Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05811
- Subject:
- XM_006715690.4
- Aligned Length:
- 2461
- Identities:
- 2025
- Gaps:
- 380
Alignment
Query 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
Query 75 CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG 148
Query 149 AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC 222
Query 223 ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG 296
Query 297 TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT 370
Query 371 ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC 444
Query 445 CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT 518
Query 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC 592
Query 593 GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG 666
Query 667 CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG 740
Query 741 AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA 814
Query 815 GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG 888
Query 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT 962
Query 963 CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA 1036
Query 1037 AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA 1110
Query 1111 GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGAC------------AAG--------- 1163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1111 GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACTGACTCTTCAGAAAGTCTTTCCTT 1184
Query 1164 ------CACTGAT-TTGG-------TACAGCC--------GGC--------TTC-------------TGGT--- 1191
| ||||| .||| |.|||.| ||| ||| ||.|
Sbjct 1185 GTGTAAC-CTGATCATGGAGGAAACTCCAGACAGTGGGTTGGCCGAAGAAATTCAAAGATCTCAAAATGATATA 1257
Query 1192 GGTTCATTTAATGG--------------ATTCACACAG-----------------CCCCAGG------------ 1222
|||.||||||.|.| .|.||.|||| ||.||||
Sbjct 1258 GGTGCATTTACTTGGGGCCCTGACGCTAGTACAGACAGGGTCAGCCAAGAAGTTACCTCAGGTGGGTTTGGAGA 1331
Query 1223 ATACT-------TC-------------------------ATTATTCACAA-------------TGCAGACAGAC 1251
|.||| || |||||.|||.| |||.|||.|.|
Sbjct 1332 AGACTCTGCATGTCCCTCCGAAACAGAGCAAGACATAAGATTATCCACCAGCCTGCTTTCGTCTGCTGACTGGC 1405
Query 1252 C------------AGAGTATGATC-TGCAACTTGGC-------------TGAATCTGAACAGGCTCCACCCA-- 1297
| ||||..|||.| |||..|..||| ||.|..|||||| .||.|.||||
Sbjct 1406 CCACTGTAGCTGAAGAGAGTGAGCATGCCCCGGGGCCAGCCTTTCCAGGTGGAAATGAACA-ACTGCCCCCAAA 1478
Query 1298 --CAGAGCCAAAAGC-AGAGGAGCCTCTG-------------------GCTGCTG---------------TCAC 1334
|.|.|||..|.|| .|||..|||..|| ||.|||| |||.
Sbjct 1479 GCCTGCGCCGGAGGCTGGAGTTGCCATTGCTGCTTGTGTGGAGATGGAGCAGCTGTATGACCCACTTGACTCAG 1552
Query 1335 ACCTGCC-------------GTTGGTCTG--------------------------------------------- 1350
||.|||| |.|||.|||
Sbjct 1553 ACATGCCAGCCATGGACACAGCTGGCCTGTTCAAAGAAAGTCATGAAGATATGAAGAAGTCAGATGAAGAGGAA 1626
Query 1351 --------GACCTTGGAATGGACACTC---GGGC---TGAGGAGCC---------------------------- 1382
||...||||| ||..||| |||| ||.||||.|
Sbjct 1627 GAGAAACAGAAGATGGAA--GATTCTCTGTGGGCAGGTGTGGAGGCGTGTCAAAAGGCTTCTGGTGGTTCATTT 1698
Query 1383 AGTGGA-----------------------------------GGAGGCAG---------------------TGAT 1400
|.|||| |.||.||| ||||
Sbjct 1699 AATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTATGATCTGCAACTTGAT 1772
Query 1401 CATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAG 1474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 CATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAG 1846
Query 1475 CAGAGGCGGAGACGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAACTGAAACC 1548
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 CAGAGGCGGAGAAGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAACTGAAACC 1920
Query 1549 ACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAGGTCATTCC 1622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 ACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAGGTCATTCC 1994
Query 1623 TTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGCAGAGCCCA 1696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 TTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGCAGAGCCCA 2068
Query 1697 AGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCT 1770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 AGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCT 2142
Query 1771 ATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGC 1844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 ATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGC 2216
Query 1845 CTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATG 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 CTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATG 2290
Query 1919 AACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGG 1992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 AACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGG 2364
Query 1993 CTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAA 2066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 CTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAA 2438
Query 2067 CTTCACCCGACGCTTAGAT 2085
|||||||||||||||||||
Sbjct 2439 CTTCACCCGACGCTTAGAT 2457