Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05798
• Subject: NM_199166.2
• Aligned Length: 1920
• Identities: 1918
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGAGTGTTGTTCGCCGCTGCCCATTCTTATCCCGAGTCCCCCAGGCCTTTCTGCAGAAAGCAGGCAAATC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGTGTTGTTCGCCGCTGCCCATTCTTATCCCGAGTCCCCCAGGCCTTTCTGCAGAAAGCAGGCAAATC  74

Query   75  TCTGTTGTTCTATGCCCAAAACTGCCCCAAGATGATGGAAGTTGGGGCCAAGCCAGCCCCTCGGGCATTGTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGTTGTTCTATGCCCAAAACTGCCCCAAGATGATGGAAGTTGGGGCCAAGCCAGCCCCTCGGGCATTGTCCA  148

Query  149  CTGCAGCAGTACACTACCAACAGATCAAAGAAACCCCTCCGGCCAGTGAGAAAGACAAAACTGCTAAGGCCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCAGCAGTACACTACCAACAGATCAAAGAAACCCCTCCGGCCAGTGAGAAAGACAAAACTGCTAAGGCCAAG  222

Query  223  GTCCAACAGACTCCTGATGGATCCCAGCAGAGTCCAGATGGCACACAGCTTCCGTCTGGACACCCCTTGCCTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCAACAGACTCCTGATGGATCCCAGCAGAGTCCAGATGGCACACAGCTTCCGTCTGGACACCCCTTGCCTGC  296

Query  297  CACAAGCCAGGGCACTGCAAGCAAATGCCCTTTCCTGGCAGCACAGATGAATCAGAGAGGCAGCAGTGTCTTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAAGCCAGGGCACTGCAAGCAAATGCCCTTTCCTGGCAGCACAGATGAATCAGAGAGGCAGCAGTGTCTTCT  370

Query  371  GCAAAGCCAGTCTTGAGCTTCAGGAGGATGTGCAGGAAATGAATGCCGTGAGGAAAGAGGTTGCTGAAACCTCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAAAGCCAGTCTTGAGCTTCAGGAGGATGTGCAGGAAATGAATGCCGTGAGGAAAGAGGTTGCTGAAACCTCA  444

Query  445  GCAGGCCCCAGTGTGGTTAGTGTGAAAACCGATGGAGGGGATCCCAGTGGACTGCTGAAGAACTTCCAGGACAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGGCCCCAGTGTGGTTAGTGTGAAAACCGATGGAGGGGATCCCAGTGGACTGCTGAAGAACTTCCAGGACAT  518

Query  519  TATGCAAAAGCAAAGACCAGAAAGAGTGTCTCATCTTCTTCAAGATAACTTGCCAAAATCTGTTTCCACTTTTC  592
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGCAAAAGCAAAGACCAGAAAGAGTGTCTCATCTTCTTCAAGATAACTTGCCAAAATCTGTTTCCACTTTTC  592

Query  593  AGTATGATCGTTTCTTTGAGAAAAAAATTGATGAGAAAAAGAATGACCACACCTATCGAGTTTTTAAAACTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTATGATCGTTTCTTTGAGAAAAAAATTGATGAGAAAAAGAATGACCACACCTATCGAGTTTTTAAAACTGTG  666

Query  667  AACCGGCGAGCACACATCTTCCCCATGGCAGATGACTATTCAGACTCCCTCATCACCAAAAAGCAAGTGTCAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACCGGCGAGCACACATCTTCCCCATGGCAGATGACTATTCAGACTCCCTCATCACCAAAAAGCAAGTGTCAGT  740

Query  741  CTGGTGCAGTAATGACTACCTAGGAATGAGTCGCCACCCACGGGTGTGTGGGGCAGTTATGGACACTTTGAAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGTGCAGTAATGACTACCTAGGAATGAGTCGCCACCCACGGGTGTGTGGGGCAGTTATGGACACTTTGAAAC  814

Query  815  AACATGGTGCTGGGGCAGGTGGTACTAGAAATATTTCTGGAACTAGTAAATTCCATGTGGACTTAGAGCGGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACATGGTGCTGGGGCAGGTGGTACTAGAAATATTTCTGGAACTAGTAAATTCCATGTGGACTTAGAGCGGGAG  888

Query  889  CTGGCAGACCTCCATGGGAAAGATGCCGCACTCTTGTTTTCCTCGTGCTTTGTGGCCAATGACTCAACCCTCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGCAGACCTCCATGGGAAAGATGCCGCACTCTTGTTTTCCTCGTGCTTTGTGGCCAATGACTCAACCCTCTT  962

Query  963  CACCCTGGCTAAGATGATGCCAGGCTGTGAGATTTACTCTGATTCTGGGAACCATGCCTCCATGATCCAAGGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACCCTGGCTAAGATGATGCCAGGCTGTGAGATTTACTCTGATTCTGGGAACCATGCCTCCATGATCCAAGGGA  1036

Query 1037  TTCGAAACAGCCGAGTGCCAAAGTACATCTTCCGCCACAATGATGTCAGCCACCTCAGAGAACTGCTGCAAAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCGAAACAGCCGAGTGCCAAAGTACATCTTCCGCCACAATGATGTCAGCCACCTCAGAGAACTGCTGCAAAGA  1110

Query 1111  TCTGACCCCTCAGTCCCCAAGATTGTGGCATTTGAAACTGTCCATTCAATGGATGGGGCGGTGTGCCCACTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGACCCCTCAGTCCCCAAGATTGTGGCATTTGAAACTGTCCATTCAATGGATGGGGCGGTGTGCCCACTGGA  1184

Query 1185  AGAGCTGTGTGATGTGGCCCATGAGTTTGGAGCAATCACCTTCGTGGATGAGGTCCACGCAGTGGGGCTTTATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGCTGTGTGATGTGGCCCATGAGTTTGGAGCAATCACCTTCGTGGATGAGGTCCACGCAGTGGGGCTTTATG  1258

Query 1259  GGGCTCGAGGCGGAGGGATTGGGGATCGGGATGGAGTCATGCCAAAAATGGACATCATTTCTGGAACACTTGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGCTCGAGGCGGAGGGATTGGGGATCGGGATGGAGTCATGCCAAAAATGGACATCATTTCTGGAACACTTGGC  1332

Query 1333  AAAGCCTTTGGTTGTGTTGGAGGGTACATCGCCAGCACGAGTTCTCTGATTGACACCGTACGGTCCTATGCTGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAGCCTTTGGTTGTGTTGGAGGGTACATCGCCAGCACGAGTTCTCTGATTGACACCGTACGGTCCTATGCTGC  1406

Query 1407  TGGCTTCATCTTCACCACCTCTCTGCCACCCATGCTGCTGGCTGGAGCCCTGGAGTCTGTGCGGATCCTGAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCTTCATCTTCACCACCTCTCTGCCACCCATGCTGCTGGCTGGAGCCCTGGAGTCTGTGCGGATCCTGAAGA  1480

Query 1481  GCGCTGAGGGACGGGTGCTTCGCCGCCAGCACCAGCGCAACGTCAAACTCATGAGACAGATGCTAATGGATGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCGCTGAGGGACGGGTGCTTCGCCGCCAGCACCAGCGCAACGTCAAACTCATGAGACAGATGCTAATGGATGCC  1554

Query 1555  GGCCTCCCTGTTGTCCACTGCCCCAGCCACATCATCCCTGTGCGGGTTGCAGATGCTGCTAAAAACACAGAAGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCCTCCCTGTTGTCCACTGCCCCAGCCACATCATCCCTGTGCGGGTTGCAGATGCTGCTAAAAACACAGAAGT  1628

Query 1629  CTGTGATGAACTAATGAGCAGACATAACATCTACGTGCAAGCAATCAATTACCCTACGGTGCCCCGGGGAGAAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTGTGATGAACTAATGAGCAGACATAACATCTACGTGCAAGCAATCAATTACCCTACGGTGCCCCGGGGAGAAG  1702

Query 1703  AGCTCCTACGGATTGCCCCCACCCCTCACCACACACCCCAGATGATGAACTACTTCCTTGAGAATCTGCTAGTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCTCCTACGGATTGCCCCCACCCCTCACCACACACCCCAGATGATGAACTACTTCCTTGAGAATCTGCTAGTC  1776

Query 1777  ACATGGAAGCAAGTGGGGCTGGAACTGAAGCCTCATTCCTCAGCTGAGTGCAACTTCTGCAGGAGGCCACTGCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACATGGAAGCAAGTGGGGCTGGAACTGAAGCCTCATTCCTCAGCTGAGTGCAACTTCTGCAGGAGGCCACTGCA  1850

Query 1851  TTTTGAAGTGATGAGTGAAAGAGAGAAGTCCTATTTCTCAGGCTTGAGCAAGTCGGTATCTGCTCAGGCC  1920
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTTTGAAGTGATGAGTGAAAGAGAGAAGTCCTATTTCTCAGGCTTGAGCAAGTTGGTATCTGCTCAGGCC  1920