Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05882
- Subject:
- NM_001348026.1
- Aligned Length:
- 2121
- Identities:
- 1889
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGCCTCGCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTCACCCGCCATGCCAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGTCT 74
||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCCTCCCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTTACCCGGCACGCTAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGCCT 74
Query 75 CCGGAGTCGAGACATCTTGACTGATGTTGTCATTGTTGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAAACGGTCC 148
|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 75 CCGGAGTCGGGACATCTTGACGGACGTTGTCATCGTGGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAGACAGTGC 148
Query 149 TCATGGCCTGCAGTGGCCTGTTCTATAGCATCTTTACAGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTGATCAATCTA 222
|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TCATGGCCTGCAGCGGCCTGTTCTACAGTATCTTCACTGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTAATCAATCTA 222
Query 223 GATCCTGAGATCAACCCTGAGGGATTCTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTCGGCTCAATTTGCGGGA 296
||||||||.||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||||
Sbjct 223 GATCCTGAAATCAGCCCTGAGGGGTTTTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTAGGCTCAACCTGAGGGA 296
Query 297 GGGCAACATCATGGCTGTGATGGCCACGGCTATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTGGACACTTGCCGGAAGT 370
.|||||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||
Sbjct 297 AGGCAATATCATGGCGGTGATGACCACAGCCATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTCGACACATGCAGGAAGT 370
Query 371 TTATTAAGGCCAGTGAAGCAGAGATGGTTTCTGCCATCAAGCCTCCTCGTGAAGAGTTCCTCAACAGCCGGATG 444
|.||.|||||||||||||||||.||||...||||..|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 TCATCAAGGCCAGTGAAGCAGAAATGGCCCCTGCACTTAAACCTCCCCGTGAAGAGTTCCTGAACAGCCGGATG 444
Query 445 CTGATGCCCCAAGACATCATGGCCTATCGGGGTTGTGAGGTGGTGGAGAACAACCTGCCACTGAGGAGCGCCCC 518
|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||||||||..||||||||||.|...|.||
Sbjct 445 CTGATGCCCCATGACATCATGGCCTACCGAGGTCGTGAGGTCGTGGAGAACAATATGCCACTGAGAAATACTCC 518
Query 519 TGGGTGTGAGAGCAGAGCCTTTGCCCCCAGCCTGTACAGTGGCCTGTCCACACCGCCAGCCTCTTATTCCATGT 592
.|||||||||||||||||.|||||.||....|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 519 CGGGTGTGAGAGCAGAGCTTTTGCTCCTCCTCTGTACAGTGGCCTGTCAACACCACCAGCCTCTTATCCCATGT 592
Query 593 ACAGCCACCTCCCTGTCAGCAGCCTCCTCTTCTCCGATGAGGAGTTTCGGGATG---TCCGGATGCCTGTGGCC 663
|||||||.|||||..||||||.|.||||||||||.|||||||||.|.||.|||| .|||.||||||||||||
Sbjct 593 ACAGCCATCTCCCGCTCAGCACCTTCCTCTTCTCTGATGAGGAGCTCCGAGATGCCCCCCGAATGCCTGTGGCC 666
Query 664 AACCCCTTCCCCAAGGAGCGGGCACTCCCATGTGATAGTGCCAGGCCAGTCCCTGGTGAGTACAGCCGGCCGAC 737
|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||.|||||||..||||||.|||.||||..|
Sbjct 667 AACCCTTTTCCCAAGGAGCGTGCCCTCCCCTGCGACAGTGCCAGGCAAGTCCCTAATGAGTATAGCAGGCCAGC 740
Query 738 TTTGGAGGTGTCCCCCAATGTGTGCCACAGCAATATCTATTCACCCAAGGAAACAATCCCAGAAGAGGCACGAA 811
..|||||||||||||||.|.||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct 741 CATGGAGGTGTCCCCCAGTTTGTGTCACAGCAACATCTACTCGCCCAAGGAGGCAGTCCCAGAGGAGGCTCGGA 814
Query 812 GTGATATGCACTACAGTGTGGCTGAGGGCCTCAAACCTGCTGCCCCCTCAGCCCGAAATGCCCCCTACTTCCCT 885
||||.||.||||||||||||.|||||||||.|||.|||||||.|||.||.||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 815 GTGACATACACTACAGTGTGCCTGAGGGCCCCAAGCCTGCTGTCCCTTCTGCTCGGAATGCTCCATACTTCCCC 888
Query 886 TGTGACAAGGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCCTCCTCGGAAGATGAGATTGCCCTGCATTTCGAGCCCCCCAA 959
||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGTGACAAAGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCTTCTTCGGAGGATGAGATTGCCCTGCATTTCGAGCCCCCCAA 962
Query 960 TGCACCCCTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCACAGAGCCCCCAGAAATCTGACTGCCAGCCCAACTCGCCCA 1033
|||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 TGCACCCTTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCCCAGAGTCCCCAGAAATCCGACTGCCAGCCCAACTCACCCA 1036
Query 1034 CAGAGTCCTGCAGCAGTAAGAATGCCTGCATCCTCCAGGCTTCTGGCTCCCCTCCAGCCAAGAGCCCCACTGAC 1107
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGAGTCCTGCAGCAGCAAGAACGCCTGCATCCTTCAGGCCTCTGGCTCTCCGCCAGCCAAGAGCCCCACTGAC 1110
Query 1108 CCCAAAGCCTGCAACTGGAAGAAATACAAGTTCATCGTGCTCAACAGCCTCAATCAGAATGCCAAACCAGAGGG 1181
||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 CCGAAAGCCTGCAACTGGAAGAAGTATAAGTTCATCGTTCTCAACAGCCTCAATCAGAATGCCAAACCCGAGGG 1184
Query 1182 GCCTGAGCAGGCTGAGCTGGGCCGCCTTTCCCCACGAGCCTACACGGCCCCACCTGCCTGCCAGCCACCCATGG 1255
..||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 1185 CTCTGAGCAGGCAGAGCTGGGTCGCCTCTCCCCTCGAGCCTACCCTGCACCGCCCGCTTGCCAGCCGCCTATGG 1258
Query 1256 AGCCTGAGAACCTTGACCTCCAGTCCCCAACCAAGCTGAGTGCCAGCGGGGAGGACTCCACCATCCCACAAGCC 1329
||||.|.|||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1259 AGCCCGCGAACCTTGATCTCCAGTCCCCGACCAAGCTCAGTGCCAGTGGGGAGGACTCTACCATCCCCCAAGCC 1332
Query 1330 AGCCGGCTCAATAACATCGTTAACAGGTCCATGACGGGCTCTCCCCGCAGCAGCAGCGAGAGCCACTCACCACT 1403
||||||||||||||..||||.|||||||||.||.|.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1333 AGCCGGCTCAATAATCTCGTGAACAGGTCCCTGGCAGGCTCCCCCCGAAGCAGCAGTGAGAGTCACTCACCACT 1406
Query 1404 CTACATGCACCCCCCGAAGTGCACGTCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATGCAGAGATGTGCCTCCACACCG 1477
|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1407 CTACATGCACCCCCCAAAGTGCACATCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATACAGAGATGTGCCTCCATACTG 1480
Query 1478 CTGGCCCCACGTTCCCTGAGGAGATGGGAGAGACCCAGTCTGAGTACTCAGATTCTAGCTGTGAGAACGGGGCC 1551
||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 1481 CTGGGCCCACGTTCCCGGAGGAGATGGGGGAAACCCAGTCAGAGTATTCGGATTCTAGCTGTGAGAATGGGACC 1554
Query 1552 TTCTTCTGCAATGAGTGTGACTGCCGCTTCTCTGAGGAGGCCTCACTCAAGAGGCACACGCTGCAGACCCACAG 1625
|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555 TTCTTCTGCAACGAATGTGACTGCCGTTTCTCTGAGGAGGCCTCGCTCAAGAGGCACACGCTGCAGACGCACAG 1628
Query 1626 TGACAAACCCTACAAGTGTGACCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAAGACCG 1699
|||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629 TGACAAACCATACAAATGTGATCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAAGACTG 1702
Query 1700 TCCATACCGGTGAGAAACCCTATCGTTGCAACATCTGTGGGGCCCAGTTCAACCGGCCAGCCAACCTGAAAACC 1773
||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703 TCCACACGGGTGAGAAACCCTATCGCTGTAACATTTGTGGAGCGCAGTTCAATCGGCCAGCCAACCTGAAGACC 1776
Query 1774 CACACTCGAATTCACTCTGGAGAGAAGCCCTACAAATGCGAAACCTGCGGAGCCAGATTTGTACAGGTGGCCCA 1847
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1777 CACACTCGAATTCACTCTGGAGAAAAGCCCTACAAATGTGAAACCTGTGGGGCCAGGTTTGTTCAGGTGGCCCA 1850
Query 1848 CCTCCGTGCCCATGTGCTTATCCACACTGGTGAGAAGCCCTATCCCTGTGAAATCTGTGGCACCCGTTTCCGGC 1921
||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1851 CCTCCGTGCCCACGTGCTCATCCACACTGGAGAGAAGCCGTACCCCTGTGAAATCTGTGGCACTCGCTTCCGGC 1924
Query 1922 ACCTTCAGACTCTGAAGAGCCACCTGCGAATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACCTG 1995
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACCTTCAGACTCTGAAGAGCCATCTGCGCATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACCTG 1998
Query 1996 CATTTCCGTCACAAAAGCCAGCTGCGACTTCACTTGCGCCAGAAGCATGGCGCCATCACCAACACCAAGGTGCA 2069
||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CACTTTCGTCACAAAAGCCAACTGCGACTTCATTTGCGCCAGAAGCACGGCGCCATCACCAACACCAAGGTGCA 2072
Query 2070 ATACCGCGTGTCAGCCACTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC 2118
||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ATACCGCGTGTCGGCCGCTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC 2121