Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05589
• Subject: NM_175241.1
• Aligned Length: 553
• Identities: 451
• Gaps: 35

Alignment

Query   1  ------ATGGCTGA---AAGTGGAAAAGAAAAAATAAAATGGACAACCACCATTATTATTAGCTCATCTCTTAA  65
                 ||||.|||   .||.||||||||||.|.||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCAATGGATGAGCGTAGAGGAAAAGAAAGAGTACAGTGGACAACCACCATTATTATCAGCTCATCTCTTAA  74

Query  66  GAGTTATGAAGTTGCAACTGCCCTAGAAAATCGAAGCCACAAAGTTCGATATTCAGATTCAGTGGAAAATGGAT  139
           ||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||.||||||.|||||
Sbjct  75  GAGTTACGAAATTGCAACTGCCCTAGAAAATCGAAGCCACAAGGTTCGGTATTCTGATACACTGGAAAGTGGAT  148

Query 140  CAATTATATTTTCTCTTTCTGGAGTTGCATTTTTATTAATGGATACTAAGGA----ATGTCTTCTGTCAACTGA  209
           |.|||.||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||    |||.|.||.|    ||||
Sbjct 149  CGATTGTATTTTCTCTGTCTGGAGTTGCATTCTTGTTGATGGATGCTAAGGAGTGTATGACATCGG----CTGA  218

Query 210  AGAAATATTTCTAGCCAAAATTGAGAAATTTATTAACATTCACCAAAATAGTTTTTTGGTTTTGTCTGCTGCCC  283
           .|||||||||.||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|.||||.|.|
Sbjct 219  GGAAATATTTGTAACCAAAATTGAGAAGTTTATTAACATTCACCAAAATAGTTTCTTGGTTCTATTTGCTCCAC  292

Query 284  TCCATGGGCCTGAAGAATGGAAACTGATGTTCAGGATTCAGCAGAGATTCCTGGGTTGTAACTTACGAATACTT  357
           |||||||||||||||||||||..||.|||||||||||.||.|||||.|||.||||..|||||||||||||||||
Sbjct 293  TCCATGGGCCTGAAGAATGGAGTCTCATGTTCAGGATACATCAGAGGTTCTTGGGCAGTAACTTACGAATACTT  366

Query 358  CCAGTACACAACACAGTAAATGCTATTAATCTTATGTGCACTATAGCAAAGACTACCTCCAAACCATACATAGA  431
           ||.|||||||||||||||||.|||.||.|.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 367  CCTGTACACAACACAGTAAACGCTCTTGACCTTATGTGCACTATAGCCAAGACTACGTCCAAACCACACATAGA  440

Query 432  TAGCATTTGCTACAGAATGATAACAGCTAAAGCTTACATCATTGAGCAAAGTCCTGTTTGGAAAACACTTCAGA  505
           .|||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||.|||||||||.|
Sbjct 441  CAGCATCTGCTACAGAATGATAACAACTAAAGCGTACATCATAGAGCAGAGCCCTGTCTGGAGAACACTTCAAA  514

Query 506  AGATAAAACTGAATAGTGATTCAGTTAACCCAAAT  540
           ||||||||         |.|..|.||         
Sbjct 515  AGATAAAA---------GGTAGACTT---------  531