Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05670
• Subject: NM_001301707.2
• Aligned Length: 1296
• Identities: 919
• Gaps: 315

Alignment

Query    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCCACCCACGACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCAACCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||.|.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAATATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCAGGAA-GACGCAGGATCCTACACCTTACAC  369
            ||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCC-GGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACAC  369

Query  370  ATCATAATGGGAGGTGATGAGAATAGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATATCTGGAGACTCCCAA  443
            |||||||.|.||||||||||||.|||||.||.||.|.||||||||||||||||||||||               
Sbjct  370  ATCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATA---------------  428

Query  444  GCCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGA  517
                                                                                      
Sbjct  429  --------------------------------------------------------------------------  428

Query  518  CTCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAA  591
                                                                                      
Sbjct  429  --------------------------------------------------------------------------  428

Query  592  ACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCC  665
                                                                                      
Sbjct  429  --------------------------------------------------------------------------  428

Query  666  AGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCA  739
                                                      |.||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct  429  ------------------------------------------CTCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCA  460

Query  740  ACAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTAC  813
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  461  ACAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTAC  534

Query  814  ATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCAT  887
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  535  ATTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCAT  608

Query  888  TCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCA  961
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||
Sbjct  609  TCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCCTCCGCA  682

Query  962  GTTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGT  1035
            ||.|||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  683  GTAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGT  756

Query 1036  TCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATG  1108
            |||||||||..||||.|||||||||| ||| .||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  757  TCAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTC-ACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATG  829

Query 1109  GGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGC  1182
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  830  GGAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGC  903

Query 1183  TCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGGTAAGCGGATCCC  1256
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||        ||||
Sbjct  904  TCTGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGG--------TCCC  969

Query 1257  AGTATCCTTGG--------CAATAGGGATT--------  1278
            .|   ||.|||        ||     ||.|        
Sbjct  970  TG---CCATGGAGACCTGACA-----GAGTCTCAGTCA  999