Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05823
- Subject:
- NR_001562.2
- Aligned Length:
- 1362
- Identities:
- 936
- Gaps:
- 364
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------ATGTCTACTGTTCACGAAATCCTGT 25
||.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct 1 CATCTGGGGACGCTCTCAGGTCTTGGTGCCCAGCCCAGCTTCCTTCAAAATATCTGCTGTTCATGAAATCCTGT 74
Query 26 GCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGATCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCTGTCAAAGCCTATACTAACTTT 99
||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct 75 GCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGAACACTCTACACTCCCAAGTGCATTTGGGTCAGTCAAAGCCTACACCAAATTT 148
Query 100 GATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGAAACAGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGGTCACCATTGTCAA 173
||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 149 GATGCTGAGCAGGATGCTTTGAACATTGAAATGGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGATCACCACTGTCAA 222
Query 174 CATTTTGACCAACCGCAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTCGCCTACCAGAGAAGGACCAAAAAGGAAC 247
|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATTTTGACTAACCACAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTCACCTACCAGAGAAGGACCAAAAAGGAAC 296
Query 248 TTGCATCAGCACTGAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGTTGATTTTGGGCCTATTGAAGACACCTGCT 321
|||.|||||||||.||||||||||||||||||||||| |||...||..||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 297 TTGTATCAGCACTTAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCT--AGATAGTGGCTTTGGGCCTATTAAAGACACCTGCT 368
Query 322 CAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGGGCTGGGAACCGACGAGGACTCTCTCATTGAGATCAT 395
||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct 369 CAGTATGATGCTTCTGAGCTAAAATCTTCCATGAAGGGGCTGGGAACCAACAAGGACTCCCTCATTGAGATCAT 442
Query 396 CTGCTCCAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGACTGATCTGGAGA 469
||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 CTGCTCAAGAACCAACCAAGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGACTGATCTGGAGA 516
Query 470 AGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGTAGAAGAGCAGAG 543
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 AGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCTGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGTAGAAGAGCAGAG 590
Query 544 GATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCTCGGGATCTCTATGACGCTGGAGTGAAGAGGAA 617
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 591 GATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCCCGGGATCTCTATGACGCTGGGGTGAAGAGGAA 664
Query 618 AGGAACTGATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCTCCAGAAAGTATTTGATA 691
|||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 665 AGGAACTGAAGTTCCCAAGTGGATCAGCGTCATGACCGAGCGGAGCATGTCCCACTTCCAGAAAGTATTTGATA 738
Query 692 GGTACAAGAGTTACAGCCCTTATGACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGACCTGGAAAATGCT 765
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 739 GGTACAAGAGCTACAGTCCTTATGACATGTTGGAGAGCATCAAGAAAGAGGTTAAAGGAGACCTGGAAAATTCT 812
Query 766 TTCCTGAACCTGGTTCAGTGCATTCAGAACAAGCCCCTGTATTTTGCTGATCGGCTGTATGACTCCATGAAGGG 839
||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.|||
Sbjct 813 TTCCTGAACCTGGTCCAGTGTATTCAGAACAAGCCCCTGTATTTCGCTGACCGGCTGTACGACTCCATAATGGG 886
Query 840 CAAGGGGACGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGACATGTTGAAAATTAGGT 913
||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 CATGGGGACTCAAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCACAATGAAGTGGACATGTTGAAAATTAGGT 960
Query 914 CTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTACTATTATATCCAGCAAGACACTAAGGGCGACTACCAGAAA 987
|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTGAATTCAAGAGAAAGTATAGCAAGTCCCTGTACTATTACATCCAGCAAGACACTAAGGG------------- 1021
Query 988 GCGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGAC-------------------------------------------- 1017
||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1022 ----TGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGGCTGAAGTCCGACACAGCACGAGCGTCCAGAAATGGTGCTCCCCAT 1091
Query 1018 -------------------------------------------------------------------------- 1017
Sbjct 1092 GCTTCCAGCTAACAGGTCTAGAAAACCCGCTTGTGACTAGCAGTCCCTGTGGCTGTTCCTGTGAGGATGACGTT 1165
Query 1018 -------------------------------------------------------------------------- 1017
Sbjct 1166 AGCATTGCCCCCAACCTCATTTTAGTTGCCTAAGCATTGCCTGGCTTTCCTGTCTAGTCTCTCCTGTAAGCCAA 1239
Query 1018 -------------------------------------------------------------------------- 1017
Sbjct 1240 AGAAATGAACATTCCAAGGAATTGGAAGTGAAGTCTATGATGTGAAACACTTTGCCTCCTGTGTACTGTGTCAT 1313
Query 1018 ------------------------------ 1017
Sbjct 1314 AAACGGATTAATAAACTGAATTTGTACTTT 1343