Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05979
• Subject: NM_130860.3
• Aligned Length: 1116
• Identities: 996
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGAAGCAGTACGACTCGGTGGAGTGCCCTTTTTGTGATGAAGTTTCCAAATACGAGAAGCTCGCCAAGAT  74
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||..||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAAGCAGTACGACTCGGTGGAATGCCCGTTCTGCGATGAGGTCACCAAGTACGAGAAACTTGCCAAGAT  74

Query   75  CGGCCAAGGCACCTTCGGGGAGGTGTTCAAGGCCAGGCACCGCAAGACCGGCCAGAAGGTGGCTCTGAAGAAGG  148
            ||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||.||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CGGCCAAGGCACATTCGGGGAAGTCTTTAAAGCCAAGCACCGTCAGACGGGCCAGAAGGTGGCTCTGAAGAAAG  148

Query  149  TGCTGATGGAAAACGAGAAGGAGGGGTTCCCCATTACAGCCTTGCGGGAGATCAAGATCCTTCAGCTTCTAAAA  222
            ||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  149  TGTTGATGGAGAATGAGAAGGAGGGGTTCCCCATCACAGCCTTGAGGGAAATCAAGATTCTACAGCTCCTAAAA  222

Query  223  CACGAGAATGTGGTCAACTTGATTGAGATTTGTCGAACCAAAGCTTCCCCCTATAACCGCTGCAAGGGTAGTAT  296
            ||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  223  CATGAGAATGTGGTGAACCTAATTGAGATTTGTCGGACCAAAGCCTCACCGTATAACCGCTGCAAGGGCAGCAT  296

Query  297  ATACCTGGTGTTCGACTTCTGCGAGCATGACCTTGCTGGGCTGTTGAGCAATGTTTTGGTCAAGTTCACGCTGT  370
            .||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||||||.|||
Sbjct  297  CTATCTGGTGTTTGACTTCTGTGAGCATGACCTTGCTGGGCTGCTGAGCAACGTCTTAGTCAAGTTCACGTTGT  370

Query  371  CTGAGATCAAGAGGGTGATGCAGATGCTGCTTAACGGCCTCTACTACATCCACAGAAACAAGATCCTGCATAGG  444
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CTGAGATCAAGAGAGTGATGCAGATGCTGCTGAACGGCCTCTACTACATCCACAGGAACAAGATCCTGCACAGG  444

Query  445  GACATGAAGGCTGCTAATGTGCTTATCACTCGTGATGGGGTCCTGAAGCTGGCAGACTTTGGGCTGGCCCGGGC  518
            ||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  GACATGAAGGCTGCGAATGTGCTCATTACCCGGGATGGGGTCCTGAAGCTGGCAGATTTTGGGCTGGCCCGTGC  518

Query  519  CTTCAGCCTGGCCAAGAACAGCCAGCCCAACCGCTACACCAACCGTGTGGTGACACTCTGGTACCGGCCCCCGG  592
            |||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||
Sbjct  519  CTTCAGCCTAGCTAAGAATAGCCAGCCCAACCGATACACCAACCGTGTGGTGACATTGTGGTACCGGCCTCCGG  592

Query  593  AGCTGTTGCTCGGGGAGCGGGACTACGGCCCCCCCATTGACCTGTGGGGTGCTGGGTGCATCATGGCAGAGATG  666
            |||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTGCTGCTCGGAGAGCGGGACTACGGCCCGCCCATTGACCTTTGGGGTGCTGGGTGCATCATGGCAGAGATG  666

Query  667  TGGACCCGCAGCCCCATCATGCAGGGCAACACGGAGCAGCACCAACTCGCCCTCATCAGTCAGCTCTGCGGCTC  740
            |||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  TGGACTCGTAGCCCTATCATGCAGGGTAACACAGAGCAGCACCAGCTCGCCCTCATCAGCCAGCTCTGTGGCTC  740

Query  741  CATCACCCCTGAGGTGTGGCCAAACGTGGACAACTATGAGCTGTACGAAAAGCTGGAGCTGGTCAAGGGCCAGA  814
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  741  CATCACCCCAGAGGTGTGGCCAAACGTAGACAAGTATGAGCTGTTTGAAAAGCTGGAACTTGTGAAGGGCCAGA  814

Query  815  AGCGGAAGGTGAAGGACAGGCTGAAGGCCTATGTGCGTGACCCATACGCACTGGACCTCATCGACAAGCTGCTG  888
            |||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  AGCGGAAGGTGAAGGACCGTCTGAAGGCCTACGTGCGCGACCCCTATGCTCTGGACCTCATTGACAAGCTGCTG  888

Query  889  GTGCTGGACCCTGCCCAGCGCATCGACAGCGATGACGCCCTCAACCACGACTTCTTCTGGTCCGACCCCATGCC  962
            |||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GTGCTGGACCCCGCGCAGCGGATTGACAGTGACGATGCCCTCAACCACGACTTCTTCTGGTCGGACCCCATGCC  962

Query  963  CTCCGACCTCAAGGGCATGCTCTCCACCCACCTGACGTCCATGTTCGAGTACTTGGCACCACCGCGCCGGAAGG  1036
            |||.|||||||||||||||||.||.||.|||.|||||||.|||||.||||||.|||||||.||.||.|||||||
Sbjct  963  CTCGGACCTCAAGGGCATGCTGTCTACTCACTTGACGTCTATGTTTGAGTACCTGGCACCGCCACGGCGGAAGG  1036

Query 1037  GCAGCCAGATCACCCAGCAGTCCACCAACCAGAGTCGCAATCCCGCCACCACCAACCAGACGGAGTTTGAGCGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1037  GCAGCCAGATCACCCAGCAGTCCACCAACCAGAGCAGAAATCCCGCCACCACCAACCAGACGGAATTTGAACGT  1110

Query 1111  GTCTTC  1116
            ||||||
Sbjct 1111  GTCTTC  1116