Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05989
• Subject: NM_205845.2
• Aligned Length: 972
• Identities: 860
• Gaps: 6

Alignment

Query   1  ATGGATCCCAAATATCAGCGTGTAGAGCTAAATGATGGTCACTTCATGCCCGTATTGGGATTTGGCACCTATGC  74
           ||||||.|.|||||.|||.||||..||||.||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATTCGAAATACCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74

Query  75  ACCTCCAGAGGTTCCGAGGAACAGAGCTGTAGAGGTCACCAAATTAGCAATAGAAGCTGGCTTCCGCCATATTG  148
           .|||.||||||||||.|..|..|.||||.||||||.|..||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||
Sbjct  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTCTAGAGGCCGTCAAATTGGCAATAGAAGCCGGGTTCCACCATATTG  148

Query 149  ATTCTGCTTATTTATACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222
           |||||||..||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATTCTGCACATGTTTACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222

Query 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGTGCACTTTCTTTCAACCACAGATGGTCCAACCAGCCTT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||.|..||.||||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGAGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296

Query 297  GGAAAGCTCACTGAAAAAACTTCAACTGGACTATGTTGACCTCTATCTTCTTCATTTCCCAATGGCTCTCAAGC  370
           ||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.||.||.|.||||
Sbjct 297  GGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGACTATGTTGACCTCTATCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAAAGC  370

Query 371  CAGGTGA-GACGCCACTACCAAAAGATGAAAATGGAAAAGTAATATTCGACACAGTGGATCTCTCTGCCACATG  443
           ||||||| ||.|..| |.|||||||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371  CAGGTGAGGAAGTGA-TCCCAAAAGATGAAAATGGAAAAATACTATTTGACACAGTGGATCTCTGTGCCACATG  443

Query 444  GGAGGTCATGGAGAAGTGTAAGGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCAAACTTCAACTACAGGCAGC  517
           |||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||.||
Sbjct 444  GGAGGCCATGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCACAGGCTGC  517

Query 518  TGGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGACTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTAGAATGTCATCCTTACCTC  591
           |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 518  TGGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTC  591

Query 592  AACCAGAGCAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCCACAGTGCTCTGGGAACCCA  665
           ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||
Sbjct 592  AACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCA  665

Query 666  ACGACATAAACTATGGGTGGACCCAAACTCCCCAGTTCTTTTGGAGGACCCAGTTCTTTGTGCCTTAGCAAAGA  739
           .|||.|..|||.||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 666  TCGAGAAGAACCATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAA  739

Query 740  AACACAAACGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGC  813
           |.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740  AGCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGC  813

Query 814  TACAATGAGCAGCGGATCAGAGAGAACATCCAGGTTTTTGAATTCCAGTTGACATCAGAGGATATGAAAGTTCT  887
           ||||||||||||||.||||||.|||||.|.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||...|
Sbjct 814  TACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCAT  887

Query 888  AGATGGTCTAAACAGAAATTATCGATATGTTG-TCATGGAT-TTTCTTATGGACCATCCTGATTATCCATTTTC  959
           ||||||.||||||||||||...|||||| ||| .|.|.||| |||.|..||| ||..|||.|||||||||||||
Sbjct 888  AGATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATAT-TTGACCCTTGATATTTTTGCTGG-CCCCCCTAATTATCCATTTTC  959

Query 960  AGATGAATAT  969
           .|||||||||
Sbjct 960  TGATGAATAT  969