Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05955
• Subject: NM_006725.5
• Aligned Length: 2004
• Identities: 2000
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTGGCTCTTCTTCGGGATCACTGGATTGCTGACGGCAGCCCTCTCAGGTCATCCATCTCCAGCCCCACCTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGCTCTTCTTCGGGATCACTGGATTGCTGACGGCAGCCCTCTCAGGTCATCCATCTCCAGCCCCACCTGA  74

Query   75  CCAGCTCAACACCAGCAGTGCAGAGAGTGAGCTCTGGGAGCCAGGGGAGCGGCTTCCGGTCCGTCTGACAAACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCTCAACACCAGCAGTGCAGAGAGTGAGCTCTGGGAGCCAGGGGAGCGGCTTCCGGTCCGTCTGACAAACG  148

Query  149  GGAGCAGCAGCTGCAGCGGGACGGTGGAGGTGCGGCTCGAGGCGTCCTGGGAGCCCGCGTGCGGGGCGCTCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAGCAGCAGCTGCAGCGGGACGGTGGAGGTGCGGCTCGAGGCGTCCTGGGAGCCCGCGTGCGGGGCGCTCTGG  222

Query  223  GACAGCCGCGCCGCCGAGGCCGTGTGCCGAGCACTGGGCTGCGGCGGGGCGGAGGCCGCCTCTCAGCTCGCCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGCCGCGCCGCCGAGGCCGTGTGCCGAGCACTGGGCTGCGGCGGGGCGGAGGCCGCCTCTCAGCTCGCCCC  296

Query  297  GCCGACCCCTGAGCTGCCGCCCCCGCCTGCAGCCGGGAACACCAGCGTAGCAGCTAATGCCACTCTGGCCGGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCGACCCCTGAGCTGCCGCCCCCGCCTGCAGCCGGGAACACCAGCGTAGCAGCTAATGCCACTCTGGCCGGGG  370

Query  371  CGCCCGCCCTCCTGTGCAGCGGCGCCGAGTGGCGGCTCTGCGAGGTGGTGGAGCACGCGTGCCGCAGCGACGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGCCCGCCCTCCTGTGCAGCGGCGCCGAGTGGCGGCTCTGCGAGGTGGTGGAGCACGCGTGCCGCAGCGACGGG  444

Query  445  AGGCGGGCCCGTGTCACCTGTGCAGAGAACCGCGCGCTGCGCCTGGTGGACGGTGGCGGCGCCTGCGCCGGCCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCGGGCCCGTGTCACCTGTGCAGAGAACCGCGCGCTGCGCCTGGTGGACGGTGGCGGCGCCTGCGCCGGCCG  518

Query  519  CGTGGAGATGCTGGAGCATGGCGAGTGGGGATCAGTGTGCGATGACACTTGGGACCTGGAGGACGCCCACGTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTGGAGATGCTGGAGCATGGCGAGTGGGGATCAGTGTGCGATGACACTTGGGACCTGGAGGACGCCCACGTGG  592

Query  593  TGTGCAGGCAACTGGGCTGCGGCTGGGCAGTCCAGGCCCTGCCCGGCTTGCACTTCATGCCCGGCCGCGGGCCT  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTGCAGGCAACTGGGCTGCGGCTGGGCAGTCCAGGCCCTGCCCGGCTTGCACTTCACGCCCGGCCGCGGGCCT  666

Query  667  ATCCACCGGGACCAGGTGAACTGCTCGGGGGCCGAAGCTTACCTGTGGGACTGCCCGGGGCTGCCAGGACAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCCACCGGGACCAGGTGAACTGCTCGGGGGCCGAAGCTTACCTGTGGGACTGCCCGGGGCTGCCAGGACAGCA  740

Query  741  CTACTGCGGCCACAAAGAGGACGCGGGCGTGGTGTGCTCAGAGCACCAGTCCTGGCGCCTGACAGGGGGCGCTG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTACTGCGGCCACAAAGAGGACGCGGGCGCGGTGTGCTCAGAGCACCAGTCCTGGCGCCTGACAGGGGGCGCTG  814

Query  815  ACCGCTGCGAGGGGCAGGTGGAGGTACACTTCCGAGGGGTCTGGAACACAGTGTGTGACAGTGAGTGGTACCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGCTGCGAGGGGCAGGTGGAGGTACACTTCCGAGGGGTCTGGAACACAGTGTGTGACAGTGAGTGGTACCCA  888

Query  889  TCGGAGGCCAAGGTGCTCTGCCAGTCCTTGGGCTGTGGAACTGCGGTTGAGAGGCCCAAGGGGCTGCCCCACTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCGGAGGCCAAGGTGCTCTGCCAGTCCTTGGGCTGTGGAACTGCGGTTGAGAGGCCCAAGGGGCTGCCCCACTC  962

Query  963  CTTGTCCGGCAGGATGTACTACTCATGCAATGGGGAGGAGCTCACCCTCTCCAACTGCTCCTGGCGGTTCAACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGTCCGGCAGGATGTACTACTCATGCAATGGGGAGGAGCTCACCCTCTCCAACTGCTCCTGGCGGTTCAACA  1036

Query 1037  ACTCCAACCTCTGCAGCCAGTCGCTGGCAGCCAGGGTCCTCTGCTCAGCTTCCCGGAGTTTGCACAATCTGTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTCCAACCTCTGCAGCCAGTCGCTGGCAGCCAGGGTCCTCTGCTCAGCTTCCCGGAGTTTGCACAATCTGTCC  1110

Query 1111  ACTCCCGAAGTCCCTGCAAGTGTTCAGACAGTCACTATAGAATCTTCTGTGACAGTGAAAATAGAGAACAAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTCCCGAAGTCCCTGCAAGTGTTCAGACAGTCACTATAGAATCTTCTGTGACAGTGAAAATAGAGAACAAGGA  1184

Query 1185  ATCTCGGGAGCTAATGCTCCTCATCCCCTCCATCGTTCTGGGAATTCTCCTCCTTGGCTCCCTCATCTTCATAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATCTCGGGAGCTAATGCTCCTCATCCCCTCCATCGTTCTGGGAATTCTCCTCCTTGGCTCCCTCATCTTCATAG  1258

Query 1259  CCTTCATCCTCTTGAGAATTAAAGGAAAATATGCCCTCCCCGTAATGGTGAACCACCAGCACCTACCCACCACC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTTCATCCTCTTGAGAATTAAAGGAAAATATGCCCTCCCCGTAATGGTGAACCACCAGCACCTACCCACCACC  1332

Query 1333  ATCCCGGCAGGGAGCAATAGCTATCAACCGGTCCCCATCACCATCCCCAAAGAAGTTTTCATGCTGCCCATCCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCCCGGCAGGGAGCAATAGCTATCAACCGGTCCCCATCACCATCCCCAAAGAAGTTTTCATGCTGCCCATCCA  1406

Query 1407  GGTCCAGGCCCCGCCCCCTGAGGACTCAGACTCTGGCTCGGACTCAGACTATGAGCACTATGACTTCAGCGCCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTCCAGGCCCCGCCCCCTGAGGACTCAGACTCTGGCTCGGACTCAGACTATGAGCACTATGACTTCAGCGCCC  1480

Query 1481  AGCCTCCTGTGGCCCTGACCACCTTCTACAATTCCCAGCGGCATCGGGTCACAGATGAGGAGGTCCAGCAAAGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCCTCCTGTGGCCCTGACCACCTTCTACAATTCCCAGCGGCATCGGGTCACAGATGAGGAGGTCCAGCAAAGC  1554

Query 1555  AGGTTCCAGATGCCACCCTTGGAGGAAGGACTTGAAGAGTTGCATGCCTCCCACATCCCAACTGCCAACCCTGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGGTTCCAGATGCCACCCTTGGAGGAAGGACTTGAAGAGTTGCATGCCTCCCACATCCCAACTGCCAACCCTGG  1628

Query 1629  ACACTGCATTACAGACCCGCCATCCCTGGGCCCTCAGTATCACCCGAGGAGCAACAGTGAGTCGAGCACCTCTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACACTGCATTACAGACCCGCCATCCCTGGGCCCTCAGTATCACCCGAGGAGCAACAGTGAGTCGAGCACCTCTT  1702

Query 1703  CGGGGGAGGATTACTGCAATAGTCCCAAAAGCAAGCTGCCTCCATGGAACCCCCAGGTGTTTTCTTCAGAGAGG  1776
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGGGGAGGATTACTGCAATAGTCCCAAAAGCAAGCTGCCTCCATGGAACCCCCAGGTGTTTTCTTCAGAGAGG  1776

Query 1777  AGTTCCTTCCTGGAGCAGCCCCCAAACTTGGAGCTGGCCAGCACCCAGCCAGCCTTTTCAGCAGGGCCCCCGGC  1850
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGTTCCTTCCTGGAGCAGCCCCCAAACTTGGAGCTGGCCGGCACCCAGCCAGCCTTTTCAGCAGGGCCCCCGGC  1850

Query 1851  TGATGACAGCTCCAGCACCTCATCCGGGGAGTGGTACCAGAACTTCCAGCCACCACCCCAGCCCCCTTCGGAGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGATGACAGCTCCAGCACCTCATCCGGGGAGTGGTACCAGAACTTCCAGCCACCACCCCAGCCCCCTTCGGAGG  1924

Query 1925  AGCAGTTTGGCTGTCCAGGGTCCCCCAGCCCTCAGCCTGACTCCACCGACAACGATGACTACGATGACATCAGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGCAGTTTGGCTGTCCAGGGTCCCCCAGCCCTCAGCCTGACTCCACCGACAACGATGACTACGATGACATCAGC  1998

Query 1999  GCAGCC  2004
            ||||||
Sbjct 1999  GCAGCC  2004