Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05645
- Subject:
- XM_006521080.3
- Aligned Length:
- 623
- Identities:
- 488
- Gaps:
- 73
Alignment
Query 1 ATGGCTGTGGAAGCTCTCCACTGTGGTTTGAATCCACGGGGTATTGATCACCCTGCCCATGCTGAAGGTATTAA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGGCTGTGGAAGCTCTCCACTGTGGTTTGAATCCACGGGGTATTGATCACTCTGCCCATGCTGACGGAATTAA 74
Query 75 ACTGCAAATTGAAGGTGAAGGTGTGGAATCTCAATCCATTAAAAATAAAAATTTCCAGAAGGTGCCTGACCAGA 148
|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 ACTGCAAATTGAAGGCGAAGGTGTAGAATCTCAATCCATTAAAAACAGAACTTTCCAGAAGGTGCCTGACCAAA 148
Query 149 AAGGAACTCCCAAGCGACTGCAGGCAGAAGCTGAGACGGCTAAGTCAGCTACGGTGAAGCTATCTAAACCGGTG 222
|||||||.||||||.||||.||||.||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 149 AAGGAACCCCCAAGAGACTTCAGGGAGAAGCTGAGACAGCAAAGTCAGCTACAGTGAAGCTGTCAAAACCAGTA 222
Query 223 GCTCTATGGACCCAGCAGGATGTCTGCAAGTGGTTGAAGAAACATTGTCCGAATCAGTATCAGATCTACAGTGA 296
||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 223 GCCCTGTGGACCCAGCAGGATGTCTGCAAGTGGCTGAAGAAACACTGTCCAAATCAGTATCAGCTCTACAGTGA 296
Query 297 GTCATTCAAACAGCATGACATAACTGGGCGAGCCCTGCTGAGACTTACTGACAAAAAGCTCGAGCGAATGGGGA 370
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 297 GTCATTCAAACAACATGACATAACTGGGCGAGCCCTGCTGAGACTCACAGACAAGAAGCTGGAGCGCATGGGGA 370
Query 371 TTGCCCAGGAGAACCTCCGGCAGCACATCTTACAACAGGTGCTCCAGCTGAAGGTGCGAGAAGAAGTCAGAAAT 444
|||||||||||||||..||.|||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 371 TTGCCCAGGAGAACCAGCGACAGCACATCCTGCAGCAGGTGCTCCAACTGAAAGTGCGGGAAGAAGTCAGAAAC 444
Query 445 CTACAGTTACTCACACAAGGTACCCTATTGCTTCCTGATGG----GTGGATGGATGGGGAGATTAGAAGAAAGA 514
||.||||||||||||||||| |.||| ||| |||.| ||.|||.||.|| .||.
Sbjct 445 CTGCAGTTACTCACACAAGG---------GATTC----TGGGAACGTGCA--GAGGGGAAGCTT------CAGG 497
Query 515 CCACCTTACT-ATTAGGACAGACAGGAGTCAGGGAGAATTTGTTATTGTTTCTTCAC-AGAATTTCCATCATAG 586
|||| ||| |..||.||||..|||||.| |||.| |||| ||| ||
Sbjct 498 CCAC---ACTGAAGAGAACAGGAAGGAGGC-GGGTG-----------------TCACAAGA-----------AG 539
Query 587 AAA-ATAGTATAC-----AGATT-------- 603
||| .||.|||.| .||.|
Sbjct 540 AAAGCTACTATCCTCGGTGGAGTGTTCTCCA 570