Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05740
- Subject:
- XR_873759.3
- Aligned Length:
- 1609
- Identities:
- 1073
- Gaps:
- 424
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GAATTTTGGCGGCGCACTCAGACTGCCGGTACTTCCGGTGAGGGTCGTCTCGTCGAGGCTGGTGGGTCTACGCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGGAGACCTGCGGGGTCCTGAGGCTGTGGAGGGCTGGAGTGAGGCGGACAGGAGAAGAAGCCTGGAGCTGAGGA 148
Query 1 --------------------------------------ATGGATGAAGAACCTGAAAGAACTAAGCGATGGGAA 36
|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 149 CCGAGAGTTGAATAAGCATATATATCATTATAAGCACCATGGATGAAGAACCTGAGAGAACCAAGCGGTGGGAA 222
Query 37 GGAGGCTATGAAAGAACATGGGAGATTCTTAAAGAAGATGAATCTGGATCACTTAAAGCTACAATAGAAGACAT 110
|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GGAGGCTATGAGAGAACCTGGGAAATTCTTAAAGAAGATGAAACTGGATCACTTAAAGCTACAATAGAAGATAT 296
Query 111 TCTATTCAAGGCAAAGAGAAAAAGAGTATTTGAGCACCATGGACAAGTTCGACTTGGAATGATGCGCCACCTTT 184
|||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 TCTCTTCAAGGCAAAGAGGAAAAGAGTGTTTGAGCACCATGGACAAGTCCGACTTGGAATGATGCGCCACCTGT 370
Query 185 ATGTGGTAGTAGATGGATCAAGAACAATGGAAGACCAAGATTTAAAGCCTAATAGACTGACGTGTACTTTAAAG 258
|||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 ATGTGGTGGTGGATGGATCGAGAACAATGGAAGATCAGGATTTAAAGCCCAATAGACTGACTTGCACTTTAAAG 444
Query 259 TTGTTGGAATACTTTGTAGAGGAATATTTTGATCAAAATCCTATTAGTCAGATTGGAATAATTGTAACTAAGAG 332
|||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGCTGGAATACTTTGTAGAAGAATATTTTGATCAAAACCCTATCAGTCAGATTGGAATAATTGTAACTAAGAG 518
Query 333 TAAAAGAGCTGAAAAATTGACTGAACTTTCAGGAAACCCAAGAAAACATATAACGTCTTTGAAGGAAGCTGTGG 406
||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.|
Sbjct 519 TAAAAGAGCTGAAAAACTGACTGAACTCTCAGGAAACCCAAGGAAACATATAACATCTTTGAAGAAAGCTGTAG 592
Query 407 ATATGACCTGCCATGGAGAGCCATCTCTTTATAATTCCCTAAGCATGGCTATGCAGACTCTAAAACACATGCCT 480
|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 593 ATATGACCTGCCATGGAGAACCATCGCTCTATAATTCCTTAAGCATGGCTATGCAGACCCTAAAACACATGCCT 666
Query 481 GGACATACAAGTCGAGAAGTACTAATCATCTTTAGCAGCCTTACAACTTGCGATCCATCTAATATTTATGATTT 554
||||||||||||.|||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 667 GGACATACAAGTAGAGAAGTGCTCATCATCTTCAGCAGCCTCACCACCTGTGATCCATCTAATATTTACGATCT 740
Query 555 AATCAAGACCCTAAAGGCAGCTAAAATTAGAGTATCTGTTATTGGATTGTCTGCAGAAGTTCGCGTTTGCACTG 628
.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 741 CATCAAGACCCTGAAGACAGCTAAAATTAGAGTGTCTGTTATTGGATTATCTGCGGAGGTTCGAGTTTGTACTG 814
Query 629 TACTTGCTCGTGAAACTGGTG-------------------------------------GCACGTACCATGTTAT 665
||||||||||||||||||||| ||||.|||||||||||
Sbjct 815 TACTTGCTCGTGAAACTGGTGGTATATATCTGCTATCTTCAATAATTATAATTACTGTGCACATACCATGTTAT 888
Query 666 TTTAGATGAAAGCCATTACAAAGAGTTGCTCACACATCATCTTAGTCCTCCTCCTGCTAGCTCAAGTTCTGAAT 739
.||||||||||.|||||||||.||||||.|..||||||||.|.||.||.||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 889 CTTAGATGAAACCCATTACAAGGAGTTGTTGGCACATCATGTGAGCCCCCCTCCTGCCAGCTCAAGCTCCGAGT 962
Query 740 GCTCACTTATTCGTATGGGATTTCCTCAGCACACCATTGCTTCTTTATCTGACCAGGATGCAAAACCCTCTTTC 813
|||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 963 GCTCACTCATTCGCATGGGATTCCCTCAGCATACCATTGCTTCTTTGTCTGATCAGGATGCAAAACCATCCTTC 1036
Query 814 AGCATGGCGCATTTGGATGGCAA---TACTGAGCCAGGGCTTACATTAGGAGGCTATTTCTGCCCACAGTGTCG 884
||||||||||||||||||..||| .||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1037 AGCATGGCGCATTTGGATAACAACAGCACTGAGCCAGGGCTTACACTGGGAGGCTACTTCTGCCCACAGTGCCG 1110
Query 885 GGCAAAGTACTGTGAGCTACCTGTTGAATGTAAAATCTGTGGTCTTACTTTGGTGTCTGCTCCCCACTTGGCAC 958
.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.
Sbjct 1111 AGCAAAGTACTGCGAGCTTCCTGTTGAATGTAAAATATGTGGTCTTACTTTGGTGTCTGCACCTCATTTGGCAA 1184
Query 959 GGTCTTACCATCATTTGTTTCCTTTGGATGCTTTTCAAGAAATTCCCCTAGAAGAATATAATGGAGAAAGATTT 1032
|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1185 GATCTTACCATCATTTATTTCCTTTGGATGCTTTTCAAGAAATTTCCCTAGAAGAATATAAAGGAGAAAGGTTT 1258
Query 1033 TGTTATGGATGTCAGGGGGAATTGAAAGACCAACATGTTTATGTTTGTGCTGTGTGCCAAAATGTTTTCTGTGT 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1259 TGTTATGGATGTCAGGGGGAATTGAAAGACCAACATGTCTATGTTTGCACAGTGTGCCAAAATGTTTTTTGTGT 1332
Query 1107 GGACTGTGATGTTTTTGTTCATGATTCTCTACACTGTTGCCCTGGCTGTATTCATAAGATTCCAGCTCCTTCAG 1180
||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1333 GGACTGTGATGTCTTTGTTCATGACTCTCTCCATTGTTGTCCTGGCTGTATTCATAAGATCCCAACTCCTTCAG 1406
Query 1181 ----------GTGTT----------------------------------------------------------- 1185
.||.|
Sbjct 1407 CGCATCATGACTGATCAGCTAGCTGAAAACAAACTGCTGAACTAAAGAAGTTTTCTCCTTAGTGGATGAAGATG 1480
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1481 GAGATGGCAATGGGAACATGAACTTGGCCCTCCCATATGGTCACTGAAAAACCCCAACAAGCCAATTCAGGATA 1554
Query 1186 ------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1555 TCCCAGAATCTTTACTCTGATGGAAAAAAAGAAGAAAGAAGAAAGAAAAAAAGAA 1609