Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05999
• Subject: NM_001320917.2
• Aligned Length: 1596
• Identities: 1594
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAGGGGATTCTTACCACAATGCAACCACCGTCAATGGCACCCCAGTAAATCACCAGCCTTTGGAACGCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGGGGATTCTTACCACAATGCAACCACCGTCAATGGCACCCCAGTAAATCACCAGCCTTTGGAACGCCA  74

Query   75  CAGGTTGTGGGAAGTCATCACCATTGCAGCTGTGACTGCTGTGGTAAGCCTGATCACCATTGTGGGCAATGTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGGTTGTGGGAAGTCATCACCATTGCAGCTGTGACTGCTGTGGTAAGCCTGATCACCATTGTGGGCAATGTCT  148

Query  149  TGGTCATGATCTCCTTCAAAGTCAACAGCCAGCTCAAGACAGTTAACAACTATTACCTGCTCAGCTTAGCCTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTCATGATCTCCTTCAAAGTCAACAGCCAGCTCAAGACAGTTAACAACTATTACCTGCTCAGCTTAGCCTGT  222

Query  223  GCAGATCTCATCATTGGAATCTTCTCCATGAACCTCTACACCACCTACATCCTCATGGGACGCTGGGCTCTCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGATCTCATCATTGGAATCTTCTCCATGAACCTCTACACCACCTACATCCTCATGGGACGCTGGGCTCTCGG  296

Query  297  GAGTCTGGCTTGTGACCTTTGGCTTGCACTGGACTACGTGGCCAGCAACGCTTCTGTCATGAACCTTCTGGTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGTCTGGCTTGTGACCTTTGGCTTGCACTGGACTACGTGGCCAGCAACGCTTCTGTCATGAACCTTCTGGTGA  370

Query  371  TCAGTTTTGACCGTTACTTTTCCATCACAAGACCCTTGACATATCGGGCCAAGCGTACTCCGAAAAGGGCTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGTTTTGACCGTTACTTTTCCATCACAAGACCCTTGACATATCGGGCCAAGCGTACTCCGAAAAGGGCTGGC  444

Query  445  ATCATGATTGGCTTGGCCTGGCTGATCTCCTTCATCCTCTGGGCCCCAGCAATCCTCTGCTGGCAGTACTTGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCATGATTGGCTTGGCCTGGCTGATCTCCTTCATCCTCTGGGCCCCAGCAATCCTCTGCTGGCAGTACTTGGT  518

Query  519  TGGGAAGCGTACAGTTCCACTGGATGAGTGCCAGATCCAGTTTCTCTCTGAGCCCACCATCACTTTTGGCACTG  592
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGAAGCGGACAGTTCCACTGGATGAGTGCCAGATCCAGTTTCTCTCTGAGCCCACCATCACTTTTGGCACTG  592

Query  593  CCATTGCTGCCTTCTACATCCCTGTTTCTGTCATGACCATCCCCTACTGTCGAATCTACCGGGAAACAGAGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCATTGCTGCCTTCTACATCCCTGTTTCTGTCATGACCATCCTCTACTGTCGAATCTACCGGGAAACAGAGAAG  666

Query  667  CGAACCAAGGACCTGGCTGACCTCCAGGGTTCTGACTCTGTGACCAAAGCTGAGAAGAGAAAGCCAGCTCATAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGAACCAAGGACCTGGCTGACCTCCAGGGTTCTGACTCTGTGACCAAAGCTGAGAAGAGAAAGCCAGCTCATAG  740

Query  741  GGCTCTGTTCAGATCCTGCTTGCGCTGTCCTCGACCCACCCTGGCCCAGCGGGAAAGGAACCAGGCCTCCTGGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCTCTGTTCAGATCCTGCTTGCGCTGTCCTCGACCCACCCTGGCCCAGCGGGAAAGGAACCAGGCCTCCTGGT  814

Query  815  CATCCTCCCGCAGGAGCACCTCCACCACTGGGAAGCCATCCCAAGCCACTGGCCCAAGCGCCAATTGGGCCAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATCCTCCCGCAGGAGCACCTCCACCACTGGGAAGCCATCCCAAGCCACTGGCCCAAGCGCCAATTGGGCCAAA  888

Query  889  GCTGAGCAGCTCACCACCTGTAGCAGCTACCCTTCCTCAGAGGATGAGGACAAGCCCGCCACTGACCCTGTCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTGAGCAGCTCACCACCTGTAGCAGCTACCCTTCCTCAGAGGATGAGGACAAGCCCGCCACTGACCCTGTCCT  962

Query  963  CCAAGTGGTCTACAAGAGTCAGGGTAAGGAAAGCCCAGGGGAAGAATTCAGTGCTGAAGAGACTGAGGAAACTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAAGTGGTCTACAAGAGTCAGGGTAAGGAAAGCCCAGGGGAAGAATTCAGTGCTGAAGAGACTGAGGAAACTT  1036

Query 1037  TTGTGAAAGCTGAAACTGAAAAAAGTGACTATGACACCCCAAACTACCTTCTGTCTCCAGCAGCTGCTCATAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGTGAAAGCTGAAACTGAAAAAAGTGACTATGACACCCCAAACTACCTTCTGTCTCCAGCAGCTGCTCATAGA  1110

Query 1111  CCCAAGAGTCAGAAATGTGTGGCCTATAAGTTCCGATTGGTGGTAAAAGCTGACGGGAACCAGGAGACCAACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCAAGAGTCAGAAATGTGTGGCCTATAAGTTCCGATTGGTGGTAAAAGCTGACGGGAACCAGGAGACCAACAA  1184

Query 1185  TGGCTGTCACAAGGTGAAAATCATGCCCTGCCCCTTCCCAGTGGCCAAGGAACCTTCAACGAAAGGCCTCAATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGCTGTCACAAGGTGAAAATCATGCCCTGCCCCTTCCCAGTGGCCAAGGAACCTTCAACGAAAGGCCTCAATC  1258

Query 1259  CCAACCCCAGCCATCAAATGACCAAACGAAAGAGAGTGGTCCTAGTCAAAGAGAGGAAAGCAGCCCAGACACTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAACCCCAGCCATCAAATGACCAAACGAAAGAGAGTGGTCCTAGTCAAAGAGAGGAAAGCAGCCCAGACACTG  1332

Query 1333  AGTGCCATTCTCCTGGCCTTCATCATCACATGGACCCCGTATAACATCATGGTCCTGGTTTCTACCTTCTGTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGCCATTCTCCTGGCCTTCATCATCACATGGACCCCGTATAACATCATGGTCCTGGTTTCTACCTTCTGTGA  1406

Query 1407  CAAGTGTGTCCCAGTCACCCTGTGGCACTTGGGCTATTGGTTGTGCTATGTCAATAGCACTGTCAACCCCATCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGTGTGTCCCAGTCACCCTGTGGCACTTGGGCTATTGGTTGTGCTATGTCAATAGCACTGTCAACCCCATCT  1480

Query 1481  GCTATGCCCTCTGCAACAGAACCTTCAGGAAGACCTTTAAGATGCTGCTTCTCTGCCGATGGAAAAAGAAAAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCTATGCCCTCTGCAACAGAACCTTCAGGAAGACCTTTAAGATGCTGCTTCTCTGCCGATGGAAAAAGAAAAAA  1554

Query 1555  GTGGAAGAGAAGTTGTACTGGCAGGGGAACAGCAAGCTACCC  1596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGGAAGAGAAGTTGTACTGGCAGGGGAACAGCAAGCTACCC  1596