Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05811
- Subject:
- NM_139316.2
- Aligned Length:
- 2085
- Identities:
- 1958
- Gaps:
- 126
Alignment
Query 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
Query 75 CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG 148
Query 149 AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC 222
Query 223 ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG 296
Query 297 TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT 370
Query 371 ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC 444
Query 445 CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT 518
Query 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC 592
Query 593 GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG 666
Query 667 CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG 740
Query 741 AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA 814
Query 815 GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG 888
Query 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT 962
Query 963 CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA 1036
Query 1037 AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA 1110
Query 1111 GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAGCCGGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAGCCGGC 1184
Query 1185 TTCTGGTGGTTCATTTAATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTCTGGTGGTTCATTTAATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTA 1258
Query 1259 TGATCTGCAACTTGGCTGAATCTGAACAGGCTCCACCCACAGAGCCAAAAGCAGAGGAGCCTCTGGCTGCTGTC 1332
||||||||||||
Sbjct 1259 TGATCTGCAACT-------------------------------------------------------------- 1270
Query 1333 ACACCTGCCGTTGGTCTGGACCTTGGAATGGACACTCGGGCTGAGGAGCCAGTGGAGGAGGCAGTGATCATACC 1406
||||||||||
Sbjct 1271 ----------------------------------------------------------------TGATCATACC 1280
Query 1407 TGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAGCAGAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281 TGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAGCAGAGG 1354
Query 1481 CGGAGACGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAACTGAAACCACTGAG 1554
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 CGGAGAAGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAACTGAAACCACTGAG 1428
Query 1555 GGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAGGTCATTCCTTCGGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 GGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAGGTCATTCCTTCGGT 1502
Query 1629 GGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGCAGAGCCCAAGGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503 GGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGCAGAGCCCAAGGAGA 1576
Query 1703 CCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCTATCCAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577 CCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCTATCCAG 1650
Query 1777 GACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGCCTCTCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651 GACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGCCTCTCA 1724
Query 1851 GGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATGAACTTA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725 GGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATGAACTTA 1798
Query 1925 CCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGGCTGGTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 CCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGGCTGGTG 1872
Query 1999 GGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCAC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 GGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCAC 1946
Query 2073 CCGACGCTTAGAT 2085
|||||||||||||
Sbjct 1947 CCGACGCTTAGAT 1959