Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05670
• Subject: NM_002785.3
• Aligned Length: 1290
• Identities: 917
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||||.||||||||||||||||||||||.|||.|||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAGAGCACATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCCACCCACGACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCAACCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||...||.||.|||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCATGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTGTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGACCGGCATACAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAATATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCAGGAAGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAATGGGAGGTGATGAGAATAGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATATCTGGAGACTCCCAAG  444
            ||||||.|.|||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGACTGTGATCTTAACCTGTAATCCTGAGAC  518

Query  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAAA  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||||
Sbjct  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCATAGGATGCAGCTGTCTGAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATATGGAACTCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            |.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GGGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709

Query  741  CAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAG  962
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
                                      ||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||..||
Sbjct  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTTCCCTTCAGTCACCTCTTACTATT  757

Query 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGG  1109
            |||||||...||||.|||||||||| ||| ||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAGAACCTCGACTTGTCCTGCTTC-GCAAACTCTAACCCACCAGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGG  830

Query 1110  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||..||||||||||||||||
Sbjct  831  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCTCAGATTACTCCAAAGCATAATGGGCTCTATGCTTGCT  904

Query 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGGTAAGC--GGATCC  1255
            |||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||||.|.|.||||..||.|...|  ||||  
Sbjct  905  CTGCTCGTAACTCAGCCACTGGCGAGGAAAGCTCCACATCCTTGACAATCAGAGTCATTGCTCCTCCAGGAT--  976

Query 1256  CAGTATCCTTGG----CAATAGGGATT-----  1278
            .||.|.|.||.|    |||||   ||.     
Sbjct  977  TAGGAACTTTTGCTTTCAATA---ATCCAACG  1005