Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05798
• Subject: NM_001304444.1
• Aligned Length: 1971
• Identities: 1918
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------ATGGAGAGTGTTGTTCGCCGCTG  23
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGAGTGGCTTCTTCTCCACCTAGATGAGCCAGCATACTTCCTGAACATGGAGAGTGTTGTTCGCCGCTG  74

Query   24  CCCATTCTTATCCCGAGTCCCCCAGGCCTTTCTGCAGAAAGCAGGCAAATCTCTGTTGTTCTATGCCCAAAACT  97
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCATTCTTATCCCGAGTCCCCCAGGCCTTTCTGCAGAAAGCAGGCAAATCTCTGTTGTTCTATGCCCAAAACT  148

Query   98  GCCCCAAGATGATGGAAGTTGGGGCCAAGCCAGCCCCTCGGGCATTGTCCACTGCAGCAGTACACTACCAACAG  171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCCAAGATGATGGAAGTTGGGGCCAAGCCAGCCCCTCGGGCATTGTCCACTGCAGCAGTACACTACCAACAG  222

Query  172  ATCAAAGAAACCCCTCCGGCCAGTGAGAAAGACAAAACTGCTAAGGCCAAGGTCCAACAGACTCCTGATGGATC  245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCAAAGAAACCCCTCCGGCCAGTGAGAAAGACAAAACTGCTAAGGCCAAGGTCCAACAGACTCCTGATGGATC  296

Query  246  CCAGCAGAGTCCAGATGGCACACAGCTTCCGTCTGGACACCCCTTGCCTGCCACAAGCCAGGGCACTGCAAGCA  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGCAGAGTCCAGATGGCACACAGCTTCCGTCTGGACACCCCTTGCCTGCCACAAGCCAGGGCACTGCAAGCA  370

Query  320  AATGCCCTTTCCTGGCAGCACAGATGAATCAGAGAGGCAGCAGTGTCTTCTGCAAAGCCAGTCTTGAGCTTCAG  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATGCCCTTTCCTGGCAGCACAGATGAATCAGAGAGGCAGCAGTGTCTTCTGCAAAGCCAGTCTTGAGCTTCAG  444

Query  394  GAGGATGTGCAGGAAATGAATGCCGTGAGGAAAGAGGTTGCTGAAACCTCAGCAGGCCCCAGTGTGGTTAGTGT  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGATGTGCAGGAAATGAATGCCGTGAGGAAAGAGGTTGCTGAAACCTCAGCAGGCCCCAGTGTGGTTAGTGT  518

Query  468  GAAAACCGATGGAGGGGATCCCAGTGGACTGCTGAAGAACTTCCAGGACATTATGCAAAAGCAAAGACCAGAAA  541
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAACCGATGGAGGGGATCCCAGTGGACTGCTGAAGAACTTCCAGGACATCATGCAAAAGCAAAGACCAGAAA  592

Query  542  GAGTGTCTCATCTTCTTCAAGATAACTTGCCAAAATCTGTTTCCACTTTTCAGTATGATCGTTTCTTTGAGAAA  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGTGTCTCATCTTCTTCAAGATAACTTGCCAAAATCTGTTTCCACTTTTCAGTATGATCGTTTCTTTGAGAAA  666

Query  616  AAAATTGATGAGAAAAAGAATGACCACACCTATCGAGTTTTTAAAACTGTGAACCGGCGAGCACACATCTTCCC  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAATTGATGAGAAAAAGAATGACCACACCTATCGAGTTTTTAAAACTGTGAACCGGCGAGCACACATCTTCCC  740

Query  690  CATGGCAGATGACTATTCAGACTCCCTCATCACCAAAAAGCAAGTGTCAGTCTGGTGCAGTAATGACTACCTAG  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATGGCAGATGACTATTCAGACTCCCTCATCACCAAAAAGCAAGTGTCAGTCTGGTGCAGTAATGACTACCTAG  814

Query  764  GAATGAGTCGCCACCCACGGGTGTGTGGGGCAGTTATGGACACTTTGAAACAACATGGTGCTGGGGCAGGTGGT  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAATGAGTCGCCACCCACGGGTGTGTGGGGCAGTTATGGACACTTTGAAACAACATGGTGCTGGGGCAGGTGGT  888

Query  838  ACTAGAAATATTTCTGGAACTAGTAAATTCCATGTGGACTTAGAGCGGGAGCTGGCAGACCTCCATGGGAAAGA  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTAGAAATATTTCTGGAACTAGTAAATTCCATGTGGACTTAGAGCGGGAGCTGGCAGACCTCCATGGGAAAGA  962

Query  912  TGCCGCACTCTTGTTTTCCTCGTGCTTTGTGGCCAATGACTCAACCCTCTTCACCCTGGCTAAGATGATGCCAG  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCCGCACTCTTGTTTTCCTCGTGCTTTGTGGCCAATGACTCAACCCTCTTCACCCTGGCTAAGATGATGCCAG  1036

Query  986  GCTGTGAGATTTACTCTGATTCTGGGAACCATGCCTCCATGATCCAAGGGATTCGAAACAGCCGAGTGCCAAAG  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTGTGAGATTTACTCTGATTCTGGGAACCATGCCTCCATGATCCAAGGGATTCGAAACAGCCGAGTGCCAAAG  1110

Query 1060  TACATCTTCCGCCACAATGATGTCAGCCACCTCAGAGAACTGCTGCAAAGATCTGACCCCTCAGTCCCCAAGAT  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACATCTTCCGCCACAATGATGTCAGCCACCTCAGAGAACTGCTGCAAAGATCTGACCCCTCAGTCCCCAAGAT  1184

Query 1134  TGTGGCATTTGAAACTGTCCATTCAATGGATGGGGCGGTGTGCCCACTGGAAGAGCTGTGTGATGTGGCCCATG  1207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTGGCATTTGAAACTGTCCATTCAATGGATGGGGCGGTGTGCCCACTGGAAGAGCTGTGTGATGTGGCCCATG  1258

Query 1208  AGTTTGGAGCAATCACCTTCGTGGATGAGGTCCACGCAGTGGGGCTTTATGGGGCTCGAGGCGGAGGGATTGGG  1281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGTTTGGAGCAATCACCTTCGTGGATGAGGTCCACGCAGTGGGGCTTTATGGGGCTCGAGGCGGAGGGATTGGG  1332

Query 1282  GATCGGGATGGAGTCATGCCAAAAATGGACATCATTTCTGGAACACTTGGCAAAGCCTTTGGTTGTGTTGGAGG  1355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATCGGGATGGAGTCATGCCAAAAATGGACATCATTTCTGGAACACTTGGCAAAGCCTTTGGTTGTGTTGGAGG  1406

Query 1356  GTACATCGCCAGCACGAGTTCTCTGATTGACACCGTACGGTCCTATGCTGCTGGCTTCATCTTCACCACCTCTC  1429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTACATCGCCAGCACGAGTTCTCTGATTGACACCGTACGGTCCTATGCTGCTGGCTTCATCTTCACCACCTCTC  1480

Query 1430  TGCCACCCATGCTGCTGGCTGGAGCCCTGGAGTCTGTGCGGATCCTGAAGAGCGCTGAGGGACGGGTGCTTCGC  1503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCCACCCATGCTGCTGGCTGGAGCCCTGGAGTCTGTGCGGATCCTGAAGAGCGCTGAGGGACGGGTGCTTCGC  1554

Query 1504  CGCCAGCACCAGCGCAACGTCAAACTCATGAGACAGATGCTAATGGATGCCGGCCTCCCTGTTGTCCACTGCCC  1577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGCCAGCACCAGCGCAACGTCAAACTCATGAGACAGATGCTAATGGATGCCGGCCTCCCTGTTGTCCACTGCCC  1628

Query 1578  CAGCCACATCATCCCTGTGCGGGTTGCAGATGCTGCTAAAAACACAGAAGTCTGTGATGAACTAATGAGCAGAC  1651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAGCCACATCATCCCTGTGCGGGTTGCAGATGCTGCTAAAAACACAGAAGTCTGTGATGAACTAATGAGCAGAC  1702

Query 1652  ATAACATCTACGTGCAAGCAATCAATTACCCTACGGTGCCCCGGGGAGAAGAGCTCCTACGGATTGCCCCCACC  1725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATAACATCTACGTGCAAGCAATCAATTACCCTACGGTGCCCCGGGGAGAAGAGCTCCTACGGATTGCCCCCACC  1776

Query 1726  CCTCACCACACACCCCAGATGATGAACTACTTCCTTGAGAATCTGCTAGTCACATGGAAGCAAGTGGGGCTGGA  1799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCTCACCACACACCCCAGATGATGAACTACTTCCTTGAGAATCTGCTAGTCACATGGAAGCAAGTGGGGCTGGA  1850

Query 1800  ACTGAAGCCTCATTCCTCAGCTGAGTGCAACTTCTGCAGGAGGCCACTGCATTTTGAAGTGATGAGTGAAAGAG  1873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACTGAAGCCTCATTCCTCAGCTGAGTGCAACTTCTGCAGGAGGCCACTGCATTTTGAAGTGATGAGTGAAAGAG  1924

Query 1874  AGAAGTCCTATTTCTCAGGCTTGAGCAAGTCGGTATCTGCTCAGGCC  1920
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGAAGTCCTATTTCTCAGGCTTGAGCAAGTTGGTATCTGCTCAGGCC  1971