Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_05882
Subject:
NM_001130845.2
Aligned Length:
2118
Identities:
2116
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCCTCGCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTCACCCGCCATGCCAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGTCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCGCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTCACCCGCCATGCCAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGTCT  74

Query   75  CCGGAGTCGAGACATCTTGACTGATGTTGTCATTGTTGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAAACGGTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGAGTCGAGACATCTTGACTGATGTTGTCATTGTTGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAAACGGTCC  148

Query  149  TCATGGCCTGCAGTGGCCTGTTCTATAGCATCTTTACAGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTGATCAATCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATGGCCTGCAGTGGCCTGTTCTATAGCATCTTTACAGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTGATCAATCTA  222

Query  223  GATCCTGAGATCAACCCTGAGGGATTCTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTCGGCTCAATTTGCGGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATCCTGAGATCAACCCTGAGGGATTCTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTCGGCTCAATTTGCGGGA  296

Query  297  GGGCAACATCATGGCTGTGATGGCCACGGCTATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTGGACACTTGCCGGAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCAACATCATGGCTGTGATGGCCACGGCTATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTGGACACTTGCCGGAAGT  370

Query  371  TTATTAAGGCCAGTGAAGCAGAGATGGTTTCTGCCATCAAGCCTCCTCGTGAAGAGTTCCTCAACAGCCGGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTATTAAGGCCAGTGAAGCAGAGATGGTTTCTGCCATCAAGCCTCCTCGTGAAGAGTTCCTCAACAGCCGGATG  444

Query  445  CTGATGCCCCAAGACATCATGGCCTATCGGGGTTGTGAGGTGGTGGAGAACAACCTGCCACTGAGGAGCGCCCC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGATGCCCCAAGACATCATGGCCTATCGGGGTCGTGAGGTGGTGGAGAACAACCTGCCACTGAGGAGCGCCCC  518

Query  519  TGGGTGTGAGAGCAGAGCCTTTGCCCCCAGCCTGTACAGTGGCCTGTCCACACCGCCAGCCTCTTATTCCATGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGTGTGAGAGCAGAGCCTTTGCCCCCAGCCTGTACAGTGGCCTGTCCACACCGCCAGCCTCTTATTCCATGT  592

Query  593  ACAGCCACCTCCCTGTCAGCAGCCTCCTCTTCTCCGATGAGGAGTTTCGGGATGTCCGGATGCCTGTGGCCAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGCCACCTCCCTGTCAGCAGCCTCCTCTTCTCCGATGAGGAGTTTCGGGATGTCCGGATGCCTGTGGCCAAC  666

Query  667  CCCTTCCCCAAGGAGCGGGCACTCCCATGTGATAGTGCCAGGCCAGTCCCTGGTGAGTACAGCCGGCCGACTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCTTCCCCAAGGAGCGGGCACTCCCATGTGATAGTGCCAGGCCAGTCCCTGGTGAGTACAGCCGGCCGACTTT  740

Query  741  GGAGGTGTCCCCCAATGTGTGCCACAGCAATATCTATTCACCCAAGGAAACAATCCCAGAAGAGGCACGAAGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGTGTCCCCCAATGTGTGCCACAGCAATATCTATTCACCCAAGGAAACAATCCCAGAAGAGGCACGAAGTG  814

Query  815  ATATGCACTACAGTGTGGCTGAGGGCCTCAAACCTGCTGCCCCCTCAGCCCGAAATGCCCCCTACTTCCCTTGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATATGCACTACAGTGTGGCTGAGGGCCTCAAACCTGCTGCCCCCTCAGCCCGAAATGCCCCCTACTTCCCTTGT  888

Query  889  GACAAGGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCCTCCTCGGAAGATGAGATTGCCCTGCATTTCGAGCCCCCCAATGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAAGGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCCTCCTCGGAAGATGAGATTGCCCTGCATTTCGAGCCCCCCAATGC  962

Query  963  ACCCCTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCACAGAGCCCCCAGAAATCTGACTGCCAGCCCAACTCGCCCACAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCCCTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCACAGAGCCCCCAGAAATCTGACTGCCAGCCCAACTCGCCCACAG  1036

Query 1037  AGTCCTGCAGCAGTAAGAATGCCTGCATCCTCCAGGCTTCTGGCTCCCCTCCAGCCAAGAGCCCCACTGACCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTCCTGCAGCAGTAAGAATGCCTGCATCCTCCAGGCTTCTGGCTCCCCTCCAGCCAAGAGCCCCACTGACCCC  1110

Query 1111  AAAGCCTGCAACTGGAAGAAATACAAGTTCATCGTGCTCAACAGCCTCAATCAGAATGCCAAACCAGAGGGGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCCTGCAACTGGAAGAAATACAAGTTCATCGTGCTCAACAGCCTCAACCAGAATGCCAAACCAGAGGGGCC  1184

Query 1185  TGAGCAGGCTGAGCTGGGCCGCCTTTCCCCACGAGCCTACACGGCCCCACCTGCCTGCCAGCCACCCATGGAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGCAGGCTGAGCTGGGCCGCCTTTCCCCACGAGCCTACACGGCCCCACCTGCCTGCCAGCCACCCATGGAGC  1258

Query 1259  CTGAGAACCTTGACCTCCAGTCCCCAACCAAGCTGAGTGCCAGCGGGGAGGACTCCACCATCCCACAAGCCAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGAGAACCTTGACCTCCAGTCCCCAACCAAGCTGAGTGCCAGCGGGGAGGACTCCACCATCCCACAAGCCAGC  1332

Query 1333  CGGCTCAATAACATCGTTAACAGGTCCATGACGGGCTCTCCCCGCAGCAGCAGCGAGAGCCACTCACCACTCTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGGCTCAATAACATCGTTAACAGGTCCATGACGGGCTCTCCCCGCAGCAGCAGCGAGAGCCACTCACCACTCTA  1406

Query 1407  CATGCACCCCCCGAAGTGCACGTCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATGCAGAGATGTGCCTCCACACCGCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATGCACCCCCCGAAGTGCACGTCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATGCAGAGATGTGCCTCCACACCGCTG  1480

Query 1481  GCCCCACGTTCCCTGAGGAGATGGGAGAGACCCAGTCTGAGTACTCAGATTCTAGCTGTGAGAACGGGGCCTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCCCACGTTCCCTGAGGAGATGGGAGAGACCCAGTCTGAGTACTCAGATTCTAGCTGTGAGAACGGGGCCTTC  1554

Query 1555  TTCTGCAATGAGTGTGACTGCCGCTTCTCTGAGGAGGCCTCACTCAAGAGGCACACGCTGCAGACCCACAGTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCTGCAATGAGTGTGACTGCCGCTTCTCTGAGGAGGCCTCACTCAAGAGGCACACGCTGCAGACCCACAGTGA  1628

Query 1629  CAAACCCTACAAGTGTGACCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAAGACCGTCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAAACCCTACAAGTGTGACCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAAGACCGTCC  1702

Query 1703  ATACCGGTGAGAAACCCTATCGTTGCAACATCTGTGGGGCCCAGTTCAACCGGCCAGCCAACCTGAAAACCCAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATACCGGTGAGAAACCCTATCGTTGCAACATCTGTGGGGCCCAGTTCAACCGGCCAGCCAACCTGAAAACCCAC  1776

Query 1777  ACTCGAATTCACTCTGGAGAGAAGCCCTACAAATGCGAAACCTGCGGAGCCAGATTTGTACAGGTGGCCCACCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACTCGAATTCACTCTGGAGAGAAGCCCTACAAATGCGAAACCTGCGGAGCCAGATTTGTACAGGTGGCCCACCT  1850

Query 1851  CCGTGCCCATGTGCTTATCCACACTGGTGAGAAGCCCTATCCCTGTGAAATCTGTGGCACCCGTTTCCGGCACC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCGTGCCCATGTGCTTATCCACACTGGTGAGAAGCCCTATCCCTGTGAAATCTGTGGCACCCGTTTCCGGCACC  1924

Query 1925  TTCAGACTCTGAAGAGCCACCTGCGAATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACCTGCAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTCAGACTCTGAAGAGCCACCTGCGAATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACCTGCAT  1998

Query 1999  TTCCGTCACAAAAGCCAGCTGCGACTTCACTTGCGCCAGAAGCATGGCGCCATCACCAACACCAAGGTGCAATA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCCGTCACAAAAGCCAGCTGCGACTTCACTTGCGCCAGAAGCATGGCGCCATCACCAACACCAAGGTGCAATA  2072

Query 2073  CCGCGTGTCAGCCACTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC  2118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCGCGTGTCAGCCACTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC  2118