Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05824
• Subject: NR_001562.2
• Aligned Length: 1362
• Identities: 936
• Gaps: 364

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------ATGTCTACTGTTCACGAAATCCTGT  25
                                                             ||.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct    1  CATCTGGGGACGCTCTCAGGTCTTGGTGCCCAGCCCAGCTTCCTTCAAAATATCTGCTGTTCATGAAATCCTGT  74

Query   26  GCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGATCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCTGTCAAAGCCTATACTAACTTT  99
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct   75  GCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGAACACTCTACACTCCCAAGTGCATTTGGGTCAGTCAAAGCCTACACCAAATTT  148

Query  100  GATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGAAACAGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGGTCACCATTGTCAA  173
            ||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct  149  GATGCTGAGCAGGATGCTTTGAACATTGAAATGGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGATCACCACTGTCAA  222

Query  174  CATTTTGACCAACCGCAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTCGCCTACCAGAGAAGGACCAAAAAGGAAC  247
            |||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATTTTGACTAACCACAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTCACCTACCAGAGAAGGACCAAAAAGGAAC  296

Query  248  TTGCATCAGCACTGAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGGTGATTTTGGGCCTATTGAAGACACCTGCT  321
            |||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||  |||..|||..||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  297  TTGTATCAGCACTTAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCT--AGATAGTGGCTTTGGGCCTATTAAAGACACCTGCT  368

Query  322  CAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGGGCTGGGAACCGACGAGGACTCTCTCATTGAGATCAT  395
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct  369  CAGTATGATGCTTCTGAGCTAAAATCTTCCATGAAGGGGCTGGGAACCAACAAGGACTCCCTCATTGAGATCAT  442

Query  396  CTGCTCCAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGACTGATCTGGAGA  469
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  CTGCTCAAGAACCAACCAAGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGACTGATCTGGAGA  516

Query  470  AGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGTAGAAGAGCAGAG  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  AGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCTGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGTAGAAGAGCAGAG  590

Query  544  GATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCTCGGGATCTCTATGACGCTGGAGTGAAGAGGAA  617
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  591  GATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCCCGGGATCTCTATGACGCTGGGGTGAAGAGGAA  664

Query  618  AGGAACTGATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCTCCAGAAAGTATTTGATA  691
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  665  AGGAACTGAAGTTCCCAAGTGGATCAGCGTCATGACCGAGCGGAGCATGTCCCACTTCCAGAAAGTATTTGATA  738

Query  692  GGTACAAGAGTTACAGCCCTTATGACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGACCTGGAAAATGCT  765
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  739  GGTACAAGAGCTACAGTCCTTATGACATGTTGGAGAGCATCAAGAAAGAGGTTAAAGGAGACCTGGAAAATTCT  812

Query  766  TTCCTGAACCTGGTTCAGTGCATTCAGAACAAGCCCCTGTATTTTGCTGATCGGCTGTATGACTCCATGAAGGG  839
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.|||
Sbjct  813  TTCCTGAACCTGGTCCAGTGTATTCAGAACAAGCCCCTGTATTTCGCTGACCGGCTGTACGACTCCATAATGGG  886

Query  840  CAAGGGGACGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGCCTCCCGCAGTGAAGTGGACATGTTGAAAATTAGGT  913
            ||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CATGGGGACTCAAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCACAATGAAGTGGACATGTTGAAAATTAGGT  960

Query  914  CTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTACTATTATATCCAGCAAGACACTAAGGGCGACTACCAGAAA  987
            |||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||             
Sbjct  961  CTGAATTCAAGAGAAAGTATAGCAAGTCCCTGTACTATTACATCCAGCAAGACACTAAGGG-------------  1021

Query  988  GCGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGAC--------------------------------------------  1017
                ||||||||||||||||||||||||.|                                            
Sbjct 1022  ----TGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGGCTGAAGTCCGACACAGCACGAGCGTCCAGAAATGGTGCTCCCCAT  1091

Query 1018  --------------------------------------------------------------------------  1017
                                                                                      
Sbjct 1092  GCTTCCAGCTAACAGGTCTAGAAAACCCGCTTGTGACTAGCAGTCCCTGTGGCTGTTCCTGTGAGGATGACGTT  1165

Query 1018  --------------------------------------------------------------------------  1017
                                                                                      
Sbjct 1166  AGCATTGCCCCCAACCTCATTTTAGTTGCCTAAGCATTGCCTGGCTTTCCTGTCTAGTCTCTCCTGTAAGCCAA  1239

Query 1018  --------------------------------------------------------------------------  1017
                                                                                      
Sbjct 1240  AGAAATGAACATTCCAAGGAATTGGAAGTGAAGTCTATGATGTGAAACACTTTGCCTCCTGTGTACTGTGTCAT  1313

Query 1018  ------------------------------  1017
                                          
Sbjct 1314  AAACGGATTAATAAACTGAATTTGTACTTT  1343