Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05933
- Subject:
- NM_001146068.1
- Aligned Length:
- 2100
- Identities:
- 1863
- Gaps:
- 234
Alignment
Query 1 ATGGCGGGCATCGCGGCCAAGCTGGCGAAGGACCGGGAGGCGGCCGAGGGGCTGGGCTCCCACGAGAGGGCCAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAAGTACCTCAACCAGGACTACGAGGCGCTGCGGAACGAGTGCCTGGAGGCCGGGACGCTCTTCCAGGACCCGT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCTTCCCGGCCATCCCCTCGGCCCTGGGCTTCAAGGAGTTGGGGCCCTACTCCAGCAAAACCCGGGGCATCGAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TGGAAGCGCCCCACGGAGATCTGCGCTGACCCCCAGTTTATCATTGGAGGAGCCACCCGCACAGACATCTGCCA 296
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------ATGGAGATCTGCGCTGACCCCCAGTTTATCATTGGAGGAGCCACCCGCACAGACATCTGCCA 62
Query 297 AGGAGCCCTAGGTGACTGCTGGCTGCTGGCAGCCATTGCCTCCCTCACCTTGAATGAAGAAATCCTGGCTCGAG 370
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 AGGAGCCCTGGGTGACTGCTGGCTGCTGGCAGCCATTGCCTCCCTCACCTTGAATGAAGAAATCCTGGCTCGAG 136
Query 371 TCGTCCCCCTAAACCAGAGCTTCCAGGAAAACTATGCAGGGATCTTTCACTTCCAGTTCTGGCAATACGGCGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 TCGTCCCCCTAAACCAGAGCTTCCAGGAAAACTATGCAGGGATCTTTCACTTCCAGTTCTGGCAATACGGCGAG 210
Query 445 TGGGTGGAGGTGGTGGTGGATGACAGGCTGCCCACCAAGGACGGGGAGCTGCTCTTTGTGCATTCAGCCGAAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 TGGGTGGAGGTGGTGGTGGATGACAGGCTGCCCACCAAGGACGGGGAGCTGCTCTTTGTGCATTCAGCCGAAGG 284
Query 519 GAGCGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTGGAGAAGGCATACGCCAAGATCAACGGATGCTATGAAGCACTATCAGGGG 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 285 GAGCGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTGGAGAAGGCATACGCCAAGATCAACGGATGCTATGAAGCGCTATCAGGGG 358
Query 593 GTGCCACCACTGAGGGCTTCGAAGACTTCACCGGAGGCATTGCTGAGTGGTATGAGTTGAAGAAGCCCCCTCCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GTGCCACCACTGAGGGCTTCGAAGACTTCACCGGAGGCATTGCTGAGTGGTATGAGTTGAAGAAGCCCCCTCCC 432
Query 667 AACCTGTTCAAGATCATCCAGAAAGCTCTGCAAAAAGGCTCTCTCCTTGGCTGCTCCATCGACATCACCAGCGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 AACCTGTTCAAGATCATCCAGAAAGCTCTGCAAAAAGGCTCTCTCCTTGGCTGCTCCATCGACATCACCAGCGC 506
Query 741 CGCGGACTCGGAGGCCATCACGTTTCAGAAGCTGGTGAAGGGGCACGCGTACTCGGTCACCGGAGCCGAGGAGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 CGCGGACTCGGAGGCCATCACGTTTCAGAAGCTGGTGAAGGGGCACGCGTACTCGGTCACCGGAGCCGAGGAGG 580
Query 815 TTGAAAGTAACGGAAGCCTACAGAAACTGATCCGCATCCGAAATCCCTGGGGAGAAGTGGAGTGGACAGGGCGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 TTGAAAGTAACGGAAGCCTACAGAAACTGATCCGCATCCGAAATCCCTGGGGAGAAGTGGAGTGGACAGGGCGG 654
Query 889 TGGAATGACAACTGCCCAAGCTGGAACACTATAGACCCAGAGGAGAGGGAAAGGCTGACCAGACGGCATGAAGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TGGAATGACAACTGCCCAAGCTGGAACACTATAGACCCAGAGGAGAGGGAAAGGCTGACCAGACGGCATGAAGA 728
Query 963 TGGAGAATTCTGGATGTCTTTCAGTGACTTCCTGAGGCACTATTCCCGCCTGGAGATCTGTAACCTGACCCCAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 TGGAGAATTCTGGATGTCTTTCAGTGACTTCCTGAGGCACTATTCCCGCCTGGAGATCTGTAACCTGACCCCAG 802
Query 1037 ACACTCTCACCAGCGATACCTACAAGAAGTGGAAACTCACCAAAATGGATGGGAACTGGAGGCGGGGCTCCACC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 ACACTCTCACCAGCGATACCTACAAGAAGTGGAAACTCACCAAAATGGATGGGAACTGGAGGCGGGGCTCCACC 876
Query 1111 GCGGGAGGTTGCAGGAACTACCCGAACACATTCTGGATGAACCCTCAGTACCTGATCAAGCTGGAGGAGGAGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 GCGGGAGGTTGCAGGAACTACCCGAACACATTCTGGATGAACCCTCAGTACCTGATCAAGCTGGAGGAGGAGGA 950
Query 1185 TGAGGACGAGGAGGATGGGGAGAGCGGCTGCACCTTCCTGGTGGGGCTCATTCAGAAGCACCGACGGCGGCAGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 TGAGGACGAGGAGGATGGGGAGAGCGGCTGCACCTTCCTGGTGGGGCTCATTCAGAAGCACCGACGGCGGCAGA 1024
Query 1259 GGAAGATGGGCGAGGACATGCACACCATCGGCTTTGGCATCTATGAGGTTCCAGAGGAGTTAAGTGGGCAGACC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 GGAAGATGGGCGAGGACATGCACACCATCGGCTTTGGCATCTATGAGGTTCCAGAGGAGTTAAGTGGGCAGACC 1098
Query 1333 AACATCCACCTCAGCAAAAACTTCTTCCTGACGAATCGCGCCAGGGAGCGCTCAGACACCTTCATCAACCTCCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 AACATCCACCTCAGCAAAAACTTCTTCCTGACGAATCGCGCCAGGGAGCGCTCAGACACCTTCATCAACCTCCG 1172
Query 1407 GGAGGTGCTCAACCGCTTCAAGCTGCCGCCAGGAGAGTACATTCTCGTGCCTTCCACCTTCGAACCCAACAAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 GGAGGTGCTCAACCGCTTCAAGCTGCCGCCAGGAGAGTACATTCTCGTGCCTTCCACCTTCGAACCCAACAAGG 1246
Query 1481 ATGGGGATTTCTGCATCCGGGTCTTTTCTGAAAAGAAAGCTGACTACCAAGCTGTCGATGATGAAATCGAGGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 ATGGGGATTTCTGCATCCGGGTCTTTTCTGAAAAGAAAGCTGACTACCAAGCTGTCGATGATGAAATCGAGGCC 1320
Query 1555 AATCTTGAAGAGTTCGACATCAGCGAGGATGACATTGATGATGGATTCAGGAGACTGTTTGCCCAGTTGGCAGG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 AATCTTGAAGAGTTCGACATCAGCGAGGATGACATTGATGATGGATTCAGGAGACTGTTTGCCCAGTTGGCAGG 1394
Query 1629 AGAGGATGCGGAGATCTCTGCCTTTGAGCTGCAGACCATCCTGAGAAGGGTTCTAGCAAAGCGCCAAGATATCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 AGAGGATGCGGAGATCTCTGCCTTTGAGCTGCAGACCATCCTGAGAAGGGTTCTAGCAAAGCGCCAAGATATCA 1468
Query 1703 AGTCAGATGGCTTCAGCATCGAGACATGCAAAATTATGGTTGACATGCTAGATTCGGACGGGAGTGGCAAGCTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469 AGTCAGATGGCTTCAGCATCGAGACATGCAAAATTATGGTTGACATGCTAGATTCGGACGGGAGTGGCAAGCTG 1542
Query 1777 GGGCTGAAGGAGTTCTACATTCTCTGGACGAAGATTCAAAAATACCAAAAAATTTACCGAGAAATCGACGTTGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 GGGCTGAAGGAGTTCTACATTCTCTGGACGAAGATTCAAAAATACCAAAAAATTTACCGAGAAATCGACGTTGA 1616
Query 1851 CAGGTCTGGTACCATGAATTCCTATGAAATGCGGAAGGCATTAGAAGAAGCAGGTTTCAAGATGCCCTGTCAAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 CAGGTCTGGTACCATGAATTCCTATGAAATGCGGAAGGCATTAGAAGAAGCAGGTTTCAAGATGCCCTGTCAAC 1690
Query 1925 TCCACCAAGTCATCGTTGCTCGGTTTGCAGATGACCAGCTCATCATCGATTTTGATAATTTTGTTCGGTGTTTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 TCCACCAAGTCATCGTTGCTCGGTTTGCAGATGACCAGCTCATCATCGATTTTGATAATTTTGTTCGGTGTTTG 1764
Query 1999 GTTCGGCTGGAAACGCTATTCAAGATATTTAAGCAGCTGGATCCCGAGAATACTGGAACAATAGAGCTCGACCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 GTTCGGCTGGAAACGCTATTCAAGATATTTAAGCAGCTGGATCCCGAGAATACTGGAACAATAGAGCTCGACCT 1838
Query 2073 TATCTCTTGGCTCTGTTTCTCAGTACTT 2100
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 TATCTCTTGGCTCTGTTTCTCAGTACTT 1866