Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05670
• Subject: NM_001184825.2
• Aligned Length: 1278
• Identities: 1203
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||...||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCCACCCACGACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCAACCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAATATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCAGGAAGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAATGGGAGGTGATGAGAATAGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATATCTGGAGACTCCCAAG  444
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||
Sbjct  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518

Query  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAAA  592
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.||.||||.||||
Sbjct  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740

Query  741  CAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962

Query  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036

Query 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGAA  1110

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1111  AAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTC  1184

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGGTAAGCGGATCCCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||   |..|||   |||
Sbjct 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG---ACTGGA---CAG  1252

Query 1259  TATCCTTGGCAATAGGGATT  1278
            |..||               
Sbjct 1253  TTCCC---------------  1257