Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05811
- Subject:
- NM_175007.2
- Aligned Length:
- 2127
- Identities:
- 1761
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAAAACGTGCAAAAGCGCCTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
Query 75 CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG 148
|||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CCAGAAGCTGGGGAAGGCTGACGAGACAAAAGATGAACAGTTTGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAGG 148
Query 149 AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC 222
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 149 AGGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGGGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGTATGCAGGAGGCCTCA 222
Query 223 ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG 296
|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 223 ATGAAGCTCACTGAATCTCTACATGAAGTCTACGAGCCAGACTGGTATGGACGGGAAGATGTAAAGATGGTTGG 296
Query 297 TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT 370
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 297 TGAGAAGTGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAGCTAGTGGATGGCTCCTTGCTGACACTGGACACCT 370
Query 371 ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC 444
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 371 ACCTGGGCCAGTTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCTAAGCGCAGCAGGAAGCTTGTGGATTATGATAGTGCT 444
Query 445 CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT 518
|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 445 CGCCATCACCTGGAGGCTCTGCAGAGTTCCAAACGGAAAGATGAGAGTCGGATCTCTAAGGCAGAAGAGGAGTT 518
Query 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTCAATGTTGACTTACAAGAAGAGTTGCCGTCATTGTGGTCAAGTC 592
Query 593 GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG 666
|||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 593 GAGTTGGCTTTTACGTCAATACTTTCAAAAATGTCTCCAGCCTTGAGGCCAAGTTTCATAAGGAAATCGCAGTG 666
Query 667 CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG 740
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 667 CTTTGCCACAAGCTCTATGAAGTGATGACGAAACTCGGTGATCAGCATGCTGACAAGGCCTTCAGCATTCAAGG 740
Query 741 AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA 814
|||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 741 AGCTCCCAGTGACTCGGGTCCTCTTCGCATTGCAAAGACACCATCACCTCCAGAGGAGCCTTCTCCCCTGCCCA 814
Query 815 GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG 888
||||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||..||.||..|.||||||||||||
Sbjct 815 GCCCCACGGCTAGTCCCAACCACACATTAGCACCTGCATCTCCTGCCCCAGTGCGACCCAGATCACCTTCACAG 888
Query 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT 962
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTGCCTAAAGTCACCCCAACAAAGGAACTGAAACAGGAGAACATCAT 962
Query 963 CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA 1036
||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||...|||||||
Sbjct 963 CAATTTCTTTGAGGACAACTTTGTACCAGAAATCAATGTGACAACACCTTCCCAGAACGAAGTCTTGGAGGTGA 1036
Query 1037 AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA 1110
||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||.|||||||||||||.|
Sbjct 1037 AGAAGGAAGAGACTTTGCTGGATTTGGACTTTGACCCTTTCAAGCCCGATGTGGCTCCGGCAGGTTCTGCTGCA 1110
Query 1111 GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAGCCGGC 1184
|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111 GCGACCCACTCTCCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACTTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAACCAGC 1184
Query 1185 TTCTGGTGGTTCATTTAATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTA 1258
||||||.|||||||||||||..|||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||.||
Sbjct 1185 TTCTGGGGGTTCATTTAATGATTTCACCCAGGCCCAGGACACTTCATTATTCACCATGCAGACAGATCAGAATA 1258
Query 1259 TGATCTGCAACTTGGCTGAATCTGAACAGGCTCCACCCACAGAGCCAAAAGCAGAGGAGCCT-CTG-----GCT 1326
||||||||.||||.|||||||.|||.||||||||..||||.||.|||||| ||| |||
Sbjct 1259 ------------TGGCTGAAACTGAGCAGGCTCTACCTACAGAGCCCCAAGCCGAAGAGCCTCCTGCCACTGCT 1320
Query 1327 GCTGTCACACCTGCCGTTGGTCTGGACCTTGGAATGGACACTCGGGCT-------GAGGAGCCAGTGGAGGAGG 1393
|||| |||||.|.|.|||.||||||||| ||||| |||||||||..||||||||
Sbjct 1321 GCTG---CACCTACTGCTGGGCTGGACCTT-------------GGGCTAGAGATGGAGGAGCCAAAGGAGGAGG 1378
Query 1394 CAGTGATCATACCTGGAGCTGATGCTGATGC-AG-CTGTTGGAACCTTGGTGTCAG---CAGCTGAGGGGGCCC 1462
|.||||||...||.|.|.|||||.||| || || ||| |||||.|| .||| ||.|||||||.||||
Sbjct 1379 CTGTGATCCCTCCCGCAACTGATACTG--GCGAGACTG-TGGAAACT-----GCAGTGCCAACTGAGGGTGCCC 1444
Query 1463 CAGGAGAGGAAGCAGAGGCGGAGACGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATT 1536
|.|..||||||||||||||.||||.|||..|..|||||||.||.|||||||.||||..|||||..|||||||||
Sbjct 1445 CGGTGGAGGAAGCAGAGGCAGAGAAGGCAGCCCTCCCTGCTGGAGAAGGAGGAAGTCCAGAGGGAGCCAAAATT 1518
Query 1537 GGAAC--TGAAACCACTGAGGGTG----CAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTG-- 1602
| || .||||.|||.|||..|| |||.|||.|| |||.||.|||.|||||.|||||| ..|||
Sbjct 1519 G--ACGGGGAAAGCACGGAGCTTGCAATCAGTGAGAGC----CCTCAACCAGTGGAGCCCGAAGC--GGGTGCT 1584
Query 1603 CCTCAGGAGAAGGTCATTCCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAAC---GA 1673
|||| |||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||..|||||||||.|| ||
Sbjct 1585 CCTC------AGGTCATCCCTTCTGTTGTCATTGAGCCAGCCTCCAACCATGAAGGAGAAGGAGAACACCAAGA 1652
Query 1674 AATAACTATAGGTGCAGAGCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGC----GAGACA 1743
||...|||..|||.|.||.||.|.||||.||.|.|||||.|.||||.|.|.|||| .|||| ||||..
Sbjct 1653 AACTGCTACGGGTACTGAACCGAGGGAGGCCGCTGAGGATGTGGCTGCCCAGGGC----TCAGCGGGTGAGAAG 1722
Query 1744 CCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCAC---GCCT---TCTGCACCAGCCATGGG 1811
|.|||..|||||||.||||..|.|||| |.|||..|||||.|.|| |||| |||||| ||
Sbjct 1723 CAGGAAGTGGCTACAGAGCCCACGCCT---CTGGATTCTCAGGCAACTCTGCCTGCATCTGCA---------GG 1784
Query 1812 GGCT---GCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGG 1882
.||| |.||.|..||| .||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 TGCTGTGGATGCCTCGCT---GTCTGCAGGGGATGCCACTCAGGAACTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGG 1855
Query 1883 AAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTC 1956
||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1856 AAACCCTGCATGATTTCGAGGCAGCGAACTCTGATGAACTTAACCTACAAAGGGGTGACGTGGTACTCGTGGTG 1929
Query 1957 CCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAG 2030
||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1930 CCTTCAGACTCAGAAGCCGACCAGGATGCAGGCTGGTTGGTGGGGGTGAAGGAGTCAGACTGGCTTCAGTACAG 2003
Query 2031 AGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT 2085
||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|.||.
Sbjct 2004 AGACCTGGCCACGTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACGCGGCGCCTGGAG 2058