Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05798
• Subject: XM_024453393.1
• Aligned Length: 1920
• Identities: 1753
• Gaps: 165

Alignment

Query    1  ATGGAGAGTGTTGTTCGCCGCTGCCCATTCTTATCCCGAGTCCCCCAGGCCTTTCTGCAGAAAGCAGGCAAATC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGTGTTGTTCGCCGCTGCCCATTCTTATCCCGAGTCCCCCAGGCCTTTCTGCAGAAAGCAGGCAAATC  74

Query   75  TCTGTTGTTCTATGCCCAAAACTGCCCCAAGATGATGGAAGTTGGGGCCAAGCCAGCCCCTCGGGCATTGTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGTTGTTCTATGCCCAAAACTGCCCCAAGATGATGGAAGTTGGGGCCAAGCCAGCCCCTCGGGCATTGTCCA  148

Query  149  CTGCAGCAGTACACTACCAACAGATCAAAGAAACCCCTCCGGCCAGTGAGAAAGACAAAACTGCTAAGGCCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCAGCAGTACACTACCAACAGATCAAAGAAACCCCTCCGGCCAGTGAGAAAGACAAAACTGCTAAGGCCAAG  222

Query  223  GTCCAACAGACTCCTGATGGATCCCAGCAGAGTCCAGATGGCACACAGCTTCCGTCTGGACACCCCTTGCCTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCAACAGACTCCTGATGGATCCCAGCAGAGTCCAGATGGCACACAGCTTCCGTCTGGACACCCCTTGCCTGC  296

Query  297  CACAAGCCAGGGCACTGCAAGCAAATGCCCTTTCCTGGCAGCACAGATGAATCAGAGAGGCAGCAGTGTCTTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAAGCCAGGGCACTGCAAGCAAATGCCCTTTCCTGGCAGCACAGATGAATCAGAGAGGCAGCAGTGTCTTCT  370

Query  371  GCAAAGCCAGTCTTGAGCTTCAGGAGGATGTGCAGGAAATGAATGCCGTGAGGAAAGAGGTTGCTGAAACCTCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAAAGCCAGTCTTGAGCTTCAGGAGGATGTGCAGGAAATGAATGCCGTGAGGAAAGAGGTTGCTGAAACCTCA  444

Query  445  GCAGGCCCCAGTGTGGTTAGTGTGAAAACCGATGGAGGGGATCCCAGTGGACTGCTGAAGAACTTCCAGGACAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGGCCCCAGTGTGGTTAGTGTGAAAACCGATGGAGGGGATCCCAGTGGACTGCTGAAGAACTTCCAGGACAT  518

Query  519  TATGCAAAAGCAAAGACCAGAAAGAGTGTCTCATCTTCTTCAAGATAACTTGCCAAAATCTGTTTCCACTTTTC  592
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGCAAAAGCAAAGACCAGAAAGAGTGTCTCATCTTCTTCAAGATAACTTGCCAAAATCTGTTTCCACTTTTC  592

Query  593  AGTATGATCGTTTCTTTGAGAAAAAAATTGATGAGAAAAAGAATGACCACACCTATCGAGTTTTTAAAACTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTATGATCGTTTCTTTGAGAAAAAAATTGATGAGAAAAAGAATGACCACACCTATCGAGTTTTTAAAACTGTG  666

Query  667  AACCGGCGAGCACACATCTTCCCCATGGCAGATGACTATTCAGACTCCCTCATCACCAAAAAGCAAGTGTCAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACCGGCGAGCACACATCTTCCCCATGGCAGATGACTATTCAGACTCCCTCATCACCAAAAAGCAAGTGTCAGT  740

Query  741  CTGGTGCAGTAATGACTACCTAGGAATGAGTCGCCACCCACGGGTGTGTGGGGCAGTTATGGACACTTTGAAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGTGCAGTAATGACTACCTAGGAATGAGTCGCCACCCACGGGTGTGTGGGGCAGTTATGGACACTTTGAAAC  814

Query  815  AACATGGTGCTGGGGCAGGTGGTACTAGAAATATTTCTGGAACTAGTAAATTCCATGTGGACTTAGAGCGGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACATGGTGCTGGGGCAGGTGGTACTAGAAATATTTCTGGAACTAGTAAATTCCATGTGGACTTAGAGCGGGAG  888

Query  889  CTGGCAGACCTCCATGGGAAAGATGCCGCACTCTTGTTTTCCTCGTGCTTTGTGGCCAATGACTCAACCCTCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGCAGACCTCCATGGGAAAGATGCCGCACTCTTGTTTTCCTCGTGCTTTGTGGCCAATGACTCAACCCTCTT  962

Query  963  CACCCTGGCTAAGATGATGCCAGGCTGTGAGATTTACTCTGATTCTGGGAACCATGCCTCCATGATCCAAGGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACCCTGGCTAAGATGATGCCAGGCTGTGAGATTTACTCTGATTCTGGGAACCATGCCTCCATGATCCAAGGGA  1036

Query 1037  TTCGAAACAGCCGAGTGCCAAAGTACATCTTCCGCCACAATGATGTCAGCCACCTCAGAGAACTGCTGCAAAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCGAAACAGCCGAGTGCCAAAGTACATCTTCCGCCACAATGATGTCAGCCACCTCAGAGAACTGCTGCAAAGA  1110

Query 1111  TCTGACCCCTCAGTCCCCAAGATTGTGGCATTTGAAACTGTCCATTCAATGGATGGGGCGGTGTGCCCACTGGA  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct 1111  TCTGACCCCTCAGTCCCCAAGATTGTGGCATTTGAAACTGTCCATTCAATGGA---------------------  1163

Query 1185  AGAGCTGTGTGATGTGGCCCATGAGTTTGGAGCAATCACCTTCGTGGATGAGGTCCACGCAGTGGGGCTTTATG  1258
                                                                                      
Sbjct 1164  --------------------------------------------------------------------------  1163

Query 1259  GGGCTCGAGGCGGAGGGATTGGGGATCGGGATGGAGTCATGCCAAAAATGGACATCATTTCTGGAACACTTGGC  1332
                                                                                  ||||
Sbjct 1164  ----------------------------------------------------------------------TGGC  1167

Query 1333  AAAGCCTTTGGTTGTGTTGGAGGGTACATCGCCAGCACGAGTTCTCTGATTGACACCGTACGGTCCTATGCTGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168  AAAGCCTTTGGTTGTGTTGGAGGGTACATCGCCAGCACGAGTTCTCTGATTGACACCGTACGGTCCTATGCTGC  1241

Query 1407  TGGCTTCATCTTCACCACCTCTCTGCCACCCATGCTGCTGGCTGGAGCCCTGGAGTCTGTGCGGATCCTGAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242  TGGCTTCATCTTCACCACCTCTCTGCCACCCATGCTGCTGGCTGGAGCCCTGGAGTCTGTGCGGATCCTGAAGA  1315

Query 1481  GCGCTGAGGGACGGGTGCTTCGCCGCCAGCACCAGCGCAACGTCAAACTCATGAGACAGATGCTAATGGATGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316  GCGCTGAGGGACGGGTGCTTCGCCGCCAGCACCAGCGCAACGTCAAACTCATGAGACAGATGCTAATGGATGCC  1389

Query 1555  GGCCTCCCTGTTGTCCACTGCCCCAGCCACATCATCCCTGTGCGGGTTGCAGATGCTGCTAAAAACACAGAAGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390  GGCCTCCCTGTTGTCCACTGCCCCAGCCACATCATCCCTGTGCGGGTTGCAGATGCTGCTAAAAACACAGAAGT  1463

Query 1629  CTGTGATGAACTAATGAGCAGACATAACATCTACGTGCAAGCAATCAATTACCCTACGGTGCCCCGGGGAGAAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464  CTGTGATGAACTAATGAGCAGACATAACATCTACGTGCAAGCAATCAATTACCCTACGGTGCCCCGGGGAGAAG  1537

Query 1703  AGCTCCTACGGATTGCCCCCACCCCTCACCACACACCCCAGATGATGAACTACTTCCTTGAGAATCTGCTAGTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1538  AGCTCCTACGGATTGCCCCCACCCCTCACCACACACCCCAGATGATGAACTACTTCCTTGAGAATCTGCTAGTC  1611

Query 1777  ACATGGAAGCAAGTGGGGCTGGAACTGAAGCCTCATTCCTCAGCTGAGTGCAACTTCTGCAGGAGGCCACTGCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612  ACATGGAAGCAAGTGGGGCTGGAACTGAAGCCTCATTCCTCAGCTGAGTGCAACTTCTGCAGGAGGCCACTGCA  1685

Query 1851  TTTTGAAGTGATGAGTGAAAGAGAGAAGTCCTATTTCTCAGGCTTGAGCAAGTCGGTATCTGCTCAGGCC  1920
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1686  TTTTGAAGTGATGAGTGAAAGAGAGAAGTCCTATTTCTCAGGCTTGAGCAAGTTGGTATCTGCTCAGGCC  1755