Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05701
- Subject:
- XM_006498656.3
- Aligned Length:
- 1255
- Identities:
- 1158
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCCGCCCGCCCGGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCCGGAGCGGGGTC 74
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCTGCCCGCCCTGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCTGGAGCTGGGTC 74
Query 75 TCTAGCCGCTGGGTTTCTGCTCCGACCGGAACCTGTACGAGCTGCCAG----TGAACGACGGAGGCTGTATCCC 144
|||..||||.|||.||||||||||.||||||.|||||.|||||||| | ||||||..||||.|||||||||
Sbjct 75 TCTCACCGCCGGGATTCTGCTCCGCCCGGAATCTGTAGGAGCTGCC-GCTGCTGAACGGAGGAGACTGTATCCC 147
Query 145 CCGAGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGACCCCAGCAGTCTATGC 218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 CCGAGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGACCCCAGCAGTCTATGC 221
Query 219 ACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTGGCGTGGACAACCCTG 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 222 ACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACACTAGATCAGTGCATCCAGACTGGAGTGGACAACCCTG 295
Query 293 GCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTATTTGCTGACCTGTTT 366
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 296 GCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTATTTGCTGAACTGTTT 369
Query 367 GACCCTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCACGGATCTAGATGCCAG 440
||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 370 GACCCTGTGATCCAAGAGCGGCATAATGGATATGACCCCAGAACAATGAAGCACACCACTGACCTTGATGCCAG 443
Query 441 TAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTGGCCGAAGCATCCGAG 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|.|
Sbjct 444 TAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCTTCAAGAGTCAGAACTGGCCGAAGTATCAGGG 517
Query 515 GACTCAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTGGTGGATGCACTGAGT 588
||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 518 GACTCAGTCTCCCTCCAGCCTGCACTCGGGCAGAGCGAAGAGAGGTAGAACGTGTTGTGGTGGATGCTCTGAGT 591
Query 589 GGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGAACAGCAGCAGCTTAT 662
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 592 GGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGGTACTATAGGCTCAGTGAGATGACGGAGGCCGAACAGCAGCAGCTTAT 665
Query 663 TGATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCAG 736
|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 666 TGATGACCATTTTCTGTTTGATAAACCTGTGTCCCCATTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCTG 739
Query 737 ATGCTCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAGGATCATACACGGGTG 810
|||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 740 ATGCTCGAGGGATCTGGCACAACAATGAGAAGAGTTTCTTGATCTGGGTGAATGAGGAGGACCACACACGGGTC 813
Query 811 ATCTCCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCTCAAAGAGGTGGAGAG 884
|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 814 ATCTCTATGGAGAAAGGCGGCAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGGGGCCTCAAAGAGGTGGAGAA 887
Query 885 ACTTATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGACCTGTCCATCTAACC 958
.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GCTGATCCAGGAACGAGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTAGGCTACATCTTGACCTGTCCATCTAACC 961
Query 959 TGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGCCGCTTCCCAAAGATC 1032
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 962 TGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTCCACATCAAACTGCCACTGCTGAGCAAAGATAACCGCTTCCCAAAGATC 1035
Query 1033 CTGGAGAACCTAAGACTCCAAAAGCGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCCACAGGCGGTGTCTTTGATAT 1106
|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||.||
Sbjct 1036 CTGGAGAACCTAAGACTGCAAAAGCGTGGAACTGGAGGAGTGGACACAGCTGCCACAGGCAGCGTCTTTGACAT 1109
Query 1107 TTCTAATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATGGAGTAAACTATTTGA 1180
.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1110 CTCTAATTTGGATCGACTTGGCAAGTCAGAGGTGGAGCTGGTGCAGCTCGTCATCGATGGGGTGAACTATTTGA 1183
Query 1181 TTGATTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATCCACACCAAGCAT 1251
||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..|||||.|..||||||.|||.|||
Sbjct 1184 TTGACTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGACAGGATATTCGAATCCCTCCACCTCTTGTCCACAGCAAACAT 1254