Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05419
• Subject: NM_173084.3
• Aligned Length: 1209
• Identities: 1209
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCACAATTTTGAGGAAGAGTTAACTTGTCCCATATGTTATAGTATTTTTGAAGATCCTCGTGTACTGCCATG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACAATTTTGAGGAAGAGTTAACTTGTCCCATATGTTATAGTATTTTTGAAGATCCTCGTGTACTGCCATG  74

Query   75  CTCTCATACATTTTGTAGAAATTGTTTGGAAAACATTCTTCAGGCATCTGGTAACTTTTATATATGGAGACCTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTCATACATTTTGTAGAAATTGTTTGGAAAACATTCTTCAGGCATCTGGTAACTTTTATATATGGAGACCTT  148

Query  149  TACGAATTCCACTCAAGTGCCCTAATTGCAGAAGTATTACTGAAATTGCTCCAACTGGCATTGAATCTTTACCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TACGAATTCCACTCAAGTGCCCTAATTGCAGAAGTATTACTGAAATTGCTCCAACTGGCATTGAATCTTTACCT  222

Query  223  GTTAATTTTGCACTAAGGGCTATTATTGAAAAGTACCAGCAAGAAGACCATCCAGATATTGTCACCTGCCCTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTAATTTTGCACTAAGGGCTATTATTGAAAAGTACCAGCAAGAAGACCATCCAGATATTGTCACCTGCCCTGA  296

Query  297  ACATTACAGGCAACCATTAAATGTTTACTGTCTATTAGATAAAAAATTAGTTTGTGGTCATTGCCTTACCATAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACATTACAGGCAACCATTAAATGTTTACTGTCTATTAGATAAAAAATTAGTTTGTGGTCATTGCCTTACCATAG  370

Query  371  GTCAACATCATGGTCATCCTATAGATGACCTTCAAAGTGCCTATTTGAAAGAAAAGGACACTCCTCAAAAACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCAACATCATGGTCATCCTATAGATGACCTTCAAAGTGCCTATTTGAAAGAAAAGGACACTCCTCAAAAACTG  444

Query  445  CTTGAACAGTTGACTGACACACACTGGACAGATCTTACCCATCTTATTGAAAAGCTGAAAGAACAAAAATCTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTGAACAGTTGACTGACACACACTGGACAGATCTTACCCATCTTATTGAAAAGCTGAAAGAACAAAAATCTCA  518

Query  519  TTCTGAGAAAATGATCCAAGGCGATAAGGAAGCTGTTCTCCAGTATTTTAAGGAGCTTAATGATACATTAGAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCTGAGAAAATGATCCAAGGCGATAAGGAAGCTGTTCTCCAGTATTTTAAGGAGCTTAATGATACATTAGAAC  592

Query  593  AGAAAAAAAAAAGTTTCCTAACGGCTCTCTGTGATGTTGGCAATCTAATTAATCAAGAATATACTCCACAAATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAAAAAAAAAGTTTCCTAACGGCTCTCTGTGATGTTGGCAATCTAATTAATCAAGAATATACTCCACAAATT  666

Query  667  GAAAGAATGAAGGAAATACGAGAGCAGCAGCTTGAATTAATGGCACTGACAATATCTTTACAAGAAGAGTCTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAAGAATGAAGGAAATACGAGAGCAGCAGCTTGAATTAATGGCACTGACAATATCTTTACAAGAAGAGTCTCC  740

Query  741  ACTTAAATTTCTTGAAAAAGTTGATGATGTACGCCAGCATGTACAGATCTTGAAACAAAGACCACTTCCTGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTTAAATTTCTTGAAAAAGTTGATGATGTACGCCAGCATGTACAGATCTTGAAACAAAGACCACTTCCTGAGG  814

Query  815  TTCAACCCGTTGAAATTTATCCTCGAGTAAGCAAAATATTGAAAGAAGAATGGAGCAGAACAGAAATTGGACAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCAACCCGTTGAAATTTATCCTCGAGTAAGCAAAATATTGAAAGAAGAATGGAGCAGAACAGAAATTGGACAA  888

Query  889  ATTAAGAACGTTCTCATTCCCAAAATGAAAATTTCTCCAAAAAGGATGTCATGTTCCTGGCCTGGTAAGGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTAAGAACGTTCTCATTCCCAAAATGAAAATTTCTCCAAAAAGGATGTCATGTTCCTGGCCTGGTAAGGATGA  962

Query  963  AAAGGAAGTTGAATTTTTAAAAATTTTAAACATTGTTGTAGTTACATTAATTTCAGTAATACTGATGTCGATAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAGGAAGTTGAATTTTTAAAAATTTTAAACATTGTTGTAGTTACATTAATTTCAGTAATACTGATGTCGATAC  1036

Query 1037  TCTTTTTCAACCAACACATCATAACCTTTTTAAGTGAAATCACTTTAATATGGTTTTCTGAAGCCTCTCTATCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTTTTTCAACCAACACATCATAACCTTTTTAAGTGAAATCACTTTAATATGGTTTTCTGAAGCCTCTCTATCT  1110

Query 1111  GTTTACCAAAGTTTATCTAACAGTCTGCATAAGGTAAAGAATATACTGTGTCACATTTTCTATTTGTTGAAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTTACCAAAGTTTATCTAACAGTCTGCATAAGGTAAAGAATATACTGTGTCACATTTTCTATTTGTTGAAGGA  1184

Query 1185  ATTTGTGTGGAAAATAGTTTCCCAT  1209
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTTGTGTGGAAAATAGTTTCCCAT  1209