Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05828
- Subject:
- XM_011515333.2
- Aligned Length:
- 2064
- Identities:
- 1649
- Gaps:
- 414
Alignment
Query 1 ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCAGCCTCTCC 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCGGCCTCTCC 74
Query 75 AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGGTGTGTGCTGGTGGTGTCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGGTGTGTGCTGGTGGTGTCTG 148
Query 149 TAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGCCTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGCCTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCT 222
Query 223 GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG 296
Query 297 CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC 370
Query 371 ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG 444
Query 445 ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA 518
Query 519 ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG 592
Query 593 GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG 666
Query 667 GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA 740
Query 741 ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC 814
Query 815 CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT 888
Query 889 GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT 962
Query 963 TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA 1036
Query 1037 ACCTGAAGAAATTTATAGAAAGCTTGTCTAGAAACAAGGTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATG 1110
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACCTGAAGAAATTTATAGAAA----------------------------------------------------- 1057
Query 1111 ATTGGAAATGATGTCTGCAGTGGGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 ----------------------GGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA 1109
Query 1185 CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG 1183
Query 1259 ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGCCAGCTAAATAAAGACATGACCTAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGCCAGCTAAATAAAGACATGACCTAT 1257
Query 1333 GCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAACTGCCTCCAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAACAAGACGTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAACTGCCTCCAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAACAAGACGTT 1331
Query 1407 GCGGACTCTCACTTCAGAGAGAGCAGAGCAACTCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 GCGGACTCTCACTTCAGAGAGAGCAGAGCAACTCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTA 1405
Query 1481 CAAACTTCAATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAATCATACAGGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 CAAACTTCAATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAATCATACAGGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAG 1479
Query 1555 CCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGGATGGATTCCACCCCAACGAG----------------------------- 1599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 CCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGGATGGATTCCACCCCAACGAGAGAAAGAGCATCCTCCTCAAAGGCATATT 1553
Query 1600 -------------------------------------------------------------------------- 1599
Sbjct 1554 AATGACAAGCCAGACACTGGACAACCAAGAATGGACCCAGCTAACATCATGGATAAAGGGAAACCTGACATGCG 1627
Query 1600 ----------------GTGGCTTTGCTGTTGTTGGCGGATCATTTCTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCC 1657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 ACAGCAGAACCAGAGAGTGGCTTTGCTGTTGTTGGCGGATCATTTCTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCC 1701
Query 1658 AAATCCTGGGAAAGGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGGTGTTTGGAGACCAAGGCGGGCAC------ 1725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 AAATCCTGGGAAAGGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGGTGTTTGGAGACCAAGGCGGGCACTGAGCC 1775
Query 1726 -------------------------------------------------------------------------- 1725
Sbjct 1776 TCTCAGGAGCATGCACCCCTGGGGAGCACAGGGAGGCAGAGGCTTGGGTAAACTCATTCCACAAACCCTATGGG 1849
Query 1726 -------------------------------------------------------------------------- 1725
Sbjct 1850 GGCTGCCACGTCACAGGCCCAAAGGACTCTTCTTCAGCAGCATCTTTGCAAAATGTCTTTCTCTCAATGAAGAG 1923
Query 1726 ------------------------------------------------------------------ 1725
Sbjct 1924 CATATCTGGACGACTGTGCAATGCTGTGTGCTCCCGGGATCAGTAACCCTTCCGCTGTTCCTGAAA 1989