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACA 1258
|||..|||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 981 CATTGGCATTGAGTTTCAGCGGAGATACGCAACGATCGTCCTGGAGCTTGAGCAGCTGAACAAGGACCTGAACA 1054
Query 1259 AAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGCTTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCA 1332
|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1055 AAGTTCTGCATAAAGTTCAGCAGTATTGCTATGAGCTTGCACCAGACCAGGGACTCCAGCCTGCCGATCAGCCA 1128
Query 1333 ACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAGGAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCC 1406
|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||..|..|.||||||||
Sbjct 1129 ACAGACATGAGACGGAGGTGTGAGGAAGAAGCCCAGGAAATCGTCCGGCAAGCCAACTCTGCTTCCGGACAGCC 1202
Query 1407 CTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTCCAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAG 1480
|||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1203 CTGTGTAGAAAACGAAAATCTGACGGACTTGATCTCCAGGCTCACTGCGATTTTATTACAAATTAAGTGTCTGG 1276
Query 1481 CAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATA 1554
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|..||||||
Sbjct 1277 CAGAGGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCTCTCACAGATTCATTAAATGACATAAAAAACACAATA 1350
Query 1555 GACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTAGAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCA 1628
||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1351 GATGCTTCTAATATCAGTTGTTTTCAGAATAACGTAGAAATCCATGTTGCACATATCCAGAGTGGCCTGAGTCA 1424
Query 1629 GATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACACCAACAGAGAC 1674
|||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1425 GATGGGAAACTTACACGCCTTTGCAGCCAACAACACGAACAGAGAC 1470